2023年，使用吉凱基因的產品/服務發表的文獻1100+篇。歷年累計20000+篇！
此次小編精心挑選了10篇5月新發的高質量文章供大家欣賞，恭喜以下研究團隊！同時也希望在2023年給您的科研計劃提供一些思路和靈感，快來一睹為快吧！
往期回顧
1//異常m5C超甲基化通過NSUN2/YBX1/QSOX1軸介導EGFR-非小細胞肺癌癌癥對吉非替尼的內在耐藥
Aberrant m5C hypermethylation mediates intrinsic resistance to gefitinib through NSUN2/YBX1/QSOX1 axis in EGFR-mutant non-small-cell lung cancer
發表期刊：Molecular Cancer
IF: 41.444
發表單位：鄭州大學第一附屬醫院
吉凱助力：QSOX1 干擾慢病毒質粒
文章摘要：核糖核酸5-甲基胞嘧啶（m5C）修飾在各種腫瘤的發病機制中起著關鍵作用。然而，RNA-m5C修飾在腫瘤耐藥性中的作用和分子機制尚不清楚。在非小細胞肺癌（NSCLC）細胞系和患者樣本中測定RNA m5C甲基化、m5c writer NOP2/Sun RNA甲基轉移酶家族成員2（NSUN2）和EGFR-TKIs耐藥性之間的相關性。NSUN2對EGFR-TKIs耐藥性的影響通過體外和體內功能獲得和喪失試驗進行了研究。通過RNA測序（RNA-seq）、亞硫酸氫鈉RNA測序（RNA BisSeq）和m5C甲基化RNA免疫沉淀qPCR（MeRIP-qPCR）鑒定參與EGFR-TKIs耐藥性的NSUN2靶基因。此外，通過功能拯救和嘌呤霉素摻入試驗研究了NSUN2調節靶基因表達的調節機制。RNA-m5C高甲基化和NSUN2與EGFR-TKIs的內在耐藥性顯著相關。NSUN2的過表達導致吉非替尼耐藥性和腫瘤復發，而NSUN2基因抑制導致腫瘤消退，并在體外和體內克服了對吉非替尼本征耐藥性。整合RNA-seq和m5C-BisSeq分析確定靜止蛋白巰基氧化酶1（QSOX1）是異常m5C修飾的潛在靶點。NSUN2甲基化了QSOX1編碼序列區，導致QSOX1通過m5C閱讀器Y盒結合蛋白1（YBX1）的增強翻譯。研究揭示了通過NSUN2-YBX1-QSOX1軸的異常RNA m5C修飾在EGFR突變體NSCLC中介導對吉非替尼的內在耐藥性中的關鍵功能。
2//瑞格菲尼通過ERK/MDM2/p53軸抑制EphA2磷酸化并導致肝損傷
Regorafenib inhibits EphA2 phosphorylation and leads to liver damage via the ERK/MDM2/p53 axis
發表期刊：Nature Communications
IF: 17.694
發表單位：浙江大學藥學院藥物安全評價研究中心
吉凱助力：EphA2 過表達腺相關病毒
文章摘要：瑞格菲尼的肝毒性是患者最值得注意的問題之一，但其機制尚不清楚。因此，目前還缺乏有效的干預策略。在這里，通過比較與索拉非尼的比較，作者發現瑞格非尼誘導的肝損傷主要是由于其非治療性靶點Eph受體A2（EphA2）。瑞格菲尼治療雄性小鼠的肝損傷和細胞凋亡。在機制上，瑞格菲尼通過影響細胞外信號調節激酶（ERK）/MDM2軸，改變鼠雙微體（MDM2）的胞內定位，從而抑制EphA2 Ser897磷酸化，減少p53的泛素化。同時，作者發現五味子丙素C可以上調EphA2Ser897位點的磷酸化，在體內對毒性也有保護作用?？偟膩碚f，抑制EphA2 Ser897磷酸化是瑞格菲尼誘導肝毒性的關鍵原因，而化學激活EphA2 Ser897是一種潛在的治療策略來防止瑞格菲尼誘導的肝毒性。
3//HDAC9介導的G2/M上皮細胞周期阻滯導致雄性小鼠腎纖維化
HDAC9-mediated epithelial cell cycle arrest in G2/M contributes to kidney fibrosis in male mice
發表期刊：Nature Communications
IF: 17.694
發表單位：山東大學基礎醫學院
吉凱助力：HDAC9 過表達慢病毒 STAT1 過表達腺病毒
