隨著質譜技術的快速發展，翻譯后修飾蛋白質組學技術應用越來越廣泛，比如在腫瘤臨床診斷及機制研究、藥理藥靶、衰老、感染免疫、脅迫等等諸多方面，相關研究也呈現爆發式的增長。2020-2021年，在Cell、Nature、Science三大頂級期刊上發表的修飾組學相關的文章就多達數十篇，小編整理了部分文章，與大家分享。 01 腫瘤分型與發病機制 研究方向：肺腺癌分子分型和生物標志物篩選 題目：A proteogenomic portrait of lung squamous cell carcinoma 發表期刊：Cell 發表時間：2021.08.05 樣本：人肺腺癌組織 組學技術：基因組、轉錄組、蛋白組、磷酸化修飾蛋白組、乙?；揎椀鞍捉M、泛素化修飾蛋白組 主要內容：搜集108例未經治療的原發性肺鱗狀細胞癌的腫瘤組織和癌旁組織進行蛋白基因組學分析?；诙嘟M學數據進行單組和多組無監督聚類分析，獲得五種不同的鱗狀細胞癌亞型，并發現了多個潛在的精準治療的新靶點。翻譯后修飾層面的研究表明磷酸化、泛素化和乙酰化三種修飾之間的Crosstalk調控腫瘤代謝。 研究方向：小兒腦癌分子分型和發病機制研究 題目：Integrated Proteogenomic Characterization across Major Histological Types of Pediatric Brain Cancer 發表期刊：Cell 發表時間：2020.11.25 樣本：小兒腦癌臨床組織樣本 組學技術：基因組、轉錄組、蛋白質組、磷酸化蛋白質組、靶向蛋白質組 主要內容：采用多組學聯合的方法對7種組織，共218例小兒腦癌臨床樣本進行研究。通過整合蛋白基因組數據揭示了不同于小兒腦癌組織學診斷的新的分型，為疾病治療提供了新的思路。有趣的是，激酶（AKT1）在RNA和蛋白質水平沒有顯著變化，而磷酸化水平顯著上調，提示了磷酸化蛋白質組學數據的重要性。 研究方向：乳腺癌分子分型、發病機制和代謝調控網絡研究 題目：Proteogenomic Landscape of Breast Cancer Tumorigenesis and Targeted Therapy 發表期刊：Cell 發表時間：2020.11.18 樣本：人乳腺癌組織 組學技術：基因組、轉錄組、蛋白組、磷酸化修飾蛋白組、乙?；揎椀鞍捉M 主要結論：整合多組學數據，分析122例原發性乳腺癌臨床樣本，對乳腺癌進行了分子分型分析。磷酸蛋白質組學研究可揭示腫瘤抑制因子丟失和靶向激酶之間的新聯系。乙?；鞍踪|組分析突出了參與DNA損傷反應的關鍵核蛋白的乙?；饔?，揭示了細胞質和線粒體乙?；?、代謝之間的相互作用。 研究方向：腫瘤機制機理研究 題目：Fat1 deletion promotes hybrid EMT state, tumour stemness and metastasis 發表期刊：Nature 發表時間：2020.12.16 樣本：小鼠腫瘤組織 組學技術：轉錄組、磷酸化蛋白質組 主要內容：該研究利用皮膚鱗狀細胞癌和肺腫瘤的小鼠模型，分析了FAT1基因的缺失會加速腫瘤的發生和惡性進展，并促進上皮到間質的混合轉變（EMT）表型變化。通過轉錄組學，磷酸化labelfree蛋白質組學進行調控機制研究，揭示了Fat1缺失會激活CAMK2-CD44-SRC軸，刺激間質狀態的ZEB1表達，這種喪失也能使EZH2失活，促進負責維持上皮狀態的SOX2表達。這個研究對于個體化的藥物治療，以及 FAT1 突變癌癥患者的預后具有重要意義。 02 神經生理及退行性疾病 研究方向：衰老 題目：Rewiring of the ubiquitinated proteome determines ageing in C. elegans 發表期刊：Nature 發表時間：2021.07.28 物種：線蟲 組學技術：泛素化修飾組 主要內容：通過建立線蟲中的泛素化蛋白質圖譜揭開全蛋白質組水平的泛素化動力學特征對于衰老的影響。研究發現隨著衰老的進行機體中出現了廣泛的去泛素化過程，這會損害蛋白酶體靶點蛋白的清除，從而揭開了衰老過程中的泛素化修飾的動態變化圖譜，為延長人類的壽命、健康變老這一研究提供了新的見解。 研究方向：晝夜節律 題目：Circadian rhythms in the absence of the clock gene Bmal1 發表期刊：Science 發表時間：2020.02.14 樣本：小鼠皮膚成纖維組織、肝組織 組學技術：轉錄組、蛋白質組、磷酸化蛋白質組 主要內容：在機體中廣泛存在的Bmal1基因被認為能作為機體主要的分子計時器的關鍵部分，但本研究發現，在Bmal1基因敲除小鼠中，在沒有任何外源性驅動因素影響的情況下，轉錄組、蛋白質組和磷酸化蛋白質組的結果顯示組織樣本呈現24小時振蕩（晝夜節律反應），并持續2-3天。這表明Bmal1敲除個體中有其他調控24小時節律的分子機器，進一步揭示影響晝夜節律的所有特定分子機制對于開發靶向作用健康組織的新型療法至關重要。 