目前，在對全球科學家開放的公共基因組數據庫中，約有1/5的植物、細菌、和非靈長類動物的基因組數據受到了人類基因不同程度的污染！

【污染來源：】

1、污染風險潛藏在每個測序環節，基因組數據被污染，很可能在樣品處理時就開始了。為了獲取足夠量的測序樣本，各實驗室首先會對極少量的被測物種基因進行擴增，方法之一是利用大腸桿菌等細菌對基因樣品做擴增培養。盡管培養要求在潔凈環境中進行，但倘若操作不當，作為培養基的細菌就有可能“趁隙”混入樣品。

2、 另一種被稱為“PCR”的核酸擴增技術完全依靠人工操作，污染來源更多：有可能是空氣中的細菌落到了樣品中，也可能是滅菌后仍殘留在試劑中的基因片段，但最常見的污染源可能是科學家自身，比如在擴增前，實驗者的一個細胞飄進了樣品里。雖說肉眼看不見，但人無時無刻不在散布自己的DNA，一個觸摸、一次呼吸都有可能破壞測序樣品的純度。

【解決方案：】

1、研究人員應該嚴格要求自己

事實上，污染可能在測序的任何一個環節發生。因此，研究人員戴手套、口罩進行實驗操作不僅是對自身的保護，也可避免樣品受到自身的污染?？扇绱撕唵蔚牟僮饕幊滩⑽幢辉S多實驗人員放在心上。當基因測序成為生命科學研究中的家常便飯，不少研究者的操作也變得隨意，不拘小節恰是潛伏在人們心中的污染源。

2、遞送者是截污的第一張“濾網”

無孔不入的細菌，懸浮于空氣中的唾沫星子，這些防不勝防的外源基因似乎意味著，基因測序不可能做到100%零污染。其實相當部分被污染的數據其實可以被過濾掉。在向公共基因組數據庫遞送數據之前，會將測序結果與計算機中龐大的數據庫做比對。過濾污染的過程就像是用軟件掃描，而遞送者最清楚整個過程中有可能插入的外源基因，由此選擇合適的“軟件”。嚴格的實驗設計可“堵截”部分污染。DNA由雙鏈組成，嚴謹的科學家會對兩鏈分別測序而后相互驗證。

如果首道過濾關口沒有把牢，那么隨后還有第二和第三張“濾網”。公共基因組數據庫管理者盡管面對呈幾何級數增長的海量數據，但始終有責任過濾并校正來自世界各國的原始數據，最起碼應標記污染，以提醒數據使用者當心“陷阱”。

3、能否借鑒古DNA研究規范

從采樣開始，古DNA研究就遵循一套嚴苛的流程——在發掘現場，一旦發現骨骼等樣本，研究人員必須立刻戴上手套、口罩和帽子，將樣本放入無菌樣本袋中，隨后帶回實驗室密封保存。接下來的DNA提取和測序，要在超凈化的萬級無菌實驗室進行。從樣本粗洗到鉆洞采樣，再到DNA抽取、配試劑等等，每一個步驟都要在完全獨立的房間內做，每做完一個樣本，都要進行空氣過濾和紫外線消毒。整個過程中，研究者都必須“全副武裝”，連眼睛也不能外露——要戴上透明眼罩。

不難想象，古DNA研究的“防污”策略是以高昂成本為代價的，而如此高成本，大規?；驕y序幾乎無力負擔。為此，更多人把目光投向了生物信息學家，希望他們能改進現在的基因組數據污染過濾系統，當好“治污”把關人。(由三博遠志編輯）

本文轉自三博遠志業界新聞：http://www.sunbiotech.com.cn/news_view-id3196.htm