近日清華大學研究人員發表了一篇關于RNA深度測序的最新研究論文,這篇文章主要解析了RNA深度測序分析方法。
新一代測序技術又稱作深度測序技術,主要特點是測序通量高,測序時間和成本顯著下降,把這種高通量測序技術應用到RNA上,也就是將各種類型的轉錄本用深度測序技術進行高通量定量檢測,統稱作RNA-seq或RNA測序。隨著新一代高通量DNA測序技術的快速發展,RNA測序(RNA-seq)已成為基因表達和轉錄組分析的重要手段。
RNA測序也是分析同一基因的基因亞型的有效方法,這種分析方法需要一些修訂模型,尤其是當RNA序列數據不是均勻分布的時候,該文章中提出了一種non-URD(N-URD)模型,可以用于推斷亞型表達水平,研究人員通過一系列的系統模擬研究,證明了這種模型超越了原始模型,能恢復主要亞型,分析可變亞型的表達比率。 之后研究人員進一步在RNA測序數據庫中應用了這一新模型,結果發現利用這一模型獲得的可變亞型表達比率的推論分析更加合理,這些都說明了N-URD模型能提高RNA測序中亞型表達建模和推論的精確性。
近年來隨著測序技術的不斷發展,測序服務的不斷完善,測序服務價格將大幅度的下降,比如今年,人類基因組測序服務的收費可能下降到每個基因組1000美元以下。隨著下一代測序機器投放市場,其基因組完全被測序的人數將飆升。(由三博遠志編輯)
本文轉自三博遠志業界新聞:http://www.sunbiotech.com.cn/news_view-id3197.htm
