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教你發表外泌體高分文章的套路

作者:上海吉凱基因醫學科技股份有限公司 2019-08-08T15:38 (訪問量:7478)

教你發表外泌體高分文章的套路


臨床醫生朋友們,是否還苦于寫課題寫文章沒有好思路?Dr.S教你一招讓你吃遍天,前幾期我們介紹了肺癌、肝癌、胃癌的文章;今天我們解析一篇2016年發表在頂級雜志Cancer cell(IF=23.216分)上的文章,還是用我們經典的ABCD四要素模式來分析一下。同時教給大家如何發表與目前研究大熱—外泌體相關的文章。

關鍵詞:耐藥、外泌體、lncRNA、腎癌


直入主題,我們先解讀一下題目:
Exosome-Transmitted lncARSR Promotes SunitinibResistance in Renal Cancer by Acting as aCompeting Endogenous RNA

又是A基因通過B基因/信號通路C疾病中發揮D功能,今天就是要教你用這招4要素。

這是一篇經典的研究外泌體在腫瘤中發揮功能的文章,且聽Ds.S娓娓道來。



A基因、C疾病的由來:

C疾病:本文章的研究腫瘤為前腎癌,這完全取決于臨床醫生的所在領域。

A基因的由來:舒尼替尼是治療腎癌的有效藥物,但患者會產生耐藥性(非常經典的臨床問題出發點)。解釋耐藥機制和尋找到新的治療策略在臨床中具有非常的研究價值(臨床的重要意義)。lncARSR如何獲得?在小鼠模型中經過舒尼替尼處理通過尾靜脈獲取舒尼替尼耐藥的RCC細胞,然后進行lncRNAs芯片,最終通過RNAi實驗確定出與舒尼替尼耐藥相關的lncARSR(Fig1)。舒尼替尼治療的腎癌患者,獲取他們的血漿和組織檢測lncARSR的表達量并判斷其臨床價值(Fig2)。




Fig1


Fig2



D功能:


lncARSR在耐藥株細胞的外泌體表達。lncARSR被包入外泌體經過hnRNPA2B1介導(Fig2)。外泌體傳送的lncARSR參與了舒尼替尼的耐藥過程(Fig3)。



Fig2


Fig3


B分子機制----lncRNAceRNA機制

lncARSR位于外泌體,既lncARSR位于細胞胞漿內,位于胞漿內的lncRNAs一般發揮ceRNA的調控機制?;诖?,本文章則采用經典的ceRNA研究思路。(Fig4和Fig5)


Fig4


Fig5


Fig6

好了,又一個漂亮的故事誕生了,lncARSR通過競爭結合miR-34和miR-449導致AXL/c-MET的增加進而激活STAT3, AKT, and ERK 信號通路促進腎癌細胞對舒尼替尼的耐藥;同時,lncARSR可以被包被至外泌體傳遞至舒尼替尼敏感株,導致敏感株的耐藥(Fig6)。

現在大概了解如何用外泌體研究大概要怎么做了吧?那么如何搞定外泌體抽提和鑒定呢?我們也給大家準備好啦。想看的戳這里。


章解讀小結:

1. 要發表高分的SCI文章,ABCD模式一招鮮吃遍天,發現A基因(轉錄組測序或表達譜芯片),闡述其在C疾病中的D功能:細胞學功能和動物模型;以及B信號通路:分子機制(上游+下游)、功能恢復實驗。

2. 對于待研基因,闡述其在某種疾病中的功能:臨床相關性、細胞學功能、分子機制(上游+下游)、信號通路、功能恢復實驗、動物模型、實驗結論的臨床回顧,關鍵在于“新基因”—新疾病—新機制。

根據吉凱基因的經驗,從樣本出發芯片,測序,質譜方法高通量篩選新功能基因的概率大約在10%左右,想要篩選驗證得到一個新功能基因的難度非常大。吉凱基因歷經3年,斥資上億,已完成近6000個腫瘤相關基因的功能學篩選,從中找到明確的腫瘤功能標志基因若干,等待您來尋寶~~~



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