03 病原微生物感染 研究方向：感染與免疫 題目：The Global Phosphorylation Landscape of SARS-CoV-2 Infection 發表期刊：Nature 發表時間：2020.06.28 物種：非洲綠猴腎細胞 組學技術：蛋白質組、磷酸化蛋白質組 主要內容：該研究使用新冠病毒SARS-CoV-2侵染Vero E6細胞為模型，選擇多個侵染的時間點，通過蛋白組學和磷酸化蛋白組學系統解析了新冠病毒侵染細胞的過程，結果顯示磷酸化修飾在迅速侵染過程中有更為重要的作用，并發現了新的針對異常磷酸化通路的潛在候選藥物。 04 脅迫響應 研究方向：熱激響應 題目：Ubiquitination is essential for recovery of cellular activities after heat shock 發表期刊：Science 發表時間：2021.06.25 物種：人胚腎細胞 組學技術：泛素化修飾組 主要內容：該研究通過對不同脅迫處理后的細胞中泛素化組學的大規模分析，發現不同的脅迫處理會引起不同泛素化修飾的改變。研究人員重點對熱應激誘導的泛素化修飾進行了深度分析。研究發現泛素化修飾是細胞從多種熱應激誘導的細胞脅迫中恢復所必需的，其中包括mRNP重構的逆轉、應激顆粒的解聚、核質運輸功能以及蛋白質合成的恢復。該工作建立了新穎的泛素化組學的鑒定方法，揭開了泛素化修飾在細胞響應不同脅迫過程中大規模蛋白質組學的變化。 05 植物發育與抗逆 研究方向：植物生長發育與脅迫 題目：The calcium-permeable channel OSCA1.3 regulates plant stomatal immunity 發表期刊：Nature 發表時間：2020.08.26 物種：擬南芥 組學技術：蛋白質組、磷酸化蛋白質組、基因組 主要內容：該研究通過生化和定量磷酸化蛋白質組學發現在用細菌鞭毛蛋白衍生肽PAMP flg22處理后的幾分鐘內，免疫受體相關胞質激酶BIK1便與OSCA1.3 N末端胞質環相互作用并使其磷酸化。遺傳和電生理數據表明，OSCA1.3是Ca2+滲透通道，而BIK1介導的其N端磷酸化可增加該通道的活性。重要的是，OSCA1.3及由BIK1介導的磷酸化對于免疫過程中氣孔關閉至關重要。因此，該研究確定了植物普遍存在的Ca2+通道及其在免疫信號傳遞時導致氣孔關閉的激活機制，并揭示了Ca2+內流機制對不同脅迫響應的特異性。 研究方向：植物蛋白譜圖繪制 題目：Mass-spectrometry-based draft of the Arabidopsis proteome 發表期刊：Nature 發表時間：2020.03.11 物種：擬南芥花序和種子樣品、細胞培養和愈傷組織樣本、葉和根樣本 組學技術：轉錄組、蛋白質組、磷酸化蛋白質組 主要內容：研究者對擬南芥的30種組織進行蛋白質組、磷酸化修飾組以及轉錄組的定量分析，系統地揭示了蛋白質復合體的組織特異性和磷酸化調控的信號通路，是目前擬南芥蛋白質表達豐度與磷酸化翻譯后修飾最為系統全面的研究，為其它植物的發育與逆境應答過程奠定了基礎。
中科優品推薦
【中科新生命】攜全新一代4D-修飾蛋白質組，更微量樣本獲得更高深度的數據，修飾富集采用金標抗體保駕護航?，F還有超值千萬級補貼優惠！單個樣本補貼上千元！歡迎感興趣的老師前來咨詢！
“飾”寵而“焦”| CNS爆發，修飾組學頂刊合集速遞
作者：上海中科新生命生物科技有限公司 2021-12-23T18:28 (訪問量:4377)
上海中科新生命生物科技有限公司 商家主頁
地 址： 上海市園美路58號1號樓15-18樓
聯系人： 徐
電 話： 021-54665263
傳 真：
Email：marketing@aptbiotech.com
相關咨詢
會議邀請 | 第8屆全國植物蛋白質研究大會暨首屆貴陽生命科學新高地科學家論壇 (2023-07-07T14:37 瀏覽數:32372)
項目文章Cell（IF 64.5）| 中國科技大學探索食物過敏謎團 (2023-07-07T14:22 瀏覽數:33575)
Gastroenterology（IF 29.4）| 基于機器學習算法開發的外泌體miRNA生物標志物用于胰腺導管腺癌早期診斷 (2023-07-05T15:54 瀏覽數:30999)
Cancer Letters（IF 9.7）|天津市環湖醫院利用Labelfree揭示超聲-替莫唑胺聯合誘導膠質瘤細胞的凋亡機制 (2023-06-30T09:37 瀏覽數:31986)
Excel表免費下載 | 速來圍觀！2023年影響因子發布 (2023-06-29T09:35 瀏覽數:26866)
外泌體多組學創新解決方案，精準、前沿的疾病診斷生物標志物 (2023-06-28T10:20 瀏覽數:36309)
Immunity （IF=43.474）丨單細胞+空間聯合揭示肉芽腫形成的異常淋巴發育進程 (2023-06-26T17:28 瀏覽數:30634)
專家齊聚 亮點回顧 | 2023年?？凇ぶ嗅t藥創新多組學研究論壇圓滿落幕 (2023-06-25T10:10 瀏覽數:35007)
項目文章Plant J（IF 7）| 杭州師范大學王慧中團隊通過空間代謝+單細胞測序等揭示紅豆杉幼莖細胞特異的紫杉烷合成調控模式 (2023-06-25T09:42 瀏覽數:33068)
項目文章Gut Microbes（IF 9.434）| 腸道微生物竟是導致膽囊切除術后患者腹瀉的元兇？ (2023-06-14T16:35 瀏覽數:29953)