啟動子—高效基因表達的鑰匙,別選錯了!?。?自主發布-資訊-生物在線

啟動子—高效基因表達的鑰匙,別選錯了!??!

作者:上海吉凱基因醫學科技股份有限公司 2021-06-07T16:21 (訪問量:25669)

確保外源基因在細胞或者動物體內,持續和高水平的表達具有廣泛的應用需求及科研價值。當前遞送外源基因的生物學手段,主要是運用質?;蛘卟《咀鳛槊浇楸磉_基因,而啟動子是實現基因表達的基礎元件。但是,經常有老師反饋,為什么基因表達不強呢?為什么細胞傳代幾次之后就不表達了呢?今天,小編帶您盤點下,常用的組成型啟動子表達效率與細胞的關系。


啟動子是位于結構基因上游的一段可以行使轉錄起始功能的序列,結構如下:


根據其對α-鵝膏蕈堿的敏感性不同,分為三類,常用的啟動子是Ⅱ、Ⅲ兩種啟動子。其中,Ⅲ型啟動子主要表達非編碼的短序列RNA,比如shRNA、miRNA等,我們常說的啟動子,或者細胞里面常規基因的啟動子,幾乎都是Ⅱ型啟動子,其特點是轉錄產物長度不限,編碼與否不限等特點。


酶的種類1

存在

功能

對抑制物的敏感性

RNA聚合酶I

核仁

合成rRNA前體

不敏感

RNA聚合酶II

核質

合成mRNA前體及大多數snRNA

敏感

RNA聚合酶III

核質

合成5S rRNA前體、tRNA前體及其他的核和胞質小RNA前體

存在物種特異性


Ⅱ型啟動子在使用特點上又可分為三大類:組成型啟動子、特異性啟動子、誘導啟動子。特異性啟動子只能在特定細胞表達,因此適合動物實驗使用;誘導啟動子需要加入特定的藥物才能激發或者抑制其活性,如四環素誘導TRE表達;而表達系統中,運用最多的則是組成型啟動子,這類啟動子在絕大部分細胞里面都能維持一定的表達活性,當然,不同的啟動子也有高低表達之分。


載體上最常見的組成型啟動子包含:β-肌動蛋白啟動子(ACTB),巨細胞病毒(CMV),延伸因子-1α(EF1α),磷酸甘油酸激酶(PGK)、泛素C(UbC、本文別名FCIV),具有CMV最大內含子的CMV啟動子/增強子(CMVi啟動子)、巨細胞病毒增強子和雞β-肌動蛋白啟動子組成的CAG,猿猴病毒來源的SV40等。其中,最常見的是CMV啟動子,在大量的商業化載體上如pcDNA3、pEGFP使用,病毒上最常見啟動子是CMV、EF1α,說明這些都是高表達啟動子,那么所有細胞系都合適嗎?小編收羅了不同文獻、不同細胞類型的驗證實驗,接著往下看:

混合細胞系

作者選了多種來源的細胞,包含成纖維細胞、腫瘤細胞、干細胞、高度分化的肌肉細胞等,使用六個哺乳動物組成型啟動子,每個都插入GFP包裝成慢病毒轉導細胞,通過流式細胞儀對GFP強度進行定量:

小鼠尾巴成纖維細胞(129TF),小鼠胚胎成纖維細胞(MEF),小鼠成肌細胞(C2C12),大鼠間充質干細胞(MSC),人成纖維細胞(MRC5),人纖維肉瘤細胞(HT1080),人胚胎腎細胞(293T)和恒河猴獼猴乳腺腫瘤細胞(CMMT)


結果表明:UBC跟PGK始終是弱的,SV40相對較強,EF1A和CAG啟動子在所有細胞類型中均具有較強的一致性,CMV啟動子是最多變的,是在一些細胞類型(很強烈例如,293T和CMMT)和其他(較弱例如,MRC5和MSC)。


由此看出,CMV在腫瘤細胞系傾向高表達,而EF1A和CAG在大部分細胞表達趨于穩定,且這三個高強度啟動子在干細胞等類型活性都有所下降。所以,針對常規的腫瘤細胞系,常規體細胞系,三個啟動子的效果還是不錯的,但由干細胞表達效果差,推導出非常規的細胞系,如懸浮細胞系、神經細胞等,啟動子如何選擇呢?

胚胎干細胞(hESCs)


干細胞相對復雜,因為還存在分化過程的干細胞,那么干細胞對于啟動子的選擇有何特點呢?


對hESCs中ACTB,CMV,EF1α,PGK和UbC啟動子的活性進行了比較研究。選擇慢病毒介導的基因轉移作為基因傳遞系統,通過FACS分選出了eGFP +細胞,結果如下:


1.未分化的hESCs的啟動子活性

在FACS分選后的15、30和50天測量啟動子活性,通過OCT3 / 4,NANOG和hES-Cellect(Cellartis AB)多能蛋白的標記證實了eGFP +細胞的多能性:

第0天,所有啟動子的eGFP+百分比約為98%,第30天,ACTB,EF1α和PGK的啟動子活性均相等,第50天,CMV-eGFP+細胞的百分比降低于10%,EF1α也出現下降。

2. 分化的hESCs中的啟動子活性


慢病毒介導GFP的將hESC系SA121,在第0天(d0),未分化狀態第22天(undiff),分化為胚狀體22天(EB),測試GFP +細胞的比例,結果顯示,啟動子在分化過程中被顯著下調,并且在大約50%的分化細胞中沒有活性。EF1α是分化過程中最穩定的啟動子;CMV啟動子僅在細胞的一小部分(約15%)具有活性。

