開發出可測定細胞內RNA甲基化修飾的新技術-國內聚焦-資訊-生物在線

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開發出可測定細胞內RNA甲基化修飾的新技術

作者:上海滬震實業有限公司 2016-08-05T12:18 (訪問量:5562)

近日,刊登在國際雜志Nature Methods上的一篇研究報道中,來自加州大學洛杉磯分校的研究人員通過研究開發了一種新型的RNA測序技術,其可以提供RNA上發生的化學修飾的詳細信息,相關信息對于多潛能干細胞轉化為其它類型的細胞非常重要,該研究或可幫助研究者利用干細胞開發新型的再生醫學療法。

研究者表示,這種新型測序技術可以測定基因組中每一個基因轉錄成的RNA分子發生甲基化的比例,RNA分子在細胞中扮演著重要的角色,其攜帶著DNA的遺傳信息,這些信息可以指導細胞制造多種蛋白,從而在機體中發揮重要作用,但一旦產生的信息發生錯誤就會引發多種疾病的發生,包括癌癥和神經變性疾病等。
截止到目前為止,研究者并不是非常清楚甲基化作用調節RNA分子活性的分子機制,而本文研究中研究者通過觀察并分析名為m6A或N6甲基腺苷的特殊類型的RNA甲基化修飾,這種化學修飾具有多種功能,比如其可以控制RNA在細胞中的存活時間以及其翻譯產生蛋白質的量,m6A在產生蛋白質的RNA中是最豐富的一種RNA甲基化。
研究者Yi Xing說道,此前我們僅僅能確定m6A在RNA中的位置,并不能確定其水平如何,而本文中我們則可以確定m6A在RNA中的比例,而這或許就為我們提供了必要的信息來幫助檢測多種疾病;相比在健康細胞中而言,m6A在RNA中的水平或許是不同的,而且研究者也利用m6A水平相關的信息可以深入研究多能干細胞轉化成為其它類型細胞的能力。多能干細胞有兩種特性,其可以轉化成為機體中任何特殊類型的細胞,比如皮膚、骨骼、血液或腦細胞等,該過程稱之為分化,同時其還可以復制產生多個多能干細胞,多能干細胞所具有的這些能力可以幫助開發新型的再生醫學療法;但如今科學家們非常感興趣去理解如何控制多能干細胞分化成為特殊類型的細胞,另外一項挑戰就是就是如何在實驗室中維持多能干細胞的功能和特性,因為這些細胞易于發生自發性分化,從而導致科學家們往往難以控制多能干細胞的命運。
此前研究者Xing及其同事通過研究發現,阻斷m6A就可以抑制多能干細胞分化成為特殊類型的細胞,同時還可以促進多能干細胞維持其關鍵的多能性和靈活性;本文研究中,研究者開發出了這種名為m6A-LAIC-seq的新方法,該方法可以通過利用特殊機器產生成百上千萬個RNA測序數據來幫助研究者獲取有價值的數據,并且可以幫助研究者深入理解細胞的分子特性。
最后研究者說道,我們非常激動可以獲得這些重要的數據,目前利用這種新方法我們就可以對包括多能干細胞在內的一系列細胞中的m6A進行研究,相信通過后期更為深入的研究,我們將會更加深入地理解并且利用多能干細胞來開發新型再生醫學療法。
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