近年來，蛋白質組+磷酸化蛋白質組聯合表現出強勁的增長勢頭。在Pubmed上不管是磷酸化蛋白質組，還是蛋白質組+磷酸化蛋白質組聯合的文章數量都在持續增加，且上升的趨勢同步。這也表明越來越多的研究者關注磷酸化的同時，也同時關注蛋白質組學水平的變化。Letpub數據顯示2021年國家自然基金批準的磷酸化研究突破了300項，總資助金額超過1.4億，其增長趨勢與文獻數增長趨勢也一致。蛋白質組研究的是蛋白表達變化，磷酸化蛋白質組研究的是蛋白的磷酸化修飾變化。兩組學聯合能解釋蛋白不同層面的信息，互為補充，為識別研究課題相關的磷酸化事件、關鍵信號通路和調控機制提供了一個全面的視角，有助于發現疾病靶點和生物標志物，輔助疾病的診斷與治療。
吉凱基因一直致力于提供專業的蛋白質組學服務，本次我們對蛋白質組+磷酸化蛋白質組聯合分析（以下簡稱聯合分析）進行了全面升級！產品詳情可點擊查看4.20日線上發布會視頻。
簡單來說，此次我們基于創新藥物靶點的科研與轉化需求以及高水平文章的生信分析內容進行了產品升級，新版報告具有4大核心看點，新增14項生信分析（累計基礎分析近30項）和3大高級服務，豐富度超過大多數同行！自2022年4月25日起，尚未進入生信分析的老合同（項目進展可查看吉凱推送的項目進展郵件）和新簽的蛋白質組+磷酸化蛋白質組聯合項目，即可享受全新升級分析，加量不加價！
新版聯合分析報告升級成網頁版，界面干凈、整潔。右側目錄欄幫助科研用戶快速知曉報告的主體內容，點擊主目錄可展開其子目錄，支持科研用戶隨心所欲切換到感興趣的條目上。新版報告內嵌了多重交互式體驗，比如增加浮動顯示窗，隱藏或展開分析結果，點擊下拉按鈕可切換分析結果以及網絡圖中的蛋白可任意拖動，讓整個報告更加人性化、個性化。
干凈整潔的報告界面
交互式的報告設計
2. 全面升級的生信分析：近30項基礎分析+3大高級服務
新版聯合分析報告包含3大分析模塊，對應從基礎到復雜的生信數據分析需求，幫助科研用戶由淺入深，循序漸進理解組學結果。此次新增venn、PCA、相關性分析、激酶-底物和弦圖以及激酶活性等14項分析，累計基礎分析達27項之多。同時為滿足科研用戶對激酶功能的深度科研需求，提供激酶樹、激酶抑制劑&藥物注釋服務和定制病毒等三大高級服務。
新版聯合分析基礎內容
3. 詳細的文獻注釋和圖表解釋：讓每一項分析都讀得懂，有據可依
新版聯合分析報告涉及高水平文獻37篇，讓整篇報告都有據可依。同時每一項分析都有明確的圖表說明和解釋，幫助科研用戶更好的理解和使用分析結果。
部分報告內容示例
4. 新增論文框架和投稿建議：想客戶所想，讓科研更輕松一點
如何利用組學結果進行深度的數據挖掘或者論文寫作呢？以及投稿期刊有哪些選擇呢？對此，新版聯合分析報告中增加了4大論文寫作框架及后續研究建議，以及提供一些組學期刊、綜合性期刊和醫學期刊，供科研用戶參考。
（1）兩組學整體結果展示：新增4項
高水平聯合文獻通常會對蛋白質組和磷酸化蛋白質組的檢測情況進行說明，包括展示兩組學總的鑒定數量、平均鑒定數量、重合情況、兩組學相關性、PCA分布特征等。因此，新版聯合分析報告新增了以下4項內容：
基本鑒定情況表
Venn分析
PCA分析
相關性分析
（2）兩組學差異結果展示：新增6項
高水平聯合文獻中除了對兩組學檢測情況進行說明外，還會對兩組學的差異結果進行描述，包括比較兩組學差異數量、差異重疊情況、差異火山圖以及GO/KEGG功能富集差異等。因此，新版聯合分析報告新增以下6項內容：
差異結果統計
火山圖對比
火山圖能夠直觀展示對比組間的差異分布情況。通過對比兩個組學的火山圖，幫助科研用戶分析在相同生理病理條件下實驗組與對照組在蛋白水平和磷酸化修飾水平的差異趨勢和分布。
TOP前15對比
KEGG通路富集差異
KEGG通路富集的分析可以幫助科研用戶進一步了解差異蛋白質/磷酸化蛋白質富集在哪些通路上，以便找到最受影響的通路。分析結果呈現方式與GO功能富集方式類似，因此此處不另外展示。
Venn分析
針對兩組學篩選到的差異蛋白進行Venn分析，直觀地展示兩組學同時定量到的差異蛋白數量以及各組學特異性定量到的差異蛋白數量，并對Venn結果進行GO/KEGG通路富集分析。分析結果呈現方式與前述Venn分析、GO/KEGG富集方式類似，因此此處不另外展示。
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