Tree Physiol:NMT揭示楊樹不同根區NO3-吸收差異與miRNA調節有關-自主發布-資訊-生物在線

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Tree Physiol:NMT揭示楊樹不同根區NO3-吸收差異與miRNA調節有關

作者:旭月(北京)科技有限公司 2020-08-07T08:56 (訪問量:7617)

NMT作為生命科學底層核心技術,是建立活體創新科研平臺的必備技術。2005年~2020年,NMT已扎根中國15年。2020年,中國NMT銷往瑞士蘇黎世大學,正式打開歐洲市場。

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究使用平臺:NMT植物營養創新科研平臺



期刊:Tree Physiology


主題:NMT揭示楊樹不同根區NO3-吸收差異與miRNA調節有關


標題:Physiological characteristics and RNA sequencing in two root zones with contrasting nitrate assimilation of Populus × canescen



影響因子:3.655


檢測指標:

NO3-

流速



檢測樣品:灰楊根部



NO3-流實驗處理方法:

0.5 mM NaNO3?培養10d



NO3-流實驗測試液成份:

0.5 mM NaNO3,pH 5.8



作者:中國林業科學研究院林業研究所羅志斌、周婧

中文摘要

不同的根區在胡楊屬物種中具有不同的吸收**鹽(NO3-)的能力,但基本的生理和微RNA(miRNA)調節機制仍然未知。

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為了解決這個問題,研究了兩個具有不同NO3吸收能力的根莖假單胞菌的根區。到根尖的0至40 mm區域(根部區域I)顯示出凈流入,而40至80 mm的區域(根部區域II)顯示出凈流出。II區的NO3-和銨(NH4+)濃度以及**還原酶(NR)活性低于I區。

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與區域I相比,在區域II中鑒定了41個上調的miRNA和23個下調的miRNA,以及這些miRNA的576個靶標。尤其是生長調節因子4(GRF4),即ptc-miR396g-5p和ptc-miR396f_L上調的靶標與區域I相比,區域II中的+ 1R-1被下調,可能有助于區域II中較低的NO3吸收率和吸收。

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此外,在根區發現了一些miRNA及其靶標,即C2H2鋅指家族成員和APETALA2 /乙烯反應性元素結合蛋白家族成員,這可能在調節NO3-吸收中起重要作用。這些結果表明,差異表達的miRNA-靶標對在調節不同NO3-吸收速率以及在楊樹不同根部區域的同化中起關鍵作用。

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英文摘要

Different root zones have distinct capacities for nitrate (NO3-) uptake in Populus species, but the underlying physiological and microRNA (miRNA) regulatory mechanisms remain largely unknown.

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To address this question, two root zones of P. × canescens with contrasting capacities forNO3- uptake were investigated. The region of 0 to 40 mm (root zone I) to the root apex displayed net influxes, whereas the region of 40 to 80 mm (root zone II) exhibited net effluxes. Concentrations of NO3- and ammonium (NH4+) as well as nitrate reductase (NR) activity were lower in zone II than in zone I.

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Forty one upregulated and twenty three downregulated miRNAs, and 576 targets of these miRNAs were identified in zone II in comparison with zone I. Particularly, growth-regulating factor 4 (GRF4), a target of upregulated ptc-miR396g-5p and ptc-miR396f_L + 1R-1, was downregulated in zone II in comparison with zone I, probably contributing to lower NO3-uptake rates and assimilation in zone II.

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Furthermore, several miRNAs and their targets, members of C2H2 zinc finger family and APETALA2/ethylene-responsive element binding protein family, were found in root zones, which probably play important roles in regulating NO3- uptake. These results indicate that differentially expressed miRNA-target pairs play key roles in regulation of distinct NO3-uptake rates and assimilation in different root zones of poplars.

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關鍵詞:非損傷微測技術,NO3-流速

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