美國(guó)杰克遜實(shí)驗(yàn)室(JAX)的研究人員開發(fā)出一種新方法,通過(guò)對(duì)開放染色質(zhì)進(jìn)行全基因組分析,來(lái)確定導(dǎo)致既定類型白血病的細(xì)胞類型。這一方法對(duì)白血病的診療具有重要作用。相關(guān)研究11日發(fā)表在《自然—通訊》雜志上。
每種癌癥都始于一個(gè)單細(xì)胞的異變。知道了癌細(xì)胞的起源細(xì)胞,研究人員就可以分析出癌癥的亞型,進(jìn)而開發(fā)出新的診療手段,但現(xiàn)有方法很難從大量腫瘤細(xì)胞樣本中識(shí)別出其起源細(xì)胞。
染色質(zhì)是細(xì)胞核內(nèi)的重要成分,由DNA、組蛋白、RNA組成,在細(xì)胞進(jìn)行分裂的特定階段會(huì)聚縮成染色體。每種類型的細(xì)胞都有一個(gè)獨(dú)特的染色質(zhì)結(jié)構(gòu),封閉染色質(zhì)會(huì)緊緊纏繞在核小體周圍,相對(duì)不活躍;開放染色質(zhì)與核小體的聯(lián)系程度則相對(duì)松散,也更活躍。杰克遜實(shí)驗(yàn)室的助理教授珍妮弗·特羅布里奇博士通過(guò)分析腫瘤細(xì)胞中的開放染色質(zhì),改進(jìn)了目前識(shí)別腫瘤細(xì)胞的起源細(xì)胞的方法。
特羅布里奇帶領(lǐng)實(shí)驗(yàn)室同事構(gòu)建了一個(gè)急性髓系白血病(AML)的小鼠模型。他們從人類和小鼠的骨髓中找出5種細(xì)胞:長(zhǎng)期造血干細(xì)胞、短期造血干細(xì)胞、多能祖細(xì)胞、普通髓系祖細(xì)胞以及粒細(xì)胞巨噬細(xì)胞祖細(xì)胞。這些不同起源細(xì)胞引發(fā)的AML在小鼠身上顯示出不同的侵入性:干細(xì)胞引發(fā)的病變更具侵入性,而祖細(xì)胞引發(fā)的病變的侵入性則要小很多。不同侵入性誘發(fā)白血病細(xì)胞出現(xiàn)的頻率也有所不同:干細(xì)胞高,祖細(xì)胞低。
研究人員通過(guò)對(duì)不同AML細(xì)胞樣本的開放染色質(zhì)進(jìn)行分析,并與正常細(xì)胞中開放染色質(zhì)模式進(jìn)行對(duì)比,進(jìn)而確定了AML細(xì)胞樣本中開放染色質(zhì)的特征和基因表達(dá)模式,這使他們能將干細(xì)胞引發(fā)的AML與祖細(xì)胞引發(fā)的AML區(qū)別開來(lái)。
研究人員表示,通過(guò)對(duì)健康人群和AML患者群的干細(xì)胞和祖細(xì)胞的開放染色質(zhì)進(jìn)行進(jìn)一步研究,他們就可以基于細(xì)胞起源來(lái)確定更精確的癌癥生物標(biāo)志,這對(duì)于癌癥的診斷和治療具有重要意義
染色質(zhì)基因分析可識(shí)別癌癥起源:能確定白血病源頭細(xì)胞類型
作者:上海鈺博生物科技有限公司 2016-07-15T13:48 (訪問(wèn)量:7173)
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