深度空間代謝組學Q&A(二)| 數據處理常見問題-自主發布-資訊-生物在線

深度空間代謝組學Q&A(二)| 數據處理常見問題

作者:上海中科新生命生物科技有限公司 2022-04-29T18:07 (訪問量:5112)


各位看官大家好!空間代謝組Q&A又和大家見面啦!上一期,我們介紹了空間代謝組學的工作流程及樣本準備小技巧(點擊閱讀)。這一期,我們將為大家繼續解答數據處理中的常見小問題

Q1 深度空間代謝組學如何進行數據處理方式是什么?
深度空間代謝組學的原始數據通過SCILSTM Lab軟件處理。SCILSTM Lab是由Bruker公司針對空間代謝組學數據特點而開發的商業化質譜成像分析軟件。該軟件很好地解決了傳統數據處理中,涉及空間和高維代謝組信息整合時,難以準確展現真實分子層面的變化的痛點。目前該軟件被廣泛使用,堪稱分析利器。

Q2 SCILSTM Lab的優勢是什么?
1. 內部邏輯穩定,集成完整質譜數據標準化與成像分析功能,輸出數據可追溯;
2. 集成下一代機器學習集成算法,支持臨床大隊列分析比較,多樣本/多區域/3D成像整合處理;
3. 高效的譜圖解析功能,可實現深度挖掘關鍵代謝物信息;
4. 可視化操作,數據隨時可調,快速交付。

Q3 深度空間代謝組分析是如何進行代謝物定性的?
傳統空間代謝組學定性指標有兩種,分別是MS1(一級質譜)和MS2(二級質譜)。在新一代空間代謝組學技術中,利用離子淌度捕集裝置,針對離子橫截面積不同的特點進行分離,形成第三個定性指標CCS值。深度空間代謝組學基于tims-TOF flex MALDI 2開發,可以根據實驗需求,結合中科本地標準品數據庫以及Bruker商業代謝物數據,實現上述三種指標的定性分析,大幅提升代謝物鑒定準確性。

Q4 深度空間代謝組學數據分析結果示例
關于每種分析具體功能和應用方向,我們會在下一期空間代謝組學Q&A中詳細介紹討論,敬請各位期待~

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深度空間代謝組學:
· MALDI 2離子化策略—檢測更靈敏、覆蓋更全面;
· 離子淌度分離—離子利用更高效、鑒定更準確


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