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作者:上海中科新生命生物科技有限公司 2022-06-22T16:24 (訪問量:7422)


目前為止,帕金森病(Parkinson's disease,簡稱PD)在臨床上仍然沒有可靠的標(biāo)志物!6月21日,Matthias Mann團隊于在Cell reports medicine(預(yù)計今年IF >15)發(fā)表了名為“Proteome profiling of cerebrospinal fluid reveals biomarker candidates for Parkinson’s disease研究”,利用高可靠、高靈敏度的蛋白質(zhì)組學(xué)分析流程,對來自于兩個獨立隊列共超過200名受試者進行了微量腦脊液樣本的蛋白譜分析;利用機器學(xué)習(xí)算法,發(fā)現(xiàn)了PD相關(guān)蛋白表達(dá)特征及潛在標(biāo)志物,同時進一步揭示了PD的病理機制。


【亮點總結(jié)】
針對微量腦脊液樣本:建立了可重復(fù)的、高可靠的于質(zhì)譜的腦脊液蛋白質(zhì)組分析流在超過200個個體的腦脊液中鑒定到超過1700個蛋白質(zhì)發(fā)現(xiàn)了LRRK2 G2019S突變攜帶者的溶酶體和免疫相關(guān)標(biāo)志物特征在腦脊液和尿液的整合水平上,分析了PD與LRRK2突變的相關(guān)特征

【隊列及技術(shù)方法】
113對照 VS 102 PD患者,DIA技術(shù)



【主要結(jié)果】:
1. 腦脊液蛋白質(zhì)組概況


2. 數(shù)據(jù)與樣本的質(zhì)量評價


3. 機器學(xué)習(xí)發(fā)現(xiàn)PD的蛋白質(zhì)組特征



4. LRRK2 G2019S突變相關(guān)的腦脊液蛋白質(zhì)組


5. 腦脊液與尿液蛋白質(zhì)組的整合比較


6. 腦脊液(及尿液)蛋白質(zhì)特征與PD臨床得分(UPDRS score)相關(guān)


【總結(jié)】

在這項研究中,Mann研究團隊擴展了生物標(biāo)志物發(fā)現(xiàn)的流程方法,該方法分析了來自兩個獨立隊列的 200 多個 CSF 樣本,并從微量樣本中檢測到 1,700 多種蛋白質(zhì)。通過機器學(xué)習(xí),研究者確定了PD獨特的蛋白質(zhì)特征,其豐度在 PD 患者與健康對照組和 LRRK2 G2019S 攜帶者與非攜帶者中發(fā)生了特別變化。該研究表明,基于質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)是在體液中發(fā)現(xiàn)生物標(biāo)志物的強大技術(shù)。該研究還提供了潛在的 PD 生物標(biāo)志物以及與 PD 和/或 LRRK2 突變相關(guān)的生物途徑的見解。
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