FFPE樣本保存久了，提出來的DNA還能用來NGS測序嗎-產品資訊-資訊-生物在線

FFPE樣本保存久了，提出來的DNA還能用來NGS測序嗎

作者：杭州聯科生物技術股份有限公司 2015-07-16T09:56 (訪問量:19217)

FFPE為福爾馬林固定、石蠟包埋的（Formalin-Fixed and Parrffin-Embedded，FFPE）的樣本。這類病理樣本包含珍貴且來源廣泛的生物醫學研究材料。由于甲醛固定樣品會隨機產生C-T轉化，且FFPE樣本在保存過程中會有核酸的損失，所以如何去除FFPE樣本中產生的假陽性及提高FFPE樣本中核酸的得率，如何處理樣本及挖掘其中有效準確的信息成為現在研究的挑戰。

QIAGEN 作為全球樣本制備及分析純化的領導者，針對以上兩點為廣大FFPE樣本研究者提供了完美的解決方案：

脫蠟

純化

下游NGS分析

數據解讀

GeneRead DNA FFPE Kit采用基于硅膠模離心柱的優化實驗方案，能夠從福爾馬林固定、石蠟包埋（FFPE）組織樣本中純化出高品質基因組DNA。由于胞嘧啶的脫氨作用所導致的C>T人為突變現象在二代測序技術中影響很大。此類人為突變由福爾馬林固定以及樣本老化所引發，會導致測序結果產生偏差。GeneRead FFPE純化步驟中引入了酶促處理，能夠消除此類人為突變，從而保證了基因組DNA的產量高、純度好，特別適用于二代測序應用。

特點

試劑盒包含脫蠟液
采用優化的裂解液，可從FFPE樣品中高效回收gDNA
酶促反應去除胞嘧啶脫氨產物
最大限度減少假陽性SNP檢出風險
在DNA測序應用中獲得出色結果
可在QIAcube全自動核酸純化儀上自動運行

QuantiMIZE系統:

當然，還有很多研究者會提出：我的FFPE樣品保存了有點久了，提出來的DNA 還能用嗎？
QIAGEN為您提供FFPE樣本質控：QuantiMIZE系統。

QuantiMIZE系統工作原理：

*只有PCR質控才能真實反映下游PCR的可能結果。

相關產品列表：

貨號	產品名稱	規格	備注
19093	Deparaffinization Solution (16 ml)	2*8 ml	脫蠟液
180134	GeneRead DNA FFPE Kit	50次	FFPE樣本抽提DNA，減少人為C>T突變
180654	GeneRead DNA QuantiMIZE Assay Kit		FFPE樣本DNA質控

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