SWATH（Sequential Window Acquisition of all THeoretical Mass Spectra）是瑞士蘇黎世聯邦理工學院的Ruedi Aebersold 博士及其團隊與AB-SCIEX聯合推出的一項全新的質譜技術。它的基本原理是：依靠4個桿間電場的變化來選擇離子。圖1中，第一個四級桿Q1選擇一定質荷比的離子，第二個四級桿Q2作為碰撞室，誘導碎片化反應，而后在質量飛行器TOF中掃描碎片離子。
SWATH 采集技術是一項突破性技術，它讓分析人員只需一次分析，就能同時對樣品中幾乎所有可檢測的化合物進行全面鑒定和定量分析 (MS/MSALL)。SWATH技術如今已廣泛用于蛋白質組學研究，現在還可以為食品檢測、環境分析、藥物開發、疾病診治、法醫檢測等其他領域的分析提供極大優勢。
SWATH 采集技術是一項突破性技術，它讓分析人員只需一次分析，就能同時對樣品中幾乎所有可檢測的化合物進行全面鑒定和定量分析 (MS/MSALL)。SWATH技術如今已廣泛用于蛋白質組學研究，現在還可以為食品檢測、環境分析、藥物開發、疾病診治、法醫檢測等其他領域的分析提供極大優勢。
食品檢測方面，可利用SWATH技術調查食品成分和產品是否符合質量和安全要求。根據要求，某些食品（例如嬰兒食品）中的農藥殘留不得超過 10 μg/kg，而水果或蔬菜等食品通常含有大量活性成分，可能很難進行分析。使用傳統的 LC-MS/MS 方法分析食品等復雜基質時，鑒定中可能會漏掉重要的微量殘留物。SWATH 采集技術可以完整調查到樣品中存在的每一種可檢測化學污染物，同時還能迅速、可靠地檢測到通常被樣品中的主要化合物掩蓋的微量化合物。
環境監測工作者的主要任務是鑒定水質、大氣等樣品中的各種有害化學物質。水質分析的難點在于物質濃度可能極低（在每升幾納克的范圍內），而且單個樣品可能包含數百種污染物。SWATH 技術可收集所有可檢測峰的超高質量 MS 和 MS/MS，從而對樣品中的化合物進行迅速、可靠的鑒定和定量分析。
開發生物治療藥物的過程中，宿主細胞蛋白質的表征和定量是一個重要階段。即使經過嚴格的凈化過程，最終產品中也可能出現少量宿主細胞蛋白質。傳統的分析方法（如 ELISA）無法全面檢測事先未知的 HCP（宿主細胞蛋白質）污染物，而依賴標準信息的 LC-MS 方法不具備以可重現方式檢測微量肽的靈敏度。相比之下，SWATH 采集技術是一種全面的檢測方法，可檢測樣品中極微量的肽，從而讓研究人員能夠生成對藥物開發研究至關重要的可重現數據。
在疾病診治方面，有研究者運用SWATH定量質譜技術比較研究了膝骨關節炎（KOA）、類風濕性關節炎（RA）以及半月板損傷患者關節滑液蛋白質譜的差異。結果表明，差異蛋白主要來源于細胞外基質、細胞膜、細胞質、分泌顆粒、脂蛋白復合物等成分；分子功能主要為酶活性、酶抑制劑活性、結合、轉運和調節活性等；主要參與對創傷的急性炎癥反應、補體的活化、免疫應答、對刺激的反應、細胞凋亡的調控、內穩態的維持等生物過程。尋找并初步明確KOA關節滑液中的特異性生物學標志，為該病的早期診治、療效監測和預后評估提供了可靠的、精準靈敏的參考指標。
對于法醫檢測，涉及對大量生物基質（如血液）中的藥物進行篩查和定量。這項檢測要求可靠的硬件、可重現的結果和高度靈敏的分析技術。SWATH 技術可通過一次進樣收集全面的 MS 數據和 MS/MS 數據，從而建立法醫樣品的數字檔案。這樣可以實現樣品的重復解析，而且不需要重復進行物理分析，也不需要花費大量資金和精力儲存樣品，還能節省時間。這種全面的解決方案還可以提供作為“呈堂證供”的高質量結果。
從傳統蛋白質組學工作流程到 SCIEX 獲得**的 SWATH 采集技術的過渡，已為蛋白質組學試驗帶來變革，讓研究人員能夠在超大型樣品組之間穩定高效地采集所有數據。隨著科學技術的發展，SWATH 采集技術以其定量分析的高準確性及重復性，將為更多研究領域帶來新的變革。