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「撥云見日」① | 茶葉樣本植物代謝組實(shí)測數(shù)據(jù)大公開

作者:上海阿趣生物科技有限公司 2023-03-10T15:04 (訪問量:14214)

植物代謝組是以植物為研究對象的代謝組學(xué),研究不同物種、不同基因類型或不同生態(tài)類型的植物在不同生長時期或受某種刺激前后的所有小分子代謝產(chǎn)物,對其進(jìn)行定性、定量分析,并找出代謝變化的規(guī)律。

百趣2022年植物領(lǐng)域重磅產(chǎn)品植物代謝組,自問世以來備受研究學(xué)者關(guān)注。那么它具有哪些優(yōu)勢呢?

優(yōu)勢一高品質(zhì)海量植物數(shù)據(jù)庫

植物代謝組具有包含20000+種植物初、次級代謝物,囊括近20000種植物且超98%代謝物具有參考文獻(xiàn)來源的全新的、高品質(zhì)的、海量的植物專屬數(shù)據(jù)庫。

優(yōu)勢二專業(yè)且科學(xué)的物質(zhì)分類植物代謝組數(shù)據(jù)庫是物質(zhì)分類覆蓋三個層級,分類更加科學(xué)且專業(yè),從7個一級分類到400+的三級分類,提供了全面的、多層級的物質(zhì)分類,可滿足不同研究者對于物質(zhì)分類細(xì)致程度不同的需求。

優(yōu)勢三

數(shù)據(jù)質(zhì)量優(yōu),檢出水平高

植物代謝組采用OE超高分辨質(zhì)譜檢測,超高質(zhì)量精度輔助定性,同時高分辨可更好降低復(fù)雜基質(zhì)中質(zhì)量數(shù)接近的物質(zhì)的干擾,使得定量更準(zhǔn)確。

采用植物代謝組的組學(xué)技術(shù)對不同的物種進(jìn)行檢測,可定性到1000-1400種代謝物,如不同種類茶葉樣本平均檢出近1300種代謝物。我們知道在植物中,物種和組織部位間具有很大的代謝差異。

因此,我們將按照樣本的物種、組織類型等進(jìn)行植物代謝組實(shí)測數(shù)據(jù)的大公開。

數(shù)據(jù)大公開:【茶葉樣本】植物代謝組檢測數(shù)據(jù)多維展示

本周,我們看一看植物代謝組在經(jīng)典樣本類型——茶葉檢測中的表現(xiàn)。

代謝物檢出水平:高

我們可以發(fā)現(xiàn),來自不同產(chǎn)地的不同種類茶葉的平均物質(zhì)檢出在1300左右,有的檢出甚至高達(dá)1600+。

代謝物檢出類別:廣

檢出數(shù)量在茶葉樣本類型中的精彩展現(xiàn)已然絢麗,但更吸引人的在這里,我們對以上6種茶葉的檢出代謝物的物質(zhì)類別分析發(fā)現(xiàn):

在所有茶葉樣本中的初級代謝物(如碳水化合物、脂肪酸、氨基酸及短肽)檢出為200種左右,而次級代謝物檢出基本維持在800+種。

了解了實(shí)測結(jié)果中次級代謝物占比高,那么其主要覆蓋了哪些具體類別呢?接下來我們以莽草酸及苯丙酸類、萜類為例揭示所覆蓋的次級代謝物的具體類別。

我們可以看出莽草酸及苯丙酸類又可以分為黃酮、異黃酮、酚酸、香豆素、木脂素等類別,其中黃酮類、香豆素類別占比較高,而黃酮類中黃酮醇占比最高。

實(shí)測結(jié)果中萜類可以分為倍半萜、單萜類、萜類等,其中倍半萜類物質(zhì)在萜類中占比較高,對單萜類進(jìn)行三級分類分析發(fā)現(xiàn)薄荷酮類單萜占比較高。

從以上茶葉樣本的二級、三級分類上來看,次級檢測代謝物覆蓋類別非常豐富。所有的類別代謝物在不同的種類茶葉中都是有差異的,因此對于代謝物的檢測不能僅限于某一類,最好能覆蓋到所有的類型。

當(dāng)然,以上的數(shù)據(jù)僅為不同種類茶葉樣本項(xiàng)目的實(shí)測數(shù)據(jù),也不等于最終您樣品中的檢出情況。針對不同的處理,不同的生長條件,不同的品種,以上數(shù)據(jù)都有差異,因此我們需要根據(jù)自己的樣品來進(jìn)行實(shí)際分析。

代謝物數(shù)據(jù)分析內(nèi)容:全 植物代謝組20+項(xiàng)數(shù)據(jù)分析內(nèi)容可分為基礎(chǔ)數(shù)據(jù)分析與高級數(shù)據(jù)分析,覆蓋了從差異代謝物篩選到差異代謝物的功能分析的由淺入深式有用信息挖掘,為您帶來更為全面細(xì)致的數(shù)據(jù)挖掘體驗(yàn)。

分析內(nèi)容一覽圖

代謝物數(shù)據(jù)分析內(nèi)容:豐富 20+項(xiàng)數(shù)據(jù)分析內(nèi)容,無論是差異代謝物篩選的火山圖還是差異代謝物功能分析的差異代謝物調(diào)控網(wǎng)絡(luò)分析圖,植物代謝組無一例外都帶來了精美且符合發(fā)文需求的數(shù)據(jù)分析圖。接下來將為您具體舉例:

相關(guān)性熱圖

K-Means圖

KEGG分類圖

差異豐度得分圖

看完植物代謝組在不同種類茶葉中的精彩表現(xiàn)您心動了嗎?現(xiàn)在聯(lián)系我們,我們將會針對您的科研課題提供一對一的專屬技術(shù)服務(wù)。

本期關(guān)于茶葉樣本植物代謝組實(shí)測數(shù)據(jù)的分享就到這里結(jié)束啦~本系列推文共8期,第二期是什么樣本類型呢?讓我們一起期待一下!

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