編者按 該項研究全面揭示了蛋白磷酸化修飾在SCF 復(fù)合體介導(dǎo)的底物蛋白泛素化降解過程中的普遍性和特異性,為深入研究磷酸化修飾和泛素化修飾的交互作用(cross-talk)提供了嶄新的思路。 主要結(jié)論 1. 利用定量蛋白質(zhì)組學(xué)和磷酸化組學(xué)的方法,篩選磷酸化依賴的SCF潛在泛素化降解底物 為了鑒定CRLs(Cullin-RING ligases)的磷酸化依賴的泛素化底物,使用定量蛋白質(zhì)組學(xué)和磷酸化蛋白組學(xué)的方法定量MLN4924誘導(dǎo)改變的蛋白、磷酸化蛋白和磷酸化位點(圖1A)。通過大規(guī)模檢測,共鑒定到8286個蛋白、12276個可信度較高的磷酸化位點和4322個磷酸化蛋白。 2. SCF的候選底物蛋白及其參與泛素化降解途徑的磷酸化位點確認(rèn) 為了確定新的SCF磷酸化依賴的泛素化底物,作者將上述蛋白組學(xué)和磷酸化蛋白組學(xué)得到的結(jié)果與SCF-associated interactome相比對,共篩選到16個已報道的和38個未報到的SCF底物(圖2A)。通過免疫印跡實驗以及磷酸化位點突變等實驗,最終確定BAG3、UFD1和PRKAR1A這三個蛋白確為SCF的底物且蛋白的磷酸化是SCF依賴的泛素化降解的必要條件。 3. BAG3磷酸化介導(dǎo)泛素化降解機(jī)制研究 為了探究FBXO22調(diào)控BAG3降解的機(jī)制,通過過表達(dá)、敲除FBXO22以及添加蛋白酶抑制劑的多種實驗方法驗證了FBXO22對BAG3的調(diào)控(圖4A、4B、4C和4D)。接著作者將FBXO22蛋白C末端、BAG3的S377位點分別進(jìn)行點突變做免疫沉淀實驗,證實FBXO22蛋白上與BAG3的結(jié)合位點以及BAG的降解需要S377位點的參與(圖4G、4H和4I)。另外研究發(fā)現(xiàn)ERK在BAG3 S377位點的磷酸化和BAG3的降解中發(fā)揮了重要作用(圖4K)。 4. 保守性磷酸化降解結(jié)構(gòu)域確認(rèn) 通過將BAG3蛋白上S377位點附近的序列與多物種的序列比對、與SNAI1(已報道的FBXO22底物)的序列做比對,作者發(fā)現(xiàn)了磷酸化降解結(jié)構(gòu)域--XXPpSPXPXX結(jié)構(gòu)域(圖4E和圖4F),隨后作者使用FIMO軟件以及生化實驗進(jìn)一步確認(rèn)該結(jié)構(gòu)域是否為保守的磷酸化降解結(jié)構(gòu)域。在生化實驗中, RRAS2、EAF1蛋白(與BAG3發(fā)揮同樣重要作用且具有相似的結(jié)構(gòu)域的蛋白)經(jīng)位點突變后,不響應(yīng)MLN4924的處理(圖5C)亦不能與FBXO22結(jié)合(圖5E)。 5. BAG3降解生物學(xué)功能研究 通過體內(nèi)和體外實驗發(fā)現(xiàn),BAG3 S377位點的突變會引起腫瘤的生長(圖6A和6B)。為了更進(jìn)一步深入了解FBXO22-BAG3調(diào)控軸,本研究中開展了定量蛋白組學(xué)實驗。與之前的結(jié)果一致,在FBXO22敲除的細(xì)胞中,BAG3的蛋白水平上升(圖6C)。在FBXO22敲除的細(xì)胞中,BAG3基因的沉默也會顯著降低細(xì)胞的增殖和遷移能力(圖6G)。 小結(jié)
泛素化是生物體內(nèi)非常重要的蛋白翻譯后修飾,介導(dǎo)了真核生物體內(nèi)80%~85%的蛋白質(zhì)降解。該降解途徑是調(diào)控蛋白表達(dá)水平的重要機(jī)制,通過對蛋白質(zhì)穩(wěn)定性、定位、活性以及相互作用的調(diào)控,廣泛參與轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)細(xì)胞凋亡、囊泡運輸?shù)壬磉^程。磷酸化也是蛋白質(zhì)組中普遍存在的翻譯后修飾,在細(xì)胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)中發(fā)揮重要作用。

Global identification of phospho-dependent SCF substrates reveals a FBXO22 phosphodegron and an ERK-FBXO22-BAG3 axis in tumorigenesis





該項研究通過多種分子生物學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)策略,揭示了SCFFBXO22為BAG3的泛素E3連接酶,F(xiàn)BXO22通過對ERK催化的BAG3的S377位點的磷酸化進(jìn)行識別,進(jìn)而促進(jìn)BAG3的泛素化降解,進(jìn)一步證明了ERK-FBXO22-BAG3調(diào)控軸在腫瘤發(fā)生發(fā)展中的新機(jī)制。生命活動的調(diào)節(jié)過程并不是單一的調(diào)控過程,涉及到復(fù)雜的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。泛素化和磷酸化作為真核生物中最常見的蛋白翻譯后修飾,對于蛋白活性、蛋白表達(dá)量以及蛋白功能調(diào)節(jié)具有至關(guān)重要的作用,多項研究表明他們之間存在著相互調(diào)節(jié)的作用(cross-talk)。本研究成果對于兩種修飾之間的研究提供了很好的范例,也是值得去深入探索的方向。
Cell Death Differ最新報道實現(xiàn)磷酸化與泛素化的交互應(yīng)答研究(crosstalk)
作者:上海中科新生命生物科技有限公司 2021-12-22T11:44 (訪問量:3881)
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