代謝組學(xué)技術(shù)的興起加快了生物標(biāo)志物的篩選工作，每年都有大量的文獻(xiàn)發(fā)表。很遺憾的是絕大數(shù)文章的研究隊(duì)列小規(guī)模較小，只是屬于前瞻性的研究，離真正走入臨床應(yīng)用還有很長(zhǎng)一段距離。
小編注意到國(guó)內(nèi)在肝癌、冠心病、結(jié)直腸癌等領(lǐng)域已經(jīng)有了多篇大規(guī)模的報(bào)道，其中中國(guó)藥科大學(xué)臨床代謝組學(xué)中心主任齊煉文教授一直走的是大隊(duì)列研究路線。投入大量時(shí)間、金錢的背后動(dòng)機(jī)，無(wú)外乎是希望實(shí)現(xiàn)科研到臨床應(yīng)用的轉(zhuǎn)化。小編今天想跟給位老師介紹齊煉文教授團(tuán)隊(duì)接二連三發(fā)表的幾篇大隊(duì)列研究。
2016年，中國(guó)藥科大學(xué)臨床代謝組學(xué)中心主任齊煉文教授等人在國(guó)際心血管領(lǐng)域頂級(jí)期刊Journal of the American College of Cardiology發(fā)表文章《Comprehensive Metabolomic Characterization of Coronary ArteryDiseases》。原文鏈接：http://www.cnki.com.cn/Article/CJFDTotal-ZJJJ201604042.htm
研究團(tuán)隊(duì)利用UPLC-Q/TOF-MS對(duì)2324份血漿臨床樣本進(jìn)行了非靶向代謝組學(xué)分析，鑒定到89個(gè)與冠心病發(fā)生發(fā)展表型特征密切相關(guān)的差異代謝物，其中包括磷脂相關(guān)代謝通路抑制、氨基酸代謝增強(qiáng)、酰基肉堿類代謝通路激活、膽汁酸代謝減弱等多種代謝紊亂特征。
進(jìn)一步從差異代謝物庫(kù)中篩選出12組靈敏度高（>85%）、專屬性強(qiáng)（>85%）的代謝標(biāo)志物群，繪制了冠心病及其在不同臨床階段（冠脈硬化癥、穩(wěn)定型心絞痛、不穩(wěn)定型心絞痛、心肌梗死）的血漿代謝組學(xué)特征譜。ROC分析顯示，12組代謝標(biāo)志物群診斷能力良好。
在16年文章的基礎(chǔ)上，2017年齊煉文教授等人在心血管領(lǐng)域頂級(jí)期刊Circulation上發(fā)表文章《Functional Metabolomics Characterizes a Key Role for N-Acetyl-neuraminic Acid in Coronary Artery Diseases》。原文鏈接：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29212895
在16年研究的基礎(chǔ)上，研究人員發(fā)現(xiàn)36種代謝物與冠心病的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)，隨后通過(guò)靶向代謝進(jìn)一步證實(shí)N-乙酰神經(jīng)氨酸(Neu5Ac) 在血漿中的水平與冠心病事件呈顯著正相關(guān)，為冠心病進(jìn)展相關(guān)的代謝標(biāo)志物。
研究人員發(fā)現(xiàn)N-乙酰神經(jīng)氨酸(Neu5Ac)作為信號(hào)分子，可選擇性結(jié)合Rho家族中的RhoA和Cdc42，激活Rho-ROCK信號(hào)通路誘發(fā)心肌損傷。后續(xù)分子、細(xì)胞和動(dòng)物水平的深入探索，發(fā)現(xiàn)抑制N-乙酰神經(jīng)氨酸上游調(diào)控蛋白神經(jīng)氨酸酶，可以有效緩解心肌缺陷所導(dǎo)致的心肌細(xì)胞損傷。這一結(jié)果為冠心病藥物研發(fā)提供了新的靶點(diǎn)，也為早已上市的神經(jīng)氨酸酶抑制劑奧塞米韋和扎那米韋的藥物再定位開(kāi)拓了新思路。
近日，齊煉文教授等人在胃腸肝病學(xué)領(lǐng)域頂級(jí)期刊Gastroenterology上發(fā)表文章《Tyrosine and Glutamine–leucine are Metabolic Markers of Early-stage Colorectal Cancers》。
