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精品│翌圣ZymeEditor打造超高文庫轉化率T4 DNA Ligase

作者:翌圣生物科技(上海)股份有限公司 2023-06-20T12:33 (訪問量:16996)

精品│翌圣ZymeEditor打造超高文庫轉化率T4 DNA Ligase

建庫作為NGS測序的核心步驟,直接影響測序質量,文庫轉化率是評估文庫質量的重要指標,高的文庫轉化率一定程度上意味著文庫豐富度、測序數據均一性更好。常規T4 DNA Ligase催化DNA的 3’-OH 和接頭的5’-磷酸基團之間形成磷酸二酯鍵完成接頭連接,但此過程中會出現片段自連,從而減低文庫轉化率,影響文庫豐富度與測序質量。翌圣ZymeEditor?酶改造平臺對T4 DNA Ligase進行定向改造獲得Hieff? 5' App T4 DNA Ligase(Cat#14960ES),該突變體只能以預苷化接頭為底物進行接頭連接,顯著減少片段自連,提高文庫轉化率。

1. NGS常規建庫流程

產品特點

1、極低片段自連只能以預腺苷化的接頭為底物,極大降低片段自連。

2、超高接頭連接效率連接效率達95%以上。

3、嚴格質控無切口酶、外切酶及RNase殘留。

數據展示

1、連接效率達95%以上
以100ng 170bp和300bp的模式片段為底物,使用Hieff? 5' App T4 DNA ligase對合成的預腺苷化(App)接頭進行接頭連接,結果顯示連接效率達95%以上,且片段自連占比極低。

圖2. 以170 bp模式片段為底物連接效率檢測

3. 以300 bp模式片段為底物連接效率檢測

2、無RNase 殘留
將2000 U Hieff? 5' App T4 DNA ligase與底物RNA孵育,瓊脂糖凝膠電泳比較RNA譜帶變化。結果顯示翌圣Hieff? 5' App T4 DNA ligase無RNase殘留。

4. RNase殘留檢測 C:陰性對照

3、無切口酶及外切酶殘留

將200 U Hieff? 5' App T4 DNA ligase與底物DNA孵育,瓊脂糖凝膠電泳比較DNA譜帶變化。結果顯示翌圣Hieff? 5' App T4 DNA ligase無切口酶殘留。

5. 切口酶殘留檢測 C:陰性對照

將2000 U Hieff? 5' App T4 DNA ligase與底物DNA孵育,瓊脂糖凝膠電泳比較DNA譜帶變化。結果顯示翌圣Hieff? 5' App T4 DNA ligase無外切酶殘留。

6. 外切酶殘留檢測 C:陰性對照

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