技術介紹 | MRM定制靶標-技術前沿-資訊-生物在線

技術介紹 | MRM定制靶標

作者:上海阿趣生物科技有限公司 2021-09-09T10:06 (訪問量:10898)

定制靶標檢測是以標準品為參考,針對特定某一物質或一類代謝物進行檢測的代謝組學方法,選擇特異性的樣本前處理方法,優化色譜分離及質譜條件等對這些代謝物進行最優化檢測,大大提高了檢測的靈敏度、準確性、特異性及重現性,從而對目標代謝物進行絕對定量研究。

技術優勢


定性準確:基于標準品開發物質,樣本物質二級譜和標品二級譜逐一核對;

定量精確:選擇最優離子對,確保物質精確定量;

靈敏度高:基于先進的質譜平臺,靈敏度可達pg級;

研發團隊經驗豐富:脂質、維生素、氨基酸、生物堿、有機酸等物質開發經驗。

技術路線


技術參數


樣本要求

植物組織:200-500mg/sample

動物及臨床組織標本:200mg/sample

血清、血漿:200μL/sample

微生物、細胞:1X107cells/sample

尿液:1mL/sample

生物學重復

臨床標本不低于30個生物學重復

動物樣本不低于10個生物學重復

植物、微生物樣本不低于6個生物學重復

檢測平臺

ABSciexQTRAP? 6500+

常規項目周期

實驗檢測:45個自然日

數據分析:5個自然日

應用方向

1、目標代謝物的準確定量;

2、組學數據和實驗結果的驗證;

3、針對特定代謝物研究代謝模型。

案例分析


急性缺血性中風(AIS)代謝生物標志物的發現


中風仍然是全球主要的公共健康問題,它會導致嚴重的殘疾和較高的死亡率。然而中風的早期診斷是困難的,目前還沒有建立可靠的生物標志物。最近,代謝組學研究為生物標志物的發現提供了新的思路。本研究首先通過非靶標代謝組對40例AIS患者和40例健康血清樣進行檢測,篩選出26個差異代謝物質,然后用靶標代謝組學對潛在標志物進行驗證,篩選出5種可以作為AIS的潛在biomaker,為AIS未來的診斷和治療發展提供了研究基礎。


圖1 本研究設計思路流程圖


圖2 不同潛在生物標志物評估


圖3 AIS潛在生物標志物的生物學意義示意圖


參考文獻:


LiuP, Li R, Antonov A A, et al. Discovery of Metabolite Biomarkers for Acute Ischemic StrokeProgression[J]. Journal of Proteome Research, 2017, 16(2):773-779.

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