■ 植物代謝組學是以植物為研究對象，是代謝組學的重要分支。植物代謝組既包括對植物生長發育以及生命活動不可或缺的初級代謝物，如有機酸、氨基酸、核苷酸酸、碳水化合物、脂質分子等，還包括與植物抗脅迫等密切關系的次生代謝產物，如黃酮類、生物堿、酚類、醌類、萜類等。
■ 植物初級和次級代謝可以通過幾個主要的分支點相聯系，一些初生代謝的產物是次生代謝的關鍵起始物。比如乙酰輔酶A (Acetyl coenzyme A，Acetyl-CoA) 是一個重要“代謝樞紐”，它在三羧酸循環 (Tricarboxylic acid cycle，TCA)、脂肪代謝和能量代謝等初級代謝通路上占有重要地位，同時它又是次級代謝產物黃酮類化合物、萜類化合物和生物堿等的起始物（如下圖）。
植物非靶代謝組分析是最經典、應用最廣泛的植物代謝組學方法。通過對樣本中盡可能多的小分子化合物進行綜合、全面、無偏向性的高覆蓋檢測，可實現不同樣品間代謝特征的比較。
質譜的分辨率對于植物非靶代謝組分析至關重要，整合高掃描速度和高質量精確度的要求，高分辨質譜Q-Orbitrap（如QE系列質譜）或Q-TOF是滿足這些性能的最佳選擇，獲得的高分辨質譜譜圖信息有助于對代謝物進行精確鑒定。
APT植物代謝組技術優勢
1) APT植物專屬高質海量數據庫
· ＞2萬植物代謝物數據庫（＞1500 標準品自建數據庫 & 高質植物公共數據庫）
· 每個代謝物都包含MS1、MS2和RT（自建庫為標準品實驗RT，公共庫為基于機器學習算法的預測RT）信息
2) 定性更可靠 —— 最高可到 Level 1
一般認為的定性等級，請看下表：
· APT植物代謝組3重標準輔助定性
（備注：自建庫部分通過和標準品實驗RT比對可以達到Level 1的鑒定等級）
· 增加保留時間（Retention time, RT）維度可以降低假陽性，提高復雜生物樣本中代謝物定性準確度
保留時間算法輔助鑒定示意圖
3) 高分辨質譜平臺 ——定性和定量能力的完美結合
· QE高分辨質譜采集，超高質量精度（3 ppm以內）輔助定性
· 同時高分辨更好降低復雜基質中質量數接近的物質的干擾，使得定量更準確
APT植物代謝組技術路線
APT植物代謝組實測結果
常規樣本（擬南芥、水稻等）可以定性到800-900代謝物
以擬南芥樣本為例：
APT植物代謝組擬南芥實測代謝物分類信息
APT植物代謝組擬南芥實測代謝物分類示例
應用方向
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