
鄭州大學袁寶銀、劉康棟老師團隊在Analytical Chemistry(IF:8.008)上發表題為“DNA Aptamer Selected against Esophageal Squamous Cell Carcinoma for Tissue Imaging and Targeted Therapy with Integrin β1 as a Molecular Target”的文章。在該研究中,研究團隊通過Cell-SELEX技術篩選出可以特異性識別ESCC細胞系的核酸適配體,且通過組織成像證明核酸適配體 A2可識別病人食管鱗癌組織,該團隊還通過Pull-down、質譜實驗(由吉凱基因提供技術服務)及siRNA干擾技術鑒定該aptamer結合的靶標為整合素β1。此外,該團隊通過構建A2-NA納米結構負載化療藥物阿霉素(Dox),實現了體外和體內靶腫瘤細胞的特異性殺傷。

研究結果
1.?利用Cell-SELEX技術篩選得到與靶細胞高親和力結合的核酸適配體
A2、A3、A4核酸適配體與靶細胞結合的解離常數均為納摩爾級別,三條核酸適配體均能夠結合在靶細胞的細胞膜上,核酸適配體A2能夠特異性識別病人食管鱗癌組織。


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【補充知識】:
SELEX技術即指數富集的配體系統進化技術(Systematic Evolution of Ligands by Exponential Enrichment,SELEX)。利用該技術可以從隨機單鏈核酸序列庫中篩選出特異性與靶物質高度親和的核酸適體(Aptamer)。Cell-SELEX技術是在SELEX技術基礎上,獲取能與特定靶細胞結合的適配體的方法。
2.?核酸適配體A2與靶細胞結合的分子靶標為整合素β1(Integrin β1)
利用流式細胞術初步驗證出核酸適配體A2與靶細胞結合的靶標為蛋白質,利用Pull-down實驗及質譜技術(由吉凱基因提供技術服務)、基因敲低實驗進一步驗證出A2結合靶標為Integrin β1。此外,通過分子對接技術準確地預測出A2與Integrin β1的具體結合位點。


3.?設計A2連接的DNA納米結構,實現化療藥物Dox的靶向遞送
利用HCR(雜交鏈式反應)原理,設計出A2連接的DNA納米結構,該納米結構能夠負載自身濃度100倍的Dox,并將其靶向遞送至靶腫瘤細胞中,降低化療藥物的毒副作用。


研究結論
(1)通過Cell-SELEX,篩選得到與低分化食管鱗癌KYSE410細胞高親和力高特異性結合的核酸適配體,其中核酸適配體A2能夠特異性成像患者食管鱗癌組織,有望作為一種特異性成像探針應用于食管鱗癌的診斷;
(2)經鑒定核酸適配體A2與靶細胞結合的主靶標為整合素β1,具備作為食管鱗癌標志物和治療靶點的潛力;
(3)以核酸適配體A2為靶向分子設計并構建了A2-NA納米結構,該納米結構能夠負載高濃度的Dox并將其特異性遞送至靶細胞,實現腫瘤的靶向治療。
吉凱助力
本研究使用質譜檢測核酸適配體A2結合的目標蛋白,由吉凱基因提供技術服務。

作者介紹

吉凱基因憑借多年在靶標篩選及驗證服務領域的技術積累,建立的標準化 、工程化 、系統化的GRP平臺,為中國研究型醫生提供科研服務,加快科研成果轉化。其中,多組學平臺包含蛋白質組學平臺和高通量測序平臺:
·蛋白質組學平臺擁有多臺timsTOF Pro、Exploris 480高精度質譜儀,專業的Spectronaut Plusar、Mascot等分析軟件,提供專業的4D、DIA、TMT、PRM、磷酸化修飾組、olink蛋白質組等檢測服務,強大的機器學習算法、IPA分析、蛋白基因組分析服務,系統的生物標志物、分子分型、藥物靶點、基因功能研究等解決方案,真正讓廣大研究型醫生的科研工作更省心、更省力、更高效;
·高通量測序平臺分為常規測序服務和單細胞測序服務:單細胞測序擁有10x和BD兩個平臺,提供單細胞RNA-seq、單細胞核測序、單細胞混樣RNA-seq、單細胞TCR/BCR、單細胞(RNA+ATAC)、空間轉錄組測序等服務;常規測序服務提供meRIP-seq(m6A/m1A/m7G/m5C 等RNA甲基化修飾測序)、acRIP-seq(ac4C RNA乙?;揎棞y序)、ATAC-seq、Ribo-seq(翻譯組測序) 、mRNA/miRNA/LncRNA/circRNA-seq、全轉錄組測序(兩文庫/三文庫)、外泌體miRNA/LncRNA-seq、WGS/WES、WGBS、RRBS、BSAS等服務。
