在剛剛過去的2021年度蛋白質組學領域最高規格的學術大會——HUPO國際大會（Human Proteome Organization World Congress）上，單細胞受到了極大的關注，其中一個專題就是：從單細胞到系統生物學的蛋白質組學在健康和疾病中的應用（Proteomics from Single Cell to Systems Biology in Health and Disease）， 多位國際專家分享了單細胞蛋白組學的最新前沿技術突破及在未來的應用價值。這表明隨著單細胞技術的革命性突破，單細胞的時代已經來臨。 中科新生命經過潛心研發，已實現在單細胞組學領域的重大突破，在單細胞蛋白質組學技術方法、檢測通量、鑒定深度方面都實現了質的飛躍。建立了從單細胞挑選，到單細胞蛋白質組學檢測的一站式服務。 下面就為您揭開中科新生命重磅新品——單細胞蛋白質組學的神秘面紗，為您的單細胞組學研究保駕護航。 一、單細胞蛋白質組學聚焦三大領域：腫瘤、免疫、生殖 對細胞的精確認知是理解細胞在生理和病理過程中功能的先決條件。傳統研究手段是針對細胞群體進行分析，獲得大量細胞的平均化結果，無法區分不同細胞個體對于樣品異質性的精確貢獻值，從而忽視或掩蓋了單細胞的個體差異。 隨著二代測序技術的持續發展，單細胞基因組和轉錄組研究突飛猛進，使學者們對細胞認識的分辨率達到了單個細胞的水平。單細胞蛋白質組學不僅可以像單細胞轉錄一樣，可以提供單個細胞的基因表達情況，為細胞亞群分類提供大數據參考；更有意義的是，通過蛋白質層面的檢測，可以避免轉錄后調控以及翻譯后調控帶來的表達水平改變，更加接近細胞的調控本質，能夠更加深刻和準確理解疾病的根本原因，在腫瘤，免疫以及生殖發育領域都具有極大的研究價值，為揭示生理病理表型，藥物靶點的開發，及實現精準醫療都提供了數據參考。 二、單細胞蛋白質組學新突破：超高靈敏度，超高檢測能力的技術方法 在單細胞層面的研究需求提出以來，也有一些技術方法可以進行單細胞層面的蛋白質檢測，主要是基于熒光染料或抗體，分選已知細胞類型或者已有特征的細胞種類，至多分析幾十種蛋白質。而在今年的HUPO會議上，單細胞蛋白組學的領軍人物報道了Minimal ProteOmic sample Preparation (mPOP)樣本處理和TMT標記方法，優化了單細胞蛋白質組的實驗流程——SCoPE2。 Scope2研究系統主要是通過TMT的多通道優勢，將其中一個通道作為carrier cell通道，一般為20~200個細胞量的樣品，其他通道作為單細胞通道。各通道在完成TMT標記后進行混合上機檢測。該方法極大的提高了單細胞的檢測通量及鑒定深度。 基于scope2技術的單細胞蛋白質組學分析流程 https://doi: 10.1186/s13059-021-02267-5 三、中科新生命可實現超高通量的單細胞蛋白質組高深度檢測 單細胞蛋白質組學技術的難點和瓶頸主要在于單細胞內極其微量的蛋白質，上萬種蛋白質以極高的動態范圍、不同的拷貝數存在于一個單獨的細胞中，對樣品前處理、分離和質譜檢測提出了前所未有的挑戰。 中科新生命在單細胞的技術路線上不斷創新優化，經過反復測試，建立了從單細胞自動化分選到單個細胞層面的蛋白質組學的全流程服務，可實現一次性幾百個細胞的高通量檢測。下面就一睹為快中科新生命的單細胞蛋白質組學產品特色吧！ 產品特色1 ：多元化樣本類型，超高能力檢測 通過對哺乳動物細胞或者新鮮腫瘤組織的樣本進行單細胞懸液制備，經過細胞活力測定后，挑選合格的單個細胞，進行單細胞蛋白質組學分析，可實現單個細胞蛋白鑒定數量達1500+，實現了單細胞蛋白質組學的高深度檢測。 產品特色2：有效區分不同細胞群體 對兩種細胞群體各50個單細胞鑒定到的總蛋白質進行PCA分析，通過下圖可見，在單細胞層面的蛋白質組學可以非常好的分離出不同的細胞群體，說明在單個細胞層面的研究足以區分細胞亞群，為大規模單細胞蛋白組學的數據挖掘及功能分子尋找奠定了良好的基礎。 產品特色3：標志性蛋白篩選，有效挖掘功能分子 通過單細胞層面的結果分析，尋找特異性表達的蛋白。通過箱線圖的分布展示，可以發現差異較大的蛋白在不同細胞亞群中具有不同的分布，對發現重要的生物學功能提供了非常好的參考。 小結 從單細胞蛋白質組學角度展開研究非常具有必要性。首先，細胞作為生物體的基本單元，在特定的生理和病理下條件下，細胞之間存在極大的異質性；其次，蛋白質作為細胞內生物功能的直接執行者，通過蛋白質表達的變化，更直接地揭示細胞調控的本質。 中科新生命推出單細胞蛋白質組學新品服務，兼容新鮮組織類型，稀有細胞類，培養細胞等多種細胞類型，提供從單細胞分選，單細胞蛋白質組學檢測等全流程服務，歡迎各位老師咨詢。
編者按
“單”愿有你 | 單細胞蛋白質組學重磅來襲
作者：上海中科新生命生物科技有限公司 2021-12-27T19:05 (訪問量:4998)
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