文章摘要：腎小管上皮細胞（TECs）通過介導G2/M的周期阻滯，在腎纖維化中發揮關鍵作用。然而，參與TECsG2/M阻滯的關鍵HDAC亞型及其潛在機制尚不清楚。在這里，作者發現Hdac9在小鼠纖維化腎臟中顯著誘導表達，特別是在馬兜鈴酸腎?。ˋAN）或單側輸尿管梗阻（UUO）誘導的近端小管中。HDAC9的腎小管特異性缺失或TMP195的藥理抑制減弱G2/M上皮細胞周期阻滯，然后減少促纖維化細胞因子的產生，減輕腎小管間質纖維化。在體外，抑制或抑制HDAC9可以減輕TECs中上皮細胞表型的丟失，并通過抑制G2/M中的上皮細胞周期阻滯來減弱成纖維細胞的活化。在機制上，HDAC9去乙?；疭TAT1并促進其重新激活，隨后誘導TECs的G2/M阻滯，最終導致腎小管間質纖維化。綜上所述，作者的研究表明HDAC9可能是腎纖維化的一個有吸引力的治療靶點。
4//PERK介導的來自IDH突變體膠質瘤的膽固醇排泄決定了小膠質細胞的抗腫瘤極化
PERK-Mediated Cholesterol Excretion from IDH Mutant Glioma Determines Anti-Tumoral Polarization of Microglia
發表期刊：Advanced Science
IF: 17.521
發表單位：中山大學第七附屬醫院
吉凱助力：IDH1 過表達慢病毒
文章摘要：異檸檬酸脫氫酶（IDH）突變是一種已知的病理分類，它在膠質瘤細胞中啟動代謝重編程，并與膠質瘤相關的小膠質細胞/巨噬細胞（GAMs）的反應狀態有關。然而，目前尚不清楚IDH基因型如何促進GAM表型。此研究表明，表達突變體IDH的膠質瘤決定了GAMs的m1樣極化，而典型的IDH則誘導了m2樣極化。有趣的是，IDH-突變的神經膠質瘤分泌過量的膽固醇，在不改變其膽固醇生物合成的情況下，導致富含膽固醇的促炎gam，同時由于膽固醇轉運分子的表達重構，特別是ABCA1的上調和LDLR的下調，而表現出低水平的腫瘤膽固醇。在機制上，一個miR-19a/LDLR軸介導的新型轉錄后膽固醇攝取調控被識別出來，由IDH突變調節，并影響腫瘤細胞的增殖和侵襲。IDH突變誘導的PERK激活通過miR-19a/LDLR軸和ABCA1/APOE的上調，增強了來自膠質瘤細胞的膽固醇輸出。此外，引入了合成的PERK激活劑CCT020312，它顯著刺激IDH野生型膠質瘤細胞的膽固醇外排，誘導GAMs的m1樣極化，從而抑制膠質瘤細胞的侵襲。研究發現揭示了PERK/miR-19a/LDLR信號通路在協調膠質體膽固醇轉運和隨后的GAMs表型中的重要作用，從而突出了膠質瘤治療的一個新的潛在靶點通路。
5//YBX1介導的DNA甲基化依賴的SHANK3在精神分裂癥患者PBMC和發育中的皮質中間神經元中的表達
YBX1-Mediated DNA Methylation-Dependent SHANK3 Expression in PBMCs and Developing Cortical Interneurons in Schizophrenia
發表期刊：Advanced Science
IF: 17.521
發表單位：四川大學華西醫院
吉凱助力：YBX1 干擾慢病毒
文章摘要：精神分裂癥（SCZ）是一種嚴重的精神和神經發育障礙。SCZ的病理過程在發育早期就開始了，在精神病癥狀首次出現之前。DNA甲基化在調節基因表達中起著重要作用，而DNA甲基化失調參與了多種疾病的發病機制。甲基化DNA免疫沉淀芯片（MeDIP-chip）用于研究首發SCZ（FES）患者外周血單個核細胞（PBMCs）的全基因組DNA甲基化失調。結果顯示，SHANK3啟動子發生高甲基化，這種高甲基化（HyperM）與左側顳下皮層的皮質表面積呈負相關，與FES的陰性癥狀亞得分呈正相關。研究進一步發現，轉錄因子YBX1在誘導多能干細胞（iPSCs）來源的皮質中間神經元（cINs）中與SHANK3啟動子的HyperM區域結合，但與谷氨酸能神經元無關。此外，利用shrna在cINs中證實了YBX1對SHANK3表達的直接和正向調控作用。綜上所述，cINs中SHANK3表達的失調表明，DNA甲基化可能在SCZ的神經病理機制中發揮作用。研究結果還表明，PBMCs中SHANK3的HyperM可以作為SCZ的潛在外周生物標志物。
6//吸煙誘導的M2 TAMs通過EVs中的circEML4，通過ALKBH5調節的NSCLC細胞中SOCS2的m6A修飾促進NSCLC的進展
Smoking-Induced M2-TAMs, via circEML4 in EVs, Promote the Progression of NSCLC through ALKBH5-Regulated m6A Modification of SOCS2 in NSCLC Cells
