相信不少同學(xué)有同樣的困惑，信號(hào)通路如何快速選擇呢？
Let’s 分析
基礎(chǔ)版
方法一：根據(jù)已知表型，查閱文獻(xiàn)及數(shù)據(jù)庫(kù)，從中篩選出與之關(guān)聯(lián)的信號(hào)通路，將其列為候選對(duì)象。（缺點(diǎn)：文獻(xiàn)中的差異，在自己實(shí)驗(yàn)中很可能沒(méi)有變化）
方法二：針對(duì)已知表型，對(duì)樣本進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組或蛋白組檢測(cè)，再借助富集分析手段，以此確定候選信號(hào)通路。（缺點(diǎn)：RNA和蛋白表達(dá)的變化和信號(hào)通路的磷酸化變化不搭噶）
方法三：當(dāng)表型尚不明確時(shí)，對(duì)樣本進(jìn)行磷酸化蛋白組檢測(cè)，隨后通過(guò)激酶底物預(yù)測(cè)分析，明確表型信息及對(duì)應(yīng)的信號(hào)通路。（缺點(diǎn)：雜的信息實(shí)在太多了，而分析結(jié)果總是圍繞經(jīng)典的幾個(gè)激酶）
高階版
信號(hào)通路研究主要是針對(duì)磷酸化變化進(jìn)行研究，基礎(chǔ)版方法最大的問(wèn)題就是無(wú)法直達(dá)痛點(diǎn)，尤其面對(duì)多條信號(hào)通路的時(shí)候，很可能左右為難，束手無(wú)策。
高階選手如何快速選擇信號(hào)通路呢？
那就不得不提磷酸化抗體芯片啦！
信號(hào)通路磷酸化廣譜篩選抗體芯片（PEX100）：采用三維高分子膜專用技術(shù)，在片基上高密度結(jié)合 1318 種高特異抗體，分別檢測(cè)432個(gè)信號(hào)蛋白的679個(gè)磷酸化位點(diǎn)。這些信號(hào)蛋白廣泛參與多條重要信號(hào)通路信號(hào)傳導(dǎo)過(guò)程。芯片針對(duì)每一個(gè)特定蛋白磷酸化位點(diǎn)，設(shè)置一對(duì)抗體分別檢測(cè)其磷酸化（Phospho）和非磷酸化（non-Phospho）狀態(tài)以提高磷酸化檢測(cè)靈敏度和穩(wěn)定性。一次芯片實(shí)驗(yàn)即可實(shí)現(xiàn)30多條信號(hào)通路的同步篩選和具體調(diào)變位點(diǎn)的清晰定位。
抗體芯片特點(diǎn)
● 芯片規(guī)格為76 x 25 x 1 mm；
● 實(shí)現(xiàn)31條信號(hào)通路全面篩選；
● 每種抗體設(shè)置2次技術(shù)重復(fù)；
● 適用于組織、細(xì)胞等多類型樣本；
● 5 x106細(xì)胞、100μg總蛋白量即可滿足實(shí)驗(yàn)；
● 每個(gè)檢測(cè)位點(diǎn)設(shè)有磷酸化和非磷酸化配對(duì)抗體；
● 可通用于人、小鼠、大鼠等多類型模式生物檢測(cè)。
抗體芯片原理
Let’s 案例展示
PEX100芯片協(xié)助發(fā)現(xiàn)抵抗STING（干擾素基因刺激蛋白）激動(dòng)劑療法的分子機(jī)制
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該研究者借助華盈生物提供的PEX100信號(hào)通路磷酸化抗體芯片技術(shù)服務(wù)，系統(tǒng)解析了TLR2激活對(duì)STING下游JAK-STAT和NF-κB通路磷酸化水平的調(diào)控，為機(jī)制闡釋提供了關(guān)鍵證據(jù)。這一發(fā)現(xiàn)為克服STING激動(dòng)劑治療抵抗提供了新思路，具有重要的轉(zhuǎn)化價(jià)值。
忽然發(fā)現(xiàn)，國(guó)內(nèi)大牛發(fā)的高分文章都在用PEX100信號(hào)通路磷酸化抗體芯片呢，上文獻(xiàn)：
1. Song H, Chen L, Pan X, et al. Targeting tumor monocyte-intrinsic PD-L1 by rewiring STING signaling and enhancing STING agonist therapy. Cancer Cell. 2025;43(3):503-518.e10.（復(fù)旦大學(xué)附屬華山醫(yī)院 細(xì)胞）IF=44.5
2. Wang Y, Wang Z, Dong C, et al. Initial cardioplegic flush with crystalloid cardioplegia improves donor heart preservation and function via NR4A3 upregulation and metabolic reprogramming. Sci Bull (Beijing). 2025;70(10):1673-1690.（華中科技大學(xué)附屬同濟(jì)醫(yī)院 心肌組織）IF=21.1
3. Fang Z, Zhao G, Zhao S, et al. GTF2H4 regulates partial EndMT via NF-κB activation through NCOA3 phosphorylation in ischemic diseases. Innovation (Camb). 2024; 5(2):100565.（復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院 細(xì)胞）IF=25.7
4. Sun Z, Zhou Y, Li L, et al. Inhibiting redox-mediated endothelial migration by gadofullerenes for inducing tumor vascular normalization and improving chemotherapy. Sci Bull (Beijing). 2023; S2095-9273(23)00414-0.（中科院分子納米結(jié)構(gòu)與納米技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 腫瘤組織）IF=21.1
5. Fu L, Li P, Zhu J, et al. Tetrahedral framework nucleic acids promote the biological functions and related mechanism of synovium-derived mesenchymal stem cells and show improved articular cartilage regeneration activity in situ. Bioact Mater. 2021; 9:411-427.（南開(kāi)大學(xué)醫(yī)學(xué)院 細(xì)胞）IF=20.3
6. Long H, Yu W, Yu S, et al. Progesterone affects clinic oocyte yields by coordinating with follicle stimulating hormone via PI3K/AKT and MAPK pathways. J Adv Res, 2021; 33: 189-199.（上海交通大學(xué)第九人民醫(yī)院 細(xì)胞）IF=13.0
7. He D, Wu HG, Xiang JN, et al. Gut stem cell aging is driven by mTORC1 via a p38 MAPK-p53 pathway. Nat Commun. 2020; 11(1):37.（華中科技大學(xué)附屬同濟(jì)醫(yī)院 小腸組織）IF=15.7
8. Yin LM, Xu YD, Peng LL, et al. Transgelin-2 as a therapeutic target for asthmatic pulmonary resistance. Sci Transl Med. 2018; 10(427):eaam8604.（上海中醫(yī)藥大學(xué)附屬岳陽(yáng)醫(yī)院 細(xì)胞）IF=14.6
9. Jiang HL, Sun HF, Gao SP, et al. SSBP1 uppresses TGF-β-Driven Epithelial-to-Mesenchymal Transition and Metastasis in Triple-Negative Breast Cancer by Regulating Mitochondrial Retrograde Signaling, Cancer Res. 2016; 76(4):952-64.（復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院 腫瘤組織）IF=16.6
10. Jia DS, Jing Y, Zhang ZF, et al. Amplification of MPZL1/PZR promotes tumor cell migration through Src-mediated phosphorylation of cortactin in hepatocellular carcinoma. Cell Res. 2014; 24(2):204.（復(fù)旦大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院 腫瘤組織）IF=25.9
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