精品│翌圣ZymeEditor打造超高文庫轉化率T4 DNA Ligase
建庫作為NGS測序的核心步驟,直接影響測序質量,文庫轉化率是評估文庫質量的重要指標,高的文庫轉化率一定程度上意味著文庫豐富度、測序數據均一性更好。常規T4 DNA Ligase催化DNA的 3’-OH 和接頭的5’-磷酸基團之間形成磷酸二酯鍵完成接頭連接,但此過程中會出現片段自連,從而減低文庫轉化率,影響文庫豐富度與測序質量。翌圣ZymeEditor?酶改造平臺對T4 DNA Ligase進行定向改造獲得Hieff? 5' App T4 DNA Ligase(Cat#14960ES),該突變體只能以預苷化接頭為底物進行接頭連接,顯著減少片段自連,提高文庫轉化率。

圖1. NGS常規建庫流程
產品特點
1、極低片段自連:只能以預腺苷化的接頭為底物,極大降低片段自連。
2、超高接頭連接效率:連接效率達95%以上。
3、嚴格質控:無切口酶、外切酶及RNase殘留。
數據展示

圖2. 以170 bp模式片段為底物連接效率檢測

圖3. 以300 bp模式片段為底物連接效率檢測

圖4. RNase殘留檢測 C:陰性對照
3、無切口酶及外切酶殘留
將200 U Hieff? 5' App T4 DNA ligase與底物DNA孵育,瓊脂糖凝膠電泳比較DNA譜帶變化。結果顯示翌圣Hieff? 5' App T4 DNA ligase無切口酶殘留。

圖5. 切口酶殘留檢測 C:陰性對照
將2000 U Hieff? 5' App T4 DNA ligase與底物DNA孵育,瓊脂糖凝膠電泳比較DNA譜帶變化。結果顯示翌圣Hieff? 5' App T4 DNA ligase無外切酶殘留。

圖6. 外切酶殘留檢測 C:陰性對照
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常規接頭連接 |
Hieff? Quick T4 DNA Ligase |
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預腺苷化接頭連接 |
Hieff? 5' App T4 DNA ligase |
14960ES |
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文庫擴增 |
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