伯豪生信云系統自2023年11月上線以來，已經上架79個生信小工具。其中單細胞多組學專項工具21個，囊括Marker基因可視化，細胞占比分析，差異分析，功能富集，基因集打分等多種分析方法。下面我們精選用戶使用次數最多的10個實用單細胞多組學小工具，進行詳細的功能介紹！
伯豪生信云網址：
http://tools.shbio.com/home/index.html
1. 單細胞核RNA測序項目經驗查詢
冰凍樣本做單細胞核RNA測序（snRNA-seq）能夠檢測到多少細胞和基因？能不能注釋到關注的細胞類群，目標細胞群細胞占比怎么樣？單細胞核RNA測序項目經驗查詢，一鍵告訴您全部答案，解除您的后顧之憂！
2. Marker基因氣泡圖
想要展示marker基因在不同cluster中表達特異性？更想快速根據marker基因的表達進行人工細胞注釋？Marker基因氣泡圖很好使！Marker基因氣泡圖用于展示多個marker基因在不同cluster或不同細胞類群中的表達情況。
3. 基因tSNE/UMAP圖
選擇感興趣的基因，在tSNE或者UMAP坐標下，展示其在單細胞中所有亞群的表達情況。顏色越深說明該基因表達量越高。適用于展示每個細胞類群的marker基因表達特異性。
4. 細胞占比分析_堆疊柱形圖
細胞占比分析，通過堆疊柱形圖展示多樣本中每個cluster或者每種細胞類群中的細胞數和細胞比例。
cluster差異基因火山圖酷炫展示每個cluster中顯著差異上調和差異下調的基因?？焖倭私獠煌毎惾旱幕虿町惐磉_情況。
6. KEGG富集分析
KEGG功能富集分析用于探究關注的基因集合（如差異表達基因、cluster特異表達基因）的通路富集情況。該工具進行富集分析并輸出富集分析結果表、富集氣泡圖和柱形圖。
7. signature基因集表達熱圖
探究關注的基因集合（如缺氧，自噬，鐵死亡等相關基因集合）在不同細胞群中的表達情況，對特定基因集中的基因表達量進行可視化。
8. 基因集打分的tSNE/UMAP圖
識別關注的單個基因集或多個基因集（如缺氧，自噬，鐵死亡等相關基因集合）在細胞中富集的情況，該工具根據多個基因集中對應基因表達量對每個細胞進行打分（采用GSVA包中的ssgsea打分算法），展示多個功能在細胞中的富集情況。
9. Marker基因切片圖
Marker基因切片圖用于展示關注的目標基因（一個或多個基因）在空轉組織切片中的表達情況，探究目標基因的表達及空間位置信息。
10. 基因集打分切片圖
展示目標基因集（如缺氧相關基因，鐵死亡相關基因）或相關通路中的基因在組織切片中富集的情況，探究目標基因集或相關通路在組織中的哪些區域被顯著激活。