蛋白是生命活動的直接執行者,但蛋白并不是在翻譯后就能夠直接行使功能的,大多數的蛋白往往需要進行翻譯后修飾。目前已發現的蛋白翻譯后修飾類型有300多種,其中蛋白磷酸化(Phosphorylation)是最廣泛的一種蛋白翻譯后修飾。
磷酸化蛋白質組技術難點
近年來蛋白質組學技術的發展和應用為磷酸化蛋白質的定性、定量和功能研究提供了必要的技術,使大規模和系統性進行磷酸化蛋白質研究成為可能。但磷酸化蛋白質技術仍面臨一些技術挑戰:
4D label free磷酸化/4D-DIA磷酸化:當前更好的選擇
離子淌度的引入,把蛋白質組學帶入的4D 蛋白質組學時代?;趖imsTOF Pro/Pro2平臺建立的4D磷酸化蛋白質組,為實現磷酸化定量蛋白組分析帶來了更優秀的解決方案。
技術優勢1:4D儀器讓磷酸化位點鑒定更準確
4D平臺引入的離子淌度分離能根據肽段的離子遷移速度,將修飾位點定位相近的同分異構多肽有效區分,提高位點定位可靠度。因此,4D修飾組學帶來的更精確位點定位,為后續位點驗證及功能實驗提供更可靠基礎。

技術優勢2:4D儀器讓磷酸化鑒定深度更深
測試數據表明,200 μg hela細胞,90分鐘4D label free磷酸化和4D-DIA磷酸化檢測,均能實驗高深度磷酸化鑒定。相比傳統label free磷酸化檢測技術,4D label free磷酸化檢測能力提升60%,4D-DIA磷酸化檢測能力甚至提高了1.2倍!

技術優勢3:4D-DIA磷酸化數據缺失值少,定量重復性高,是大樣本磷酸化檢測推薦技術
相比4D label free技術(DDA技術),4D-DIA磷酸化蛋白質組學為全景式掃描,數據缺失值少,鑒定與定量結果的可重復性更高,數據可回溯。測試結果表明,4D-DIA磷酸化的三次技術重復性達85%,定量相關性在0.9以上。

磷酸化蛋白質組技術選擇建議
磷酸化蛋白質組技術存在不同技術路線,每種技術有其技術優勢,可根據樣本數量以及對數據質量的要求進行綜合選擇,例如樣本數≥30例,就可以考慮用4D-DIA磷酸化蛋白質組技術。各類技術特點如下:

吉凱基因憑借多年在靶標篩選及驗證服務領域的技術積累,建立的標準化 、工程化 、系統化的GRP平臺,為中國研究型醫生提供科研服務,加快科研成果轉化。其中,多組學平臺包含蛋白質組學平臺和高通量測序平臺:
·蛋白質組學平臺擁有多臺timsTOF Pro、Exploris 480高精度質譜儀,專業的Spectronaut Plusar、Mascot等分析軟件,提供專業的4D、DIA、TMT、PRM、磷酸化修飾組、Olink蛋白質組等檢測服務,強大的機器學習算法、IPA分析、蛋白基因組分析服務,系統的生物標志物、分子分型、藥物靶點、基因功能研究等解決方案,真正讓廣大研究型醫生的科研工作更省心、更省力、更高效;
·高通量測序平臺分為常規測序服務和單細胞測序服務:單細胞測序擁有10x和BD兩個平臺,提供單細胞RNA-seq、單細胞核測序、單細胞混樣RNA-seq、單細胞TCR/BCR、單細胞(RNA+ATAC)、空間轉錄組測序等服務;常規測序服務提供meRIP-seq(m6A/m1A/m7G/m5C 等RNA甲基化修飾測序)、acRIP-seq(ac4C RNA乙?;揎棞y序)、ATAC-seq、Ribo-seq(翻譯組測序) 、mRNA/miRNA/LncRNA/circRNA-seq、全轉錄組測序(兩文庫/三文庫)、外泌體miRNA/LncRNA-seq、WGS/WES、WGBS、RRBS、BSAS等服務。
