Olink精準蛋白質組學助力腫瘤生物標志物開發-技術前沿-資訊-生物在線

Olink精準蛋白質組學助力腫瘤生物標志物開發

作者:上海中科新生命生物科技有限公司 2022-10-11T11:43 (訪問量:7971)


2022年“中國腫瘤標志物學術大會”召開在即。腫瘤標志物的測定,作為腫瘤診斷、監測治療的重要手段之一,結合病理活檢、影像學等可有效幫助腫瘤患者更好地實現精準治療。但遺憾的是,現階段腫瘤標志物的開發仍在持續探索中,低豐度蛋白的檢測是其中的一大難題。

癌癥登月計劃(Cancer Moonshot)旗下的癌癥免疫監測和分析中心選擇Olink作為低豐度蛋白標志物的核心檢測方法,為一系列項目提供細胞因子、趨化因子生長因子等的檢測和分析數據。今天小編來跟大家分享一下Olink蛋白質組學在腫瘤領域的應用,以期能給大家提供一些思路及靈感。


圖片來源鏈接:https://cimac-network.org/assays

1. 腫瘤早篩

文獻名稱Prospective identification of elevated circulating CDCP1 in patients years before onset of lung cancer

期刊Cancer Research(IF 12.701)

檢測平臺Olink-炎癥、mRNA-seq

樣本類型:血漿

研究內容:該研究通過olink96-炎癥panel檢測648個診斷前血液樣本,發現肺腺癌早篩標志物CDCP1,又通過mRNA-seq富集分析表明CDCP1在與細胞粘附和遷移相關的通路中具有潛在作用。




2. 預后分層

文獻名稱Identification of Potential Prognostic and Predictive Immunological Biomarkers in Patients with Stage I and Stage III Non-Small Cell Lung Cancer (NSCLC): A Prospective Exploratory Study

期刊Cancers(IF 6.575)

檢測平臺Olink-炎癥等

樣本類型:血漿

研究內容:該研究采用Olink蛋白質組學發現I期NSCLC陰性預后標志物CD244,III期NSCLC陽性生物標志物CR2、IFNGR2。此外,通過治療誘導的循環免疫原蛋白表達水平的變化確定CXCL10、IL-10為額外的陰性預測生物標志物。



3. 藥物療效

文獻名稱Plasma proteomics identifies Leukemia Inhibitory Factor (LIF) as a novel predictive biomarker of immune-checkpoint blockade resistance

期刊Annals of Oncology(IF 51.769)

檢測平臺Olink-1536、RNA-seq 等

樣本類型:血漿

研究內容:通過Olink蛋白質組學發現,在探索和驗證隊列中,白血病抑制因子(LIF)基線水平升高與接受ICB治療的癌癥患者較差的臨床結局相關,該癥狀獨立于其他預后因素。我們還證明了LIF的循環水平與腫瘤微環境中三級淋巴結構(TLS)的存在呈負相關。

文獻名稱In-depth plasma proteomics reveals increase in circulating PD-1 during anti-PD-1 immunotherapy in patients with metastatic cutaneous melanoma

期刊J Immunother Cancer(IF 12.469)

檢測平臺Olink-免疫腫瘤、質譜

樣本類型:血漿

研究內容:利用基于質譜+Olink的全局蛋白質組學分析了24名接受ICI治療CM患者和24名接受MAPKis治療CM患者的血漿蛋白組以確定ICI治療的特異性血漿蛋白水平的變化。結果顯示在抗PD-1治療期間循環PD-1的增加,以及在抗PD-1應答者中呈現多樣化的免疫血漿蛋白組學標志。



4. 腫瘤與其他疾病關聯研究

文獻名稱Inflammatory Leptomeningeal Cytokines Mediate COVID-19 Neurologic Symptoms in Cancer Patients

期刊Cancer cell(IF 38.585)

檢測平臺Olink-炎癥、Olink-神經探索等

樣本類型:腦脊液

研究內容:本研究采用Olink蛋白組學分析腦脊液中蛋白質的實時動態變化,發現II型干擾素驅動的柔腦膜炎癥細胞因子釋放可誘發神經系統損傷。延長型神經炎癥伴隨的細胞因子釋放綜合癥會導致長期神經認知障礙,這也預示對COVID-19感染引發的神經性并發癥治療需要干預免疫炎癥系統。

Olink作為目前流行的創新蛋白質組學研究方法,其獨特的PEA技術大大增加了樣本中低豐度蛋白的鑒定深度,輔助腫瘤生物標志物開發,推進腫瘤液體活檢的進程。
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