單個細胞或有限的樣本進行高度均一的全基因組擴增-產品資訊-資訊-生物在線

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單個細胞或有限的樣本進行高度均一的全基因組擴增

作者:杭州聯科生物技術股份有限公司 2014-10-02T23:16 (訪問量:5415)

您是否需要探索單細胞中的遺傳信息?我們為您提供解決方案!使用QIAGEN專用于單細胞或少量細胞樣本的分析試劑盒,即可了解單細胞基因組和轉錄組序列信息。創新的多重置換擴增(MDA)技術能夠可靠擴增單細胞或少量樣本中的全基因組或全轉錄組。

REPLI-g Single Cell Kit可均一的擴增單個細胞(1至1000個細菌或腫瘤細胞)或純化的基因組DNA,能夠覆蓋基因組所有位點。所有緩沖液和試劑生產都經過嚴格控制的流程,避免污染DNA,確保每次實驗獲得可靠的結果。該產品采用多重置換擴增(MDA)技術,對所有基因組位點進行無偏差的擴增。與基于PCR的全基因組擴增技術相比,該技術具有更好的擴增高保真度,避免出現假陽性或假陰性信號。

REPLI-g Single Cell Kit含有REPLI-g sc Polymerase,這是一種優化的新型高保真Phi 29聚合酶。該試劑盒采用多重置換擴增技術擴增復雜的基因組DNA,溫和的堿孵育能夠避免DN**段化,促進對所有位點的無偏差擴增。該試劑盒十分適用于分離的腫瘤細胞或細菌細胞等單一細胞,能夠擴增獲得高產量DNA(參見表1)。此外,該試劑盒還配有專用于鮮血或干血、新鮮或冷凍組織的實驗方案,可用于多種研究樣本。常規DNA產量可達40 μg,對模板的起始量要求低,因此進行后續遺傳分析時無需檢測DNA濃度。REPLI-g Single Cell Kit的擴增產物平均長度超過10 kb,且覆蓋所有位點,適合于多種應用,包括二代測序、基于芯片技術的比較基因組雜交、焦磷酸測序和real-time PCR分析(參見表2)。

表1. 樣本類型和研究領域

樣本類型(細胞/DNA)

研究領域

人類/動物

生物標記物研究(SNP、突變、CNV)

干細胞研究

循環胚胎細胞分析

嵌合體研究

遺傳易感性研究

轉基因動物基因分型

癌癥

體細胞遺傳變異分析

腫瘤惡化

腫瘤干細胞/進化

循環腫瘤細胞分析

細菌

宏觀基因組學研究

病原體分析

微生物基因分型

Plants*

植物氣孔研究

花粉分析

* 沒有細胞壁的細胞或純化的基因組DNA。

表2. 下游應用和儀器

應用

儀器

全基因組測序

二代測序平臺?

外顯子組測序

SNP基因分型芯片

芯片平臺?

Array CGH

qPCR/PCR技術

Real-time PCR/PCR儀?

Sanger測序

毛細管測序儀?

焦磷酸測序

PyroMark (QIAGEN)

? 多家供應商均有銷售

表3. REPLI-g Single Cell Kit的成

試劑盒成分

優勢

REPLI-g sc Polymerase

最長可達70 kb的長片段

保真性是Taq聚合酶的1000倍

覆蓋所有位點

均一擴增所有位點

REPLI-g sc Reaction Buffer?

對所有位點進行無偏差的擴增

Buffer DLB (裂解和變性)

高效擴增

不損傷DNA

紫外線照射去除污染

減少可檢測到的殘留DNA污染

? 含有鹽、引物和dNTP

    表 4. 多種REPLI-g Kits的規格

    產品名稱

    REPLI-g Single Cell

    REPLI-g Mini

    REPLI-g UltraFast Mini

    REPLI-g Midi

    REPLI-g Screening

    REPLI-g FFPE

    REPLI-g Mitochondrial DNA

    產品貨號

    150343/ 150345

    150023/ 150025

    150033/ 150035

    150043/ 150045

    150126

    150243/ 150245

    151023

    起始材料

    單一細胞、gDNA

    純化的基因組DNA、血液、細胞

    純化的基因組DNA、血液、細胞

    FFPE組織、FFPE組織中純化的基因組DNA

    純化的基因組DNA

    另外提供其他起始材料的實驗方案

    起始量

    單一細胞、2–1000各細胞、組織、純化的gDNA (1–10 ng)

    >10 ng gDNA、0.5 μl血液或細胞(>600個細胞/μl)

    >10 ng gDNA、0.5 μl血液或細胞(>600個細胞/μl)

    組織切片(直徑1 cm,厚度10–40 μm);>100 ng gDNA

    >1 ng純化的gDNA

    產量(μg/反應)

    40

    10

    7–10

    40

    8

    標準產量:≤10; 高產量:≤40

    3–5

    反應時間

    8–16小時

    10–16 小時

    1.5小時

    8–16小時

    12–16小時

    標準產量:4小時;高產量:10小時

    8小時

    手動操作時間

    15分鐘

    15分鐘

    15分鐘

    15分鐘

    15分鐘

    40分鐘

    15分鐘

    規格

    反應管

    反應管

    反應管

    反應管

    孔板


    以上信息來源QIAGEN

    http://www.qiagen.com/cn/products/catalog/sample-technologies/dna-sample-technologies/genomic-dna/repli-g-single-cell-kit/#productdetails




    閱讀原文:http://www.liankebio.com/ProductCenterShow/articleID/2014100002.html

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