MaxUpII DNA Library Prep Kit for Illumina?
——建庫(kù)試劑盒中的全能王
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1、產(chǎn)品概述
Hieff NGS??MaxUpII DNA Library Prep Kit for Illumina?，可用于NGS測(cè)序中DNA樣本文庫(kù)構(gòu)建，采用高質(zhì)量的酶學(xué)組成，改進(jìn)型接頭連接技術(shù)，以及具有強(qiáng)擴(kuò)增效率的高保真酶，顯著提高文庫(kù)轉(zhuǎn)化率與擴(kuò)增效率，Input DNA范圍為500 pg-1 μg，適用包含cfDNA、FFPE在內(nèi)的所有樣本進(jìn)行文庫(kù)構(gòu)建，產(chǎn)品可以應(yīng)用于全基因組測(cè)序、靶向捕獲測(cè)序、Chip-seq等測(cè)序方法中。
2、產(chǎn)品特點(diǎn)
≥?適用樣本類型廣：包含cfDNA、FFPE在內(nèi)的所有樣本均能獲得優(yōu)異文庫(kù)和測(cè)序質(zhì)量
≥?應(yīng)用范圍廣：產(chǎn)品可應(yīng)用于全基因組測(cè)序、靶向捕獲測(cè)序、Chip-seq等等
≥?高品質(zhì)酶學(xué)組成：業(yè)界**的接頭連接效率，高達(dá)60%、超高保真性和超強(qiáng)擴(kuò)增效率
≥?品質(zhì)穩(wěn)定：嚴(yán)格的批次性能與穩(wěn)定性質(zhì)控
3、操作流程
精簡(jiǎn)的操作步驟，2-2.5小時(shí)快速建庫(kù)
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4、產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)
1）文庫(kù)轉(zhuǎn)化效率高達(dá)60%
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圖1??Agilent ?2100?檢測(cè)350bp平末端DNA片段單端和雙端連接產(chǎn)物峰
0：350bpDNA片段峰、1：?jiǎn)味私宇^連接產(chǎn)物峰、2：雙端接頭連接產(chǎn)物峰。測(cè)試基于各公司的標(biāo)準(zhǔn)?protocol進(jìn)行。
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圖2?接頭連接效率百分比（%）。
對(duì)圖1峰面積進(jìn)行積分后的定量結(jié)果顯示Hieff NGS? MaxUp II Kit?的雙端連接效率可達(dá)60%
2）擴(kuò)增效率高，兼容不同GC含量樣本
使用具有強(qiáng)擴(kuò)增效率的Super CanaceTM High-Fidelity Mix用于文庫(kù)擴(kuò)增，效率更高。
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產(chǎn)品名稱 |
GC 38% (ng) |
GC 50% (ng) |
GC 70% (ng) |
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Super Canace? High-Fidelity Mix |
25.6 |
18 |
17.1 |
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K*-HiFi mix |
15.8 |
16.7 |
21.1 |
1 ng GC含量分別為38%、50%、70%的400 bp DNA片段為起始樣本，12 cycles擴(kuò)增。
3）文庫(kù)產(chǎn)量高
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樣本 |
100 ng FFPE |
5 ng cfDNA |
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7 cycles (ng) |
10 cycles (ng) |
9 cycles (ng) |
12 cycles?(ng) |
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MaxUP II |
400 |
2000 |
120 |
1200 |
|
K*?品牌 |
150 |
1100 |
100 |
1080 |
以FFPE和cfDNA為起始樣本建庫(kù)，相對(duì)同類型試劑盒品牌?K*，在相同擴(kuò)增循環(huán)數(shù)下，獲得更多文庫(kù)產(chǎn)量。
4）數(shù)據(jù)無偏好性
在不同GC含量樣本中，使用Hieff NGS??MaxUP II Kit均能獲得堿基質(zhì)量好且覆蓋度均一的測(cè)序數(shù)據(jù)。
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樣本 |
Mapped Reads (%) |
Coverage (%) |
||||
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Average |
5× |
10× |
15× |
20× |
||
|
蠟狀芽孢桿菌（GC 34%） |
93.8 |
99.644 |
99.643 |
99.641 |
99.639 |
99.638 |
|
大腸桿菌（GC 51%） |
92.7 |
93.057 |
92.782 |
92.687 |
92.625 |
92.579 |
|
嗜鹽桿菌（GC 65%） |
94.2 |
99.598 |
99.028 |
98.391 |
97.885 |
97.419 |
?
圖3不同GC含量樣本測(cè)序偏好性圖譜
5、客戶反饋
5.1建庫(kù)產(chǎn)量高
1）杭州某生物公司邁*
洗相同條件下對(duì)比實(shí)驗(yàn)，脫體積32 μL，對(duì)比文庫(kù)產(chǎn)量，翊圣MaxUpII文庫(kù)產(chǎn)量比K*文庫(kù)產(chǎn)量更高
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? |
MaxUp II |
K* Hyper |
||||
|
Input DNA |
50 ng |
25 ng |
10 ng |
50 ng |
25 ng |
10 ng |
|
循環(huán)數(shù) （cycles） |
7 |
9 |
13 |
7 |
9 |
13 |
|
文庫(kù)濃度?(ng/μL) |
15.4 |
23.8 |
58.2 |
8.76 |
13.5 |
52.4 |
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