年終盤點| 2022年吉凱蛋白質組平臺全年回顧-環球風云-資訊-生物在線

年終盤點| 2022年吉凱蛋白質組平臺全年回顧

作者:上海吉凱基因醫學科技股份有限公司 2023-01-06T16:57 (訪問量:15659)

歲末將至,感謝各位用戶陪伴吉凱走過不平凡的2022年?;赝^去的一年,吉凱蛋白質組學秉承讓廣大研究型醫生的科研工作更省心、更省力、更高效的初心,致力于提供遠超同行交付標準的服務質量和水準,同時助力多篇高水平研究發表,并獲得了廣大用戶的贊賞和認可 。下面就跟隨小編的腳步,一起來回顧吉凱蛋白質組學不斷前進的科研印記吧。


三套新版生信報告發布,助力臨床科研挖掘更輕松
Part. 1
全新定量蛋白質組學報告發布,打造行業高標準生信分析

新版報告采用的是全新的網頁版設計,內含多重交互式體驗,提供三套差異篩選標準的分析結果,包含蛋白質動態分布范圍、PCA分析、GO/KEGG分析、GSEA分析、PPI分析以及轉錄因子等多達25項標準分析內容,同時報告中還提供《關鍵蛋白質候選列表》、后續研究思路及投稿期刊建議等內容,真正做到讓臨床科研工作者更省心、更省力、更高效。



Part. 2
蛋白質組+磷酸化蛋白質組聯合報告發布,復刻高水平研究文章邏輯和生信分析

近年來,蛋白質組+磷酸化蛋白質組聯合表現出強勁的增長勢頭。基于對高水平研究的深刻理解和分析,吉凱對蛋白質組+磷酸化蛋白質組聯合分析內容進行了全面升級,新版報告包含3大分析模塊,對應從基礎到復雜的生信數據分析內容,也符合高水平研究的數據呈現邏輯,同時還新增兩組學相關性分析、激酶-底物和弦圖以及激酶活性等14項分析,累計提供標準生信分析多達27項。同時為滿足科研用戶對激酶功能的深度科研需求,提供激酶樹、激酶抑制劑&藥物注釋服務和定制病毒等三大高級服務。新版聯合分析報告涉及高水平文獻37篇,讓整篇報告都有據可依。



Part. 3
全新生物標志物篩選算法,單變量和多變量ROC分析助力篩選最佳的生物標志物(或組合)

雖然早期蛋白質生物標志物篩選工作中,研究者傾向于獲得一種特定的蛋白質作為生物標志物,但近年來諸多研究表明將多個標志物進行組合形成新的評判指標能有效提升預測準確性,顯然將多種標志物定量結果組合形成綜合性的評判指標或將成為今后研究的主流趨勢。因此,吉凱基因率先對生物標志物算法進行升級,提供單變量和多變量聯合分析內容,以幫助研究者篩選最佳的生物標志物(或組合)。



4D家族新品不斷,致力于研發有助于數據質量提升的優質檢測技術
Part. 1
4D蛋白質組硬核升級,timsTOF Pro2助力蛋白質組學鑒定更多、更準

基于timsTOF Pro2的發布,吉凱4D蛋白質組開啟雙平臺服務模式!相比于timsTOF Pro,timsTOF Pro 2 配備了新一代雙TIMS分析器,離子容量可提高三倍,最大限度地提高了離子傳輸效率和靈敏度,讓蛋白質組學分析再上一個新的臺階,助力蛋白質組鑒定更準確、更多。

吉凱基因4D蛋白質組開啟雙平臺模式

Part. 2
4D-DIA磷酸化重磅發布:大樣本磷酸化的檢測技術

基于timsTOF Pro/Pro2平臺建立的4D磷酸化蛋白質組,為實現磷酸化定量蛋白組分析帶來了更優秀的解決方案。200 μg hela細胞的90分鐘測試數據表明,相比傳統label free磷酸化檢測技術,4D label free磷酸化檢測能力提升60%,4D-DIA磷酸化檢測能力甚至提高了1.2倍!此外,4D-DIA磷酸化蛋白質組學為全景式掃描,數據缺失值少,鑒定與定量結果的可重復性更高,三次技術重復性達85%,定量相關性在0.9以上,是當之無愧的大樣本檢測技術。

Part. 3
靶向蛋白質檢測技術4D-PRM:無需依賴抗體,一次可檢測多種蛋白

4D-PRM在普通的PRM的基礎上,利用離子淌度新一維的分離,提高了離子的選擇性和靈敏度,并結合了PASEF的掃描速度優勢,從而增加了靶標離子的數量,可實現更多更快更準確的靶向蛋白組檢測,帶領靶向蛋白組學突破研究瓶頸進入新高度!