發表期刊：Advanced Science
IF: 17.521
發表單位：南京醫科大學
吉凱助力：SOCS2 熒光素酶報告質粒
文章摘要：肺癌是世界范圍內常見的診斷疾病，非小細胞肺癌（NSCLCs）約占病例的85%。香煙煙霧是一種促進NSCLC進展的暴露環境，但其作用尚不清楚。此研究報道了吸煙誘導的NSCLC組織周圍m2型腫瘤相關巨噬細胞（M2-TAMs）的積累促進了惡性腫瘤。具體來說，來自香煙煙霧提取物（CSE）誘導的M2巨噬細胞的細胞外囊泡（EVs）在體內和體外都促進了NSCLC細胞的惡性腫瘤。CSE誘導的M2巨噬細胞ev中的circEML4被轉運到NSCLC細胞，在那里它通過與人類AlkB同源物H5（ALKBH5）相互作用，減少了ALKBH5在細胞核中的分布，導致N6-甲基腺苷（m6A）修飾的升高。m6A-seq和RNA-seq通過ALKBH5調控SOCS2，介導的SOCS2和轉錄激活因子（JAK-STAT）通路的激活。CSE誘導的M2巨噬細胞中EV中circEML4的下調逆轉了EV增強的NSCLC細胞的致瘤性和轉移性。此外，此研究還發現，吸煙患者的circeml4陽性的M2-TAMs水平有所增加。這些結果表明，吸煙誘導的通過circEML4誘導的M2-TAMs通過alkbh5調控的m6A修飾SOCS2促進NSCLC的進展。此研究還表明，TAMsev中的circEML4可作為NSCLC的診斷生物標志物，特別是對于有吸煙史的患者。
7//PD-L1的甲基化限制了PD-L1/PD-1的相互作用以控制癌癥免疫監測
PD-L1 methylation restricts PD-L1/PD-1 interactions to control cancer immune surveillance
發表期刊：Science Advances
IF: 14.957
發表單位：華中科技大學同濟醫學院
吉凱助力：Luciferase 過表達慢病毒
文章摘要：針對程序性細胞死亡蛋白1（PD-1）或程序性細胞死亡1配體1（PD-L1）的免疫檢查點抑制劑已使一些癌癥患者獲得持久、完整的治療反應；然而，缺乏可靠的抗PD-(L)1治療反應生物標志物。作者的研究發現，PD-L1 K162被SETD7甲基化，被LSD2去甲基化。此外，PD-L1 K162甲基化控制了PD-1/PD-L1的相互作用，并明顯增強了對T細胞活性的抑制，控制了癌癥免疫監測。作者證明了PD-L1高甲基化是抗PD-L1治療耐藥性的關鍵機制，研究了PD-L1 K162甲基化是非小細胞肺癌患者抗PD-1治療的陰性預測標志物，并表明PD-L1 K162甲基化：PD-L1比值是預測抗PD-(L)1治療敏感性的更準確的生物標志物。這些發現為PD-1/PD-L1通路的調控提供了見解，確定了這一關鍵免疫檢查點的修飾，并強調了對PD-1/PD-L1阻斷治療反應的預測性生物標志物。
8//腦類器官移植修復中風后梗死皮質并恢復受損的功能
Cerebral organoids transplantation repairs infarcted cortex and restores impaired function after stroke
發表期刊：npj Regenerative Medicine
IF: 14.404
發表單位：南京醫科大學藥學院
吉凱助力：hChR2（E123A） 過表達腺相關病毒
文章摘要：由于梗死組織的永久喪失，中風通常會導致長期或終身的殘疾。雖然已經探索了多種干細胞移植，通過增強神經可塑性來改善神經元缺陷行為，但梗死組織是否可以重建仍不清楚。作者在這里培養了來自人多能干細胞（hPSCs）的人大腦類器官，并將其移植到中風后NOD-SCID小鼠的梗死核心和梗死周圍區的交界處。幾個月后，作者發現移植的類器官在梗死核心存活良好，分化成目標神經元，修復梗死組織，發送軸突到遙遠的大腦目標，并集成到主機神經回路，從而消除感覺運動中風小鼠的缺陷行為，而移植分離單細胞從類器官未能修復梗死組織。這些研究為通過類器官移植重建梗死組織提供了一種新的策略，從而逆轉中風引起的殘疾。
9//FAR591通過調節Fos的表達介導骨微血管內皮細胞的凋亡促進SONFH的發病機制和進展