齊煉文教授等人對(duì)健康人、代謝綜合征患者(MS)以及結(jié)直腸癌患者(CRC)三組共3482例血清樣本進(jìn)行了代謝組學(xué)檢測(cè)。
首先研究團(tuán)隊(duì)對(duì)篩選隊(duì)列的360例樣本進(jìn)行了非靶向代謝組學(xué)分析，發(fā)現(xiàn)30種組間顯著變化的差異代謝物。隨后對(duì)驗(yàn)證隊(duì)列的1594例樣本進(jìn)行非靶向代謝組學(xué)分析，7種代謝物得到進(jìn)一步的驗(yàn)證，并被初步篩選為潛在生物標(biāo)志物。基于線性回歸分析的結(jié)果表明Glu-Leu和酪氨酸具有良好的結(jié)直腸癌診斷能力，并選取驗(yàn)證隊(duì)列中的900例樣本進(jìn)行靶向檢測(cè)驗(yàn)證。最后又繼續(xù)對(duì)預(yù)測(cè)隊(duì)列的1528例樣本進(jìn)行了靶向檢測(cè)，進(jìn)一步評(píng)價(jià)panel的診斷能力，結(jié)果表明Glu-Leu和酪氨酸對(duì)健康人 vs 結(jié)直腸癌患者(CRC)、代謝綜合征患者(MS) vs 結(jié)直腸癌患者(CRC)的診斷能力良好，可作為結(jié)直腸癌的早期診斷生物標(biāo)志物。
研究團(tuán)隊(duì)利用UPLC-Q/TOF-MS對(duì)2324份血漿臨床樣本進(jìn)行了非靶向代謝組學(xué)分析，鑒定到89個(gè)與冠心病發(fā)生發(fā)展表型特征密切相關(guān)的差異代謝物，其中包括磷脂相關(guān)代謝通路抑制、氨基酸代謝增強(qiáng)、酰基肉堿類代謝通路激活、膽汁酸代謝減弱等多種代謝紊亂特征。
小編心得
1. 真正有望走向臨床應(yīng)用的代謝標(biāo)志物一定是上千例的大隊(duì)列研究，投入與產(chǎn)出成正比。
中科新生命（APT）可以給客戶提供基于非靶向代謝組學(xué)的代謝標(biāo)志物篩選，或基于DIA的蛋白標(biāo)志物篩選的解決方案，并且曾經(jīng)參與過(guò)一項(xiàng)標(biāo)志物篩選方向的精準(zhǔn)醫(yī)療研究，項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn)豐富，頗有心得，歡迎感興趣的老師前來(lái)咨詢。
APT的產(chǎn)品優(yōu)勢(shì)：
對(duì)于這種上百例、上千例的大樣本檢測(cè)，采集時(shí)間長(zhǎng)，APT采用的是不同于小樣本檢測(cè)的一套特殊的數(shù)據(jù)采集模式，并且時(shí)刻監(jiān)控整個(gè)實(shí)驗(yàn)過(guò)程的儀器狀態(tài)。
非靶代謝：2700+基于標(biāo)品的代謝物二級(jí)譜圖數(shù)據(jù)庫(kù)+人工二次確認(rèn)，雙重保證定性結(jié)果的可靠性。在不久的將來(lái)，APT還會(huì)推出MetDNA技術(shù)（放一下之前軟文的鏈接），鑒定的代謝物數(shù)量也會(huì)大大提升。
DIA：最新推出成熟的DIA服務(wù)，
目前2000多個(gè)樣本已經(jīng)下機(jī)，尤其是血漿樣本，無(wú)須去除高豐度，無(wú)須分級(jí)，上機(jī)2h，單個(gè)樣本可獲得1000+蛋白，也是大隊(duì)列標(biāo)志物篩選、分子分型研究的優(yōu)選技術(shù)。
APT質(zhì)控體系：
對(duì)于非靶向代謝組學(xué)和DIA等產(chǎn)品，中科新生命采用更高標(biāo)準(zhǔn)的質(zhì)控體系，多項(xiàng)評(píng)價(jià)內(nèi)容全面客觀的監(jiān)測(cè)儀器的系統(tǒng)穩(wěn)定性，評(píng)價(jià)數(shù)據(jù)質(zhì)量好壞。
APT實(shí)驗(yàn)室資質(zhì)優(yōu)勢(shì)：
中科新生命有嚴(yán)格的實(shí)驗(yàn)管理系統(tǒng)，并且通過(guò)CMA認(rèn)證、ISO9001質(zhì)量管理體系認(rèn)證、室間質(zhì)評(píng)，是值得放心的選擇。