空間組學長期面臨「不可能三角」（大視野、高分辨率、全轉錄組無法兼得），以及靈敏度與通量之間的矛盾。過去的技術總是在通量、靈敏度、基因覆蓋之間顧此失彼。而Atera憑借全轉錄組覆蓋、單細胞級靈敏度與高通量靈活性，徹底打破了這一困局，為空間生物學研究提供了全新的可能。
Atera儀器
01
Atera技術亮點
全轉錄組覆蓋
Atera檢測基因數>18,000（覆蓋絕大部分蛋白編碼基因），還可額外定制1,000個基因，不再局限于靶向Panel。并且將支持更多物種的檢測。
Atera官方實測數據—臨床宮頸癌樣本中主要細胞類型的空間定位
單細胞分辨率
基于原位成像及多模態細胞分割技術，像素尺寸約0.2 μm，能夠實現真正的單細胞甚至亞細胞分辨率。
Atera官方實測數據—組織樣本分子水平上不同的細胞狀態
超高靈敏度
多輪獨立及技術重復實驗驗證了Atera的高靈敏度、高特異性、低假陽性水平與高穩定性。
Atera官方實測數據—驗證靈敏度、特異性與穩定性
A.多次實驗運行下，組織單個細胞的轉錄本數量（靈敏度分析）。B. 同一組織中，Atera WTA 與 Chromium Single Cell Flex Apex單細胞技術的基因檢出相關性為 r² = 0.75。C. 同一玻片上兩次技術重復，細胞轉錄本數量相關性為 r² = 0.99。
根據10x 官方發布的數據集，對比同一塊組織在Xenium v1和Atera的數據，及相同組織類型在Xenium及Atera的數據，Atera的基因中位數及中位轉錄本數等指標（靈敏度），提升了一個數量級以上，約15倍-20倍。超高的靈敏度可以幫助我們檢測組織微環境中新的細胞狀態、新的相互作用、稀有細胞類型等。
超大視野，高通量
捕獲面積>5cm2/每張，運行最多4張/次芯片，可分析800cm2樣本/年，支持：FF、FFPE、組織芯片（TMA）。
Atera更大視野芯片
多組學拓展
同一切片可實驗RNA表達+形態學（H&E染色）檢測，未來將支持空間蛋白檢測。除全轉錄組方案外，可定制靶向Panel定制（額外加1,000基因，或自定義2,000基因Panel，自定義3,000基因Panel即將推出），適用于SNV、可變剪切、CRISPR gRNA、病原體序列等檢測。
Atera將支持更多空間組學研究
02
Atera原位空間分析實測數據
近日，10X官方更新了Atera的實測數據。目前的2例數據檢測了乳腺癌和宮頸癌的FFPE樣本。從結果來看，Atera全轉錄組檢測表現優異，靈敏度與數據產出均大幅領先于Xenium。
乳腺癌FFPE樣本實測對比
實測樣本：WTA Breast Cancer (FFPE)，Atera轉錄本檢出與數據產出能力顯著優于Xenium。
宮頸癌FFPE樣本實測對比
實測樣本：WTA Cervical Cancer (FFPE)，Atera依舊表現出高檢出、高靈敏度優勢。
從這兩個釋放的實測數據我們可以看出，相比于Xenium，Atera的全轉錄組分析方案可全面覆蓋18000+編碼基因，徹底擺脫Panel限制；其單細胞中位轉錄本檢出量較Xenium提升8–15倍，憑借更高的檢測靈敏度、更大的組織捕獲面積及更強的數據產出能力，進一步助力更廣泛深刻的空間轉錄組學研究。
03
三大空間組學平臺技術對比
· Visium HD：空間研究的“發現工具”
基于 NGS 的全轉錄組方案，適合低成本、大范圍探索（如空間圖譜構建、差異篩選），是空間發現的“第一步”。但其分辨率是“接近單細胞”（8 μm bin），對不規則或相鄰細胞區分有限。
· Xenium：空間研究的“驗證工具”
基于成像的靶向檢測，單細胞級分辨率（0.2 μm），超高靈敏度，能檢測到Visium HD“看不到”的信號。Xenium的檢測結果可以與免疫組化（IHC）、高通量空間蛋白組數據直接比對，可驗證關鍵細胞類型和信號通路。簡單來說，Xenium是把Visium HD的發現拿到單細胞層面去驗證、去定位、去深挖。但覆蓋基因最多5,000–6,000 個，不適合無預設靶點的發現研究。
· Atera：Xenium的“全轉錄組升級版”
融合了成像的單細胞分辨率與全轉錄組覆蓋（>18,000基因，可額外定制1,000 基因），單張玻片成像面積>500 mm²，一次運行最多4張玻片，通量大。
Atera填補了Visium HD和Xenium之間的空白，既能像Visium HD一樣無偏發現，又能像Xenium一樣看清單個細胞。