FAR591 promotes the pathogenesis and progression of SONFH by regulating Fos expression to mediate the apoptosis of bone microvascular endothelial cells
發表期刊：Bone Research
IF: 13.362
發表單位：貴州醫科大學附屬醫院
吉凱助力：FAR591/Fos 過表達慢病毒
文章摘要：類固醇致股骨頭壞死（SONFH）的具體發病機制尚不完全清楚，目前尚無有效的早期治療方法。了解長鏈非編碼rna（lncRNAs）在SONFH發病機制中的作用和機制，將有助于揭示SONFH的發病機制，為其早期預防和治療提供新的靶點。在本研究中，作者首次證實了糖皮質激素（GC）誘導的骨微血管內皮細胞（BMECs）凋亡是SONFH發病和進展的前一個事件。然后，作者通過lncRNA/mRNA芯片在BMECs中鑒定了一個新的lncRNA，命名為fos相關的lincRNA ENSRNOT00000088059.1（FAR591）。FAR591在GC誘導的BMEC細胞凋亡和股骨頭壞死過程中高表達。敲除FAR591可有效阻斷GCs誘導的BMECs凋亡，從而減輕GCs對股骨頭微循環的損傷，抑制SONFH的發病和進展。而過表達FAR591可顯著促進GCs誘導的BMECs細胞凋亡，進而加重GCs對股骨頭微循環的損傷，促進SONFH的發病和進展。在機制上，GCs激活糖皮質激素受體，該受體易位到細胞核，并直接作用于FAR591基因啟動子，誘導FAR591基因過表達。隨后，FAR591與Fos基因啟動子（-245～-51）結合，形成穩定的RNA：DNA三聯體結構，然后招募TATA-box結合蛋白相關因子15和RNA聚合酶II，通過轉錄激活促進Fos的表達。Fos通過調節Bcl-2相互作用中介細胞死亡（Bim）和P53上調凋亡調節劑（Puma）的表達，激活線粒體凋亡通路，介導GC誘導的BMECs凋亡，導致股骨頭微循環功能障礙和股骨頭壞死。綜上所述，這些結果證實了lncrna與SONFH發病機制之間的機制聯系，有助于揭示SONFH的發病機制，為SONFH的早期預防和治療提供了新的靶點。
10//整合蛋白基因組學特征顯示不完全射頻消融后肝細胞癌微環境不平衡
Integrated proteogenomic characterization reveals an imbalanced hepatocellular carcinoma microenvironment after incomplete radiofrequency ablation
發表期刊：Journal of Experimental & Clinical Cancer Research
IF: 13.362
發表單位：重慶醫科大學第一附屬醫院
吉凱助力：PRTN3 過表達/干擾慢病毒
文章摘要：精確評估腫瘤特異性T細胞免疫反應的努力仍然面臨著重大挑戰，而不完全射頻消融（iRFA）后介導肝細胞癌（HCC）微環境失衡的潛在分子機制尚不清楚。本研究旨在進一步了解整合的轉錄組學和蛋白質基因組學景觀，并確定一個參與iRFA后HCC進展的新靶點。收集了10例經RFA治療的HCC患者的外周血和匹配的組織樣本。采用多重免疫染色和流式細胞術評估局部和全身免疫反應。通過轉錄組學和蛋白質基因組學分析，探索了差異表達基因（DEGs）和差異表達蛋白（DEPs）。在這些分析中，作者鑒定出了蛋白酶-3（PRTN3）。然后，對70例RFA后早期復發的HCC患者，評估PRTN3預測總生存期（OS）的能力。通過體外CCK-8、傷口愈合和經孔實驗，觀察枯否細胞（KCs）與PRTN3誘導的HCC細胞之間的相互作用。采用免疫印跡法檢測多種致癌因子和信號通路成分的蛋白水平。多重免疫染色顯示，在iRFA作用30分鐘后，腫瘤組織的局部免疫細胞計數沒有立即發生顯著變化。流式細胞儀顯示CD4+后第5天CD4+CD8+和CD4+CD127?treg水平顯著升高，CD16+CD56+自然殺傷細胞水平顯著降低（p<0.05）。轉錄組學和蛋白質組學顯示了389個DEGs和20個DEPs。通路分析顯示，DEP-DEGs主要在免疫炎癥反應、腫瘤進展和代謝過程中富集。在dep-deg中，PRTN3持續上調，并與射頻消融后早期復發性HCC患者的OS密切相關。在KCs中表達的PRTN3可能影響熱應激處理的HCC細胞的遷移和侵襲。PRTN3通過多種致癌因子和PI3K/AKT和P38/ERK信號通路促進腫瘤生長。