總之,就長期保持未分化的hESCs的轉基因(eGFP)表達而言,ACTB,EF1α和PGK啟動子是最穩定的啟動子;而在分化過程中,成型啟動子的活性會下降,相對而言,EF1α啟動子具有最高的穩定性。原因即細胞在分化過程中,所表達的轉錄因子是有差異的,部分啟動子表達所需的轉錄因子丟失,同時染色體結構的改變影響了外源插入序列的狀態,導致啟動子出現沉默現象。

造血干細胞(HSC)/祖細胞


造血干細胞(HSC)具有自我更新和多譜系分化成所有成熟血細胞的潛力。因此,有效轉導至HSCs將提供治療因血細胞功能異常而導致的多種疾病的機會,并且將成為研究HSCs增殖,分化和運輸調節的有力工具。作者構建了攜帶多個啟動子表達熒光的腺病毒,感染兩種狀態的造血細胞,以流式檢測:

成熟CD34+ 成熟CD34+

免疫細胞

結果顯示:當用于造血細胞中時,CMV啟動子傾向于沉默。轉基因可能以非常低的水平表達或無法檢測。EF1α、CMVi和CAG啟動子在轉導人骨髓CD34+細胞方面表現優異。特別地,CAG啟動子在CD34+細胞和未成熟的CD34+亞群中最有效地發揮作用。


當前,以CAR-T和TCR-T為代表的細胞治療非?;馃?,前者都需要運用慢病毒感染T細胞。免疫類細胞,諸如T細胞,病毒感染難度較大,啟動子的選擇得注意。


作者構建多個啟動子的慢病毒載體表達熒光,感染經過IL-2刺激過的PBL細胞,以FACS檢測,觀察到CMV啟動子在原代T細胞驅動效率低,CAG也相對較差,其余幾個啟動子的效率相近,都在60%上下。

進一步以以抗CD3抗體OKT3刺激細胞,再進行實驗,活化后的T細胞,多個啟動子的表達效率得到增強,其中以MSCV啟動子最優。

在PBL中,發現含有MSCV啟動子的載體最適合,在最低程度刺激的淋巴細胞和高度活化的淋巴細胞中的表達。當然,文章沒有比較EF1α,實際后者在T細胞也有不俗的表達水平。


神經細胞

用CMV-GFP,PGK-GFP,MND-GFP和泛素C啟動子(FCIV)轉導了含有神經元和星形膠質細胞的小鼠新皮層培養物。轉導后四天,我們對神經元(NeuN陽性)進行檢測,在FCIV轉導的培養物中85%的神經元表達了GFP,PGK為55.2%,且大多數報告基因陽性細胞與NeuN共定位;而CMV為4.1%、MND為0.7%。且幾乎與NeuN染色的細胞不重疊,說明后兩者不適合神經元的表達。

以上述病毒轉導來自SH-SY5Y神經母細胞瘤細胞系,結果顯示:CMV,PGK和FCIV在未分化和分化的神經母細胞瘤細胞中均具有活性,但CMV啟動子活性最高,尤其是在分化后(小腦顆粒神經元顯示出相同的結果,數據見原文)。

對于涉及原代皮層神經元培養的研究,UBC和PGK啟動子可能是基因表達的最佳選擇。UBC,PGK,CMV和MND啟動子均適用于轉導原代星形膠質細胞。在小腦顆粒細胞和分化的SH-SY5Y神經母細胞瘤培養物中,CMV啟動子指導最穩定的轉基因表達。



總結

通過本文一系列細胞及使用啟動子的使用情況的整理,我們可以得出如下結論:


1.CMV啟動子作為最為廣泛使用的啟動子,適合在腫瘤細胞、肌肉、肝臟等體細胞或者貼壁細胞的表達,而不適合大多數干細胞、懸浮細胞及原代細胞的表達;


2.EF1α啟動子適合干細胞、原代細胞、造血細胞等的表達,在常用細胞如HEK293、腫瘤等細胞系中弱與CMV;


3.部分細胞在傳代過程中,外源啟動子會出現沉默現象,不同的啟動子沉默效率有所差異,對于少見的細胞系,或者會分化的細胞系,研究者需要考慮啟動子的選擇,或者多做些分組;


4.CAG啟動子在不少細胞系,諸如免疫細胞、體細胞,有不次于CMV的表達效率,也是基因表達的一個較優選擇的啟動子。


實際上,常用于表達外源基因的啟動子主語局限于CMV、EF1α、CAG、UBC等,本文涉及的PGK、SV40等主要用于表達熒光、抗性等,很多載體出現熒光弱等問題,可以看看表達熒光用的何種啟動子。當然,諸如懸浮細胞還可以使用SFFV等啟動子實現高表達(可參考吉凱基因懸浮病毒載體使用手冊)??傊瑔幼拥倪x擇對于基因的表達至關重要,吉凱也開發了更加高效表達的啟動子系列,對于基因表達弱,熒光弱的老師們,快來吉凱咨詢吧?。。?/span>

【參考文獻】

1.Systematic Comparison of Constitutive Promoters and the Doxycycline-Inducible Promoter

2.Quantitative Comparison of Constitutive Promoters in Human ES cells

3.Optimization of adenovirus serotype 35 vectors for efficient transduction in human hematopoietic progenitors: comparison of promoter activities

4.Optimal promoter usage for lentiviral vector-mediated transduction of cultured central nervous system cells

5.Lentiviral Vector Design for Optimal T Cell Receptor Gene Expression in the Transduction of Peripheral Blood Lymphocytes and Tumor-Infiltrating Lymphocytes


上海吉凱基因醫學科技股份有限公司 商家主頁

地 址: 上海市浦東新區張江高科技園區愛迪生路332號

聯系人:

電 話: 4006210302

傳 真:

Email:service@genechem.com.cn

相關咨詢
ADVERTISEMENT