相信不少同學有同樣的困惑,信號通路如何快速選擇呢?
Let’s 分析
基礎版
方法一:根據已知表型,查閱文獻及數據庫,從中篩選出與之關聯的信號通路,將其列為候選對象。(缺點:文獻中的差異,在自己實驗中很可能沒有變化)
方法二:針對已知表型,對樣本進行轉錄組或蛋白組檢測,再借助富集分析手段,以此確定候選信號通路。(缺點:RNA和蛋白表達的變化和信號通路的磷酸化變化不搭噶)
方法三:當表型尚不明確時,對樣本進行磷酸化蛋白組檢測,隨后通過激酶底物預測分析,明確表型信息及對應的信號通路。(缺點:雜的信息實在太多了,而分析結果總是圍繞經典的幾個激酶)
高階版
信號通路研究主要是針對磷酸化變化進行研究,基礎版方法最大的問題就是無法直達痛點,尤其面對多條信號通路的時候,很可能左右為難,束手無策。
高階選手如何快速選擇信號通路呢?
那就不得不提磷酸化抗體芯片啦!
信號通路磷酸化廣譜篩選抗體芯片(PEX100):采用三維高分子膜專用技術,在片基上高密度結合 1318 種高特異抗體,分別檢測432個信號蛋白的679個磷酸化位點。這些信號蛋白廣泛參與多條重要信號通路信號傳導過程。芯片針對每一個特定蛋白磷酸化位點,設置一對抗體分別檢測其磷酸化(Phospho)和非磷酸化(non-Phospho)狀態以提高磷酸化檢測靈敏度和穩定性。一次芯片實驗即可實現30多條信號通路的同步篩選和具體調變位點的清晰定位。
抗體芯片特點
● 芯片規格為76 x 25 x 1 mm;
● 實現31條信號通路全面篩選;
● 每種抗體設置2次技術重復;
● 適用于組織、細胞等多類型樣本;
● 5 x106細胞、100μg總蛋白量即可滿足實驗;
● 每個檢測位點設有磷酸化和非磷酸化配對抗體;
● 可通用于人、小鼠、大鼠等多類型模式生物檢測。
抗體芯片原理
Let’s 案例展示
PEX100芯片協助發現抵抗STING(干擾素基因刺激蛋白)激動劑療法的分子機制
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該研究者借助華盈生物提供的PEX100信號通路磷酸化抗體芯片技術服務,系統解析了TLR2激活對STING下游JAK-STAT和NF-κB通路磷酸化水平的調控,為機制闡釋提供了關鍵證據。這一發現為克服STING激動劑治療抵抗提供了新思路,具有重要的轉化價值。
忽然發現,國內大牛發的高分文章都在用PEX100信號通路磷酸化抗體芯片呢,上文獻:
1. Song H, Chen L, Pan X, et al. Targeting tumor monocyte-intrinsic PD-L1 by rewiring STING signaling and enhancing STING agonist therapy. Cancer Cell. 2025;43(3):503-518.e10.(復旦大學附屬華山醫院 細胞)IF=44.5
2. Wang Y, Wang Z, Dong C, et al. Initial cardioplegic flush with crystalloid cardioplegia improves donor heart preservation and function via NR4A3 upregulation and metabolic reprogramming. Sci Bull (Beijing). 2025;70(10):1673-1690.(華中科技大學附屬同濟醫院 心肌組織)IF=21.1
3. Fang Z, Zhao G, Zhao S, et al. GTF2H4 regulates partial EndMT via NF-κB activation through NCOA3 phosphorylation in ischemic diseases. Innovation (Camb). 2024; 5(2):100565.(復旦大學附屬中山醫院 細胞)IF=25.7
4. Sun Z, Zhou Y, Li L, et al. Inhibiting redox-mediated endothelial migration by gadofullerenes for inducing tumor vascular normalization and improving chemotherapy. Sci Bull (Beijing). 2023; S2095-9273(23)00414-0.(中科院分子納米結構與納米技術重點實驗室 腫瘤組織)IF=21.1
5. Fu L, Li P, Zhu J, et al. Tetrahedral framework nucleic acids promote the biological functions and related mechanism of synovium-derived mesenchymal stem cells and show improved articular cartilage regeneration activity in situ. Bioact Mater. 2021; 9:411-427.(南開大學醫學院 細胞)IF=20.3
6. Long H, Yu W, Yu S, et al. Progesterone affects clinic oocyte yields by coordinating with follicle stimulating hormone via PI3K/AKT and MAPK pathways. J Adv Res, 2021; 33: 189-199.(上海交通大學第九人民醫院 細胞)IF=13.0
7. He D, Wu HG, Xiang JN, et al. Gut stem cell aging is driven by mTORC1 via a p38 MAPK-p53 pathway. Nat Commun. 2020; 11(1):37.(華中科技大學附屬同濟醫院 小腸組織)IF=15.7
8. Yin LM, Xu YD, Peng LL, et al. Transgelin-2 as a therapeutic target for asthmatic pulmonary resistance. Sci Transl Med. 2018; 10(427):eaam8604.(上海中醫藥大學附屬岳陽醫院 細胞)IF=14.6
9. Jiang HL, Sun HF, Gao SP, et al. SSBP1 uppresses TGF-β-Driven Epithelial-to-Mesenchymal Transition and Metastasis in Triple-Negative Breast Cancer by Regulating Mitochondrial Retrograde Signaling, Cancer Res. 2016; 76(4):952-64.(復旦大學附屬腫瘤醫院 腫瘤組織)IF=16.6
10. Jia DS, Jing Y, Zhang ZF, et al. Amplification of MPZL1/PZR promotes tumor cell migration through Src-mediated phosphorylation of cortactin in hepatocellular carcinoma. Cell Res. 2014; 24(2):204.(復旦大學附屬腫瘤醫院 腫瘤組織)IF=25.9
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