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【展后速遞】創新型酶法甲基化產品eTAPS亮相P4引關注

作者:翌圣生物科技(上海)股份有限公司 2021-10-25T18:59 (訪問量:18446)

【展后速遞】創新型酶法甲基化產品eTAPS亮相P4引關注

2021年10月22日,第五屆國際腫瘤精準醫療大會在北京朝陽悠唐**假日酒店盛大開幕。翌圣生物攜創新型甲基化酶法轉化試劑盒eTAPS亮相大會,引發行業關注。本次大會設有會場A:腫瘤早篩/輔助早診/分型/預后等技術創新與應用以及會場B:腫瘤創新藥物療法與標志物/伴隨研究的精準開發轉化兩個分會場。結合當下的腫瘤精準醫療大環境,深度探討CDx模式,LDT合規化路徑,液體活檢,腫瘤早篩等熱點話題,吸引近600名觀眾齊聚現場,共話腫瘤精準診療。

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翌圣生物高級產品經理徐正出席峰會并在腫瘤早診早篩分會場分享了主題為“eTAPS酶法轉化技術在甲基化檢測中的應用”精彩演講,從上游原料商的角度分享了新型的甲基化轉化技術在未來早篩市場的應用。首先從腫瘤早篩早檢是降低死亡率的重要路徑入手,引申到基于ctDNA的甲基化檢測是當前主流的早篩技術路徑。進而講述翌圣在甲基化檢測領域的的相關工作。

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Bisulfite化學法轉化是目前甲基化檢測最主流的前處理方案

甲基化檢測中需要前處理的轉化,即區分甲基化的胞嘧啶以及非甲基化的胞嘧啶。目前主流方案是通過Bisulfite處理,轉化效率高達99%甚至以上,但是其也有最為明顯的不足,會對DNA造成劇烈的損傷,且最終的回收率往往不足10%,這在一些珍稀樣本中如cfDNA中應用相對困難。此外,由于是將非甲基化的胞嘧啶轉化為尿嘧啶,這會導致最終的文庫出現堿基失衡的現象。

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前人的探索:甲基化檢測的“陰”與“陽”

在這過程中,不少企業學者已經基于此進行探索,比如NEB公司的EM-Seq技術,以及2019年發表的TAPS技術等。

前人的探索:甲基化檢測的“陰”與“陽”.jpg
EM-seq采用酶法轉化,但這也僅僅是降低了反應的劇烈性,本質上其與Bisulfite處理是同一種原理,不但未解決堿基失衡的問題,反而使得操作比Bisulfite更麻煩。此后也有學者提出了TAPS(TET-assisted pyridine borane sequencing)技術,基本能解決傳統Bisulfite以及EM-seq的不足。但依舊存在自己的問題,比如轉化率不高,操作繁瑣以及難以適應自動化等問題。
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基于此,目前翌圣開發的eTAPS轉化技術可作為未來理想的替換方案。通過定向進化獲得高活性高質量的eTeT1酶,以及對于流程的精簡優化,目前可實現一次氧化,單管操作磁珠回收,可完美適配未來自動化的需求。

目前基于內部的評測體系,eTAPS轉化效率、DNA回收效率以及錯誤率均優于Bisulfite,可作為其理想的替換方案。未來基于eTAPS的應用,還可延伸至三代測序領域。


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當然,基于eTAPS目前依舊缺乏足夠的終端應用場景去進行相關驗證,目前也僅是走出了第一步,我們也希望同下游客戶一起共同開發,推進eTAPS在腫瘤早篩早診技術領域的應用。

展區現場,翌圣生物相關技術負責人也想諸多的參觀者介紹了eTAPS目前相關的進展與數據,以及公司NGS相關產品完整的解決方案。


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