同免疫測定法比較,4D-PRM一次可檢測多種蛋白,無需依賴抗體,其應用前景有望在將來取代傳統的WB、ELISA等方法。除了常規蛋白組研究中差異目標蛋白的驗證,4D-PRM也為靶向蛋白質組學技術在大隊列生物標志物驗證和臨床轉化應用方面帶來更多可能。


Part. 4
超靈敏Olink蛋白質新品:與質譜互補技術,助力臨床血液蛋白質標志物篩選

人體蛋白質種類眾多,存在著來源廣、組成復雜等特點。然而目前基于質譜檢測的蛋白質組學技術更傾向于高豐度物質的檢測,容易丟失了很多低豐度蛋白與疾病關系的重要信息。新一代的Olink蛋白質組學平臺應運而生,彌補了質譜在血液樣本檢測中的缺陷,為血液蛋白質標志物的發展提供了新的檢測方向。Olink平臺基于鄰位延伸分析技術(PEA),既覆蓋了廣泛的動態范圍,橫跨10個log,覆蓋了高、中、低豐度蛋白;又有基因組學的高通量,保留了蛋白/抗原識別的特異性,檢測蛋白豐度最低可以達到fg/ml,可對疾病早篩相關的蛋白生物標志物進行多重、靈敏、高通量的檢測。



助力眾多高水平研究成果,客戶投稿文章深度解讀合作成果

吉凱基因不僅提供優質的檢測技術,同時也秉承“客戶至上”的服務理念,提供優質的售前售后服務,協助解讀報告,返修數據,整理論文思路以及上傳原始數據和回復編審問題,是廣大用戶最忠誠的合作伙伴。過去一年,吉凱蛋白質組客戶發表了諸多高水平研究,我們也有幸收到多篇客戶投稿的文章,深度解讀了吉凱助力的科研成果!

1.Nat Commun | 吉凱助力南京鼓樓醫院/南京大學生命科學學院合作發現腫瘤特異性肺轉移的新機制
2.吉凱助力!中山大學腫瘤防治中心陳明教授團隊揭示PI3K/AKT通路激活可能是小細胞肺癌放化療耐藥的潛在機制
3.Autophagy | 復旦大學邵春林教授團隊新發現:TGM2在協調自噬溶酶體融合以及膠質母細胞瘤輻射抵抗中發揮重要功能
4.吉凱助力!IF10| 山東省立醫院研究團隊揭示miRNA在阿爾茲海默病中的功能和作用機制
5.Nature旗下CDD| 武漢大學人民醫院首次發現CLDN4蛋白在惡性膠質瘤中的調控機制
6.CDD| 中山醫院程蕾蕾/趙健元教授團隊發現E3泛素化連接酶(TRIM25)能夠有效緩解阿霉素誘導的心臟毒性
7.吉凱助力!中南大學湘雅醫學院附屬??卺t院黃曉曦教授團隊新發現:細胞周期蛋白CCNB2在肝細胞癌發生發展機制中發揮重要作用
8.IF10!吉凱助力福建醫科大學附屬第一醫院研究團隊揭示HBV感染自然進程中的蛋白特征及潛在生物標志物

2022年吉凱基因始終秉承讓廣大研究型醫生的科研工作更省心、更省力、更高效的初心,致力于提供遠超同行交付標準的服務質量和水準。新的一年,吉凱蛋白質組學平臺仍將聚焦前沿檢測技術與新的學術成果,以更好產品和更好服務回饋廣大用戶的喜愛與支持,為廣大用戶提供更優質的檢測技術與各類TOP期刊生信分析,敬請期待!


吉凱基因憑借多年在靶標篩選及驗證服務領域的技術積累,建立的標準化 、工程化 、系統化的GRP平臺,為中國研究型醫生提供科研服務,加快科研成果轉化。其中,多組學平臺包含蛋白質組學平臺和高通量測序平臺

·蛋白質組學平臺擁有多臺timsTOF Pro、Exploris 480高精度質譜儀,專業的Spectronaut Plusar、Mascot等分析軟件,提供專業的4D、DIA、TMT、PRM、磷酸化修飾組、olink蛋白質組等檢測服務,強大的機器學習算法、IPA分析、蛋白基因組分析服務,系統的生物標志物、分子分型、藥物靶點、基因功能研究等解決方案,真正讓廣大研究型醫生的科研工作更省心、更省力、更高效;

·高通量測序平臺分為常規測序服務和單細胞測序服務:單細胞測序擁有10x和BD兩個平臺,提供單細胞RNA-seq、單細胞核測序、單細胞混樣RNA-seq、單細胞TCR/BCR、單細胞(RNA+ATAC)、空間轉錄組測序等服務;常規測序服務提供meRIP-seq(m6A/m1A/m7G/m5C 等RNA甲基化修飾測序)、acRIP-seq(ac4C RNA乙?;揎棞y序)、ATAC-seq、Ribo-seq(翻譯組測序) 、mRNA/miRNA/LncRNA/circRNA-seq、全轉錄組測序(兩文庫/三文庫)、外泌體miRNA/LncRNA-seq、WGS/WES、WGBS、RRBS、BSAS等服務。
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