「撥云見日」① | 茶葉樣本植物代謝組實測數據大公開-自主發布-資訊-生物在線

「撥云見日」① | 茶葉樣本植物代謝組實測數據大公開

作者:上海阿趣生物科技有限公司 2023-03-10T15:04 (訪問量:13255)

植物代謝組是以植物為研究對象的代謝組學,研究不同物種、不同基因類型或不同生態類型的植物在不同生長時期或受某種刺激前后的所有小分子代謝產物,對其進行定性、定量分析,并找出代謝變化的規律。

百趣2022年植物領域重磅產品植物代謝組,自問世以來備受研究學者關注。那么它具有哪些優勢呢?

優勢一高品質海量植物數據庫

植物代謝組具有包含20000+種植物初、次級代謝物,囊括近20000種植物且超98%代謝物具有參考文獻來源的全新的、高品質的、海量的植物專屬數據庫。

優勢二專業且科學的物質分類植物代謝組數據庫是物質分類覆蓋三個層級,分類更加科學且專業,從7個一級分類到400+的三級分類,提供了全面的、多層級的物質分類,可滿足不同研究者對于物質分類細致程度不同的需求。

優勢三

數據質量優,檢出水平高

植物代謝組采用OE超高分辨質譜檢測,超高質量精度輔助定性,同時高分辨可更好降低復雜基質中質量數接近的物質的干擾,使得定量更準確。

采用植物代謝組的組學技術對不同的物種進行檢測,可定性到1000-1400種代謝物,如不同種類茶葉樣本平均檢出近1300種代謝物。我們知道在植物中,物種和組織部位間具有很大的代謝差異。

因此,我們將按照樣本的物種、組織類型等進行植物代謝組實測數據的大公開。

數據大公開:【茶葉樣本】植物代謝組檢測數據多維展示

本周,我們看一看植物代謝組在經典樣本類型——茶葉檢測中的表現。

代謝物檢出水平:高

我們可以發現,來自不同產地的不同種類茶葉的平均物質檢出在1300左右,有的檢出甚至高達1600+。

代謝物檢出類別:廣

檢出數量在茶葉樣本類型中的精彩展現已然絢麗,但更吸引人的在這里,我們對以上6種茶葉的檢出代謝物的物質類別分析發現:

在所有茶葉樣本中的初級代謝物(如碳水化合物、脂肪酸、氨基酸及短肽)檢出為200種左右,而次級代謝物檢出基本維持在800+種。

了解了實測結果中次級代謝物占比高,那么其主要覆蓋了哪些具體類別呢?接下來我們以莽草酸及苯丙酸類、萜類為例揭示所覆蓋的次級代謝物的具體類別。

我們可以看出莽草酸及苯丙酸類又可以分為黃酮、異黃酮、酚酸、香豆素、木脂素等類別,其中黃酮類、香豆素類別占比較高,而黃酮類中黃酮醇占比最高。

實測結果中萜類可以分為倍半萜、單萜類、萜類等,其中倍半萜類物質在萜類中占比較高,對單萜類進行三級分類分析發現薄荷酮類單萜占比較高。

從以上茶葉樣本的二級、三級分類上來看,次級檢測代謝物覆蓋類別非常豐富。所有的類別代謝物在不同的種類茶葉中都是有差異的,因此對于代謝物的檢測不能僅限于某一類,最好能覆蓋到所有的類型。

當然,以上的數據僅為不同種類茶葉樣本項目的實測數據,也不等于最終您樣品中的檢出情況。針對不同的處理,不同的生長條件,不同的品種,以上數據都有差異,因此我們需要根據自己的樣品來進行實際分析。

代謝物數據分析內容:全 植物代謝組20+項數據分析內容可分為基礎數據分析與高級數據分析,覆蓋了從差異代謝物篩選到差異代謝物的功能分析的由淺入深式有用信息挖掘,為您帶來更為全面細致的數據挖掘體驗。

分析內容一覽圖

代謝物數據分析內容:豐富 20+項數據分析內容,無論是差異代謝物篩選的火山圖還是差異代謝物功能分析的差異代謝物調控網絡分析圖,植物代謝組無一例外都帶來了精美且符合發文需求的數據分析圖。接下來將為您具體舉例:

相關性熱圖

K-Means圖

KEGG分類圖

差異豐度得分圖

看完植物代謝組在不同種類茶葉中的精彩表現您心動了嗎?現在聯系我們,我們將會針對您的科研課題提供一對一的專屬技術服務。

本期關于茶葉樣本植物代謝組實測數據的分享就到這里結束啦~本系列推文共8期,第二期是什么樣本類型呢?讓我們一起期待一下!

上海阿趣生物科技有限公司 商家主頁

地 址: 嘉定區新培路51號焦點夢想園5層

聯系人: 高小姐

電 話: 400-664-9912

傳 真:

Email:marketing@biotree.cn

相關咨詢

Circulation (IF=38.7)|上海兒童醫學中心張浩/劉一為聯合南京鼓樓醫院王東進團隊破解肥胖心衰患者LVAD療效困局,胰島素增敏劑點亮心肌恢復新希望! (2026-04-25T00:00 瀏覽數:7955)

J. Adv. Res. (IF=13)|血漿蛋白質組學賦能:暴發性心肌炎精準診斷與靶向治療新突破 (暫無發布時間 瀏覽數:7476)

NP(IF=8.1)|西北農林研究團隊解碼黑枸杞“高品質密碼”:光響應轉錄調控網絡如何驅動類黃酮合成與藥用活性? (暫無發布時間 瀏覽數:7501)

LWT(IF=6.6)|四川大學研究團隊通過同位素標記代謝流與脂質組學的“夢幻聯動”,帶你看清酵母的耐鹽策略 (暫無發布時間 瀏覽數:8162)

破微量極限,啟代謝新程|微量NGM 3 Pro,以微量樣本,全景解碼生命代謝 (暫無發布時間 瀏覽數:8179)

JEP (IF=5.4)|福建中醫藥大學研究團隊:多組學揭秘丹瓜方調控GLUD1改善糖尿病代謝機制 (暫無發布時間 瀏覽數:9409)

Food Chem.(IF=9.8)|南農陳暄教授研究團隊多組學揭秘:云南“金花茶”的風味煉金術—匍匐散囊菌如何點“茶”成“香”? (暫無發布時間 瀏覽數:9677)

J.Agric.Food Chem.(IF=6.2)|中國熱科院胡偉/丁澤紅團隊突破性成果!解碼木薯塊根3類蛋白修飾圖譜,解鎖淀粉積累與抗逆調控密碼 (暫無發布時間 瀏覽數:9863)

nat commun(IF=15.7)|北大白玉教授團隊突破靜態局限:動態單細胞代謝組學揭秘腫瘤-巨噬細胞互作新機制 (暫無發布時間 瀏覽數:11428)

nat.commun.(IF=15.7)|復旦大學附屬中山醫院詹成團隊:靶向多胺代謝提升KRAS靶向藥療效 (暫無發布時間 瀏覽數:12678)

ADVERTISEMENT