在單細胞測序技術蓬勃發展的當下，許多研究者在完成單細胞測序后，常常面臨一個棘手的問題：如何進一步推進實驗？為了深入挖掘單細胞測序結果背后隱藏的生物學意義，研究者們常常需要借助多種技術手段來搭配單細胞測序。
但搭配技術的選擇至關重要：
1、單細胞測序+空間轉錄組：雖然兩者數據容易匹配，但對于組織細胞的研究自始至終都只有轉錄本的信息，在多組學聯合的趨勢下往往還需要增加蛋白水平的驗證；
2、單細胞測序+空間轉錄組+流式/多重熒光：整體豐富度雖然提高，但是整體周期和價格較貴，經費壓力巨大。同時每多一個技術，數據的分析難度都會增加。
那么有沒有一項技術，既可以表征“空間”信息，又可以從“蛋白”層面驗證，同時還可以以“單細胞”水平觀測組織樣本呢？
PhenoCycler-Fusion（原CODEX）：單細胞測序后的“黃金拍檔”
優勢1：空間定位——讓單細胞數據回歸組織原位
技術亮點：
①超高分辨率（單細胞級）空間蛋白組，精準映射細胞亞群在組織中的位置（如腫瘤-免疫邊界、干細胞生態位）；
②支持100+蛋白標記同時檢測，覆蓋關鍵功能蛋白（如PD-1/PD-L1、細胞周期標志物）。
對比空間轉錄組：
①空間轉錄組（如10x Visium）僅提供RNA空間信息，無法直接關聯蛋白活性；
②PCF通過蛋白標記直接驗證單細胞測序中發現的差異基因通路（如EMT、代謝重編程）。
優勢2：蛋白驗證——彌補RNA與蛋白表達的不一致性
技術亮點：
①直接檢測蛋白表達水平，規避RNA與蛋白表達脫節（如轉錄后調控導致的差異）；
②可篩選出單細胞測序中“假陽性”標志物，提升后續研究可靠性。
對比傳統蛋白驗證：
①流式/免疫組化需預先猜測目標蛋白，通量低且無法空間定位；
②PCF一次性檢測幾十種蛋白，無需假設驅動。
優勢3：成本與效率——多組學整合的“輕量化方案”
技術亮點：
①單張組織切片即可完成實驗，樣本需求量低；
②數據可直接與單細胞轉錄組對齊（如通過細胞類型特異性蛋白標記）。
對比多技術組合：
①傳統“單細胞+空間轉錄組+流式”需多次實驗，成本增加2-3倍；
②PCF通過單次實驗獲得空間+蛋白數據，節省時間與經費。
“單細胞測序不是終點，而是探索的起點！
PCF以一項技術、雙重價值，助您將RNA異質性轉化為空間-蛋白維度的功能洞察，省去多平臺聯用的繁瑣與成本，讓數據閉環一步到位。”