土壤代謝組
土壤是自然界最復(fù)雜的生態(tài)系統(tǒng)之一，是多介質(zhì)相互作用的復(fù)雜環(huán)境，具有過(guò)程多樣性和各向分異性特征。采用非靶向代謝組學(xué)方法對(duì)土壤中的小分子代謝譜進(jìn)行分析，具有高通量、高靈敏度的特點(diǎn)，同時(shí)也可結(jié)合土壤微生物組高通量測(cè)序等多組學(xué)手段，有助于研究從微生物群落結(jié)構(gòu)和功能到代謝途徑的變化。
土壤代謝物來(lái)源
（1）土壤微生物對(duì)于環(huán)境中物質(zhì)如有機(jī)質(zhì)的代謝分解
（2）土壤中的植物根系分泌物
（3）土壤微生物本身的內(nèi)源性代謝物
（4）外來(lái)污染物
土壤代謝組應(yīng)用領(lǐng)域
土壤代謝組研發(fā)實(shí)測(cè)數(shù)據(jù)
· 實(shí)驗(yàn)流程：
· 鑒定數(shù)目：380+
· 檢測(cè)結(jié)果中代謝物分類(lèi)歸屬信息：
（注：不同類(lèi)型土壤的檢測(cè)結(jié)果差異較大）
· 代謝物實(shí)測(cè)結(jié)果示例：
土壤多組學(xué)經(jīng)典研究案例
New insights into the responses of soil microorganisms to polycyclic aromatic hydrocarbon stress by combining enzyme activity and sequencing analysis with metabolomics
Environmental Pollution IF= 6.792
· 背景：
多環(huán)芳烴 (PAHs) 是土壤中普遍存在的污染物，主要是由化石燃料或其他有機(jī)物質(zhì)的不完全燃燒排放產(chǎn)生的，多環(huán)芳烴污染會(huì)擾亂土壤生態(tài)環(huán)境，對(duì)土壤生物和人類(lèi)造成嚴(yán)重的致癌、致畸和致突變風(fēng)險(xiǎn)，從而極大地限制了土壤利用。微生物是評(píng)價(jià)土壤健康的重要指標(biāo)。作者通過(guò)比較高濃度PAHs污染后的土壤中的微生物的種類(lèi)和豐富、土壤代謝物的區(qū)別，去探究土壤質(zhì)量和污染物之間的聯(lián)系。
· 主要實(shí)驗(yàn)方法：非靶向代謝組學(xué) & 16S高通量測(cè)序
· 主要結(jié)論：
(1) 多環(huán)芳烴脅迫處理組ST和對(duì)照組CK土壤中微生物相比，根狀桿菌顯著富集，而鞘氨醇桿菌、分枝桿菌、馬西萊氏菌、芽孢桿菌和假桿菌等顯著減少，革蘭氏陽(yáng)性菌比革蘭氏陰性菌更容易受到多環(huán)芳烴脅迫。
(2) 多環(huán)芳烴脅迫極大地抑制了脂質(zhì)代謝，影響了碳水化合物代謝、氨基酸代謝和次級(jí)代謝物合成。
(3) 構(gòu)建差異微生物和差異代謝物的相關(guān)性網(wǎng)絡(luò)，結(jié)果發(fā)現(xiàn)，變形菌門(mén)和擬桿菌門(mén)、嗜熱菌門(mén)、變形桿菌門(mén)等和甾醇、黃烷酮、**甾醇、3-羥基丁酸等代謝物表現(xiàn)出強(qiáng)相關(guān)性，提示這些微生物可能是對(duì)多環(huán)芳烴脅迫的不同反應(yīng)的關(guān)鍵驅(qū)動(dòng)因素。
· 原文鏈接：
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0269749119335237
中科新生命土壤代謝組產(chǎn)品介紹
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