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英文標題:GPR25 promotes the formation of lung and liver tissue-resident memory CD8 T cells
中文標題:GPR25促進肺和肝組織——常駐記憶CD8 T細胞的形成
發表期刊:Science Immunology
影響因子:16.3
研究背景
組織駐留記憶CD8 T(TRM)細胞提供關鍵的抗病毒和抗腫瘤免疫,但指導其發展的分子途徑尚未完全確定。
研究團隊發現G蛋白偶聯受體GPR25是由轉化生長因子-β(TGF-β)信號誘導的TRM細胞形成的調節劑。研究結果表明,調節GPR25功能可能為改善感染和癌癥中的TRM細胞反應提供一種治療策略。
研究結果
01 -TGF-β誘導CD8 T細胞中GPR25的表達
免疫細胞表達、eQTLs和表觀基因組學數據庫的分析證實,與非TRM細胞亞群和循環CD8 T細胞亞群相比,GPR25和TRM細胞相關基因在肺TRM細胞中顯著富集(圖1A-B)。TGF β處理可快速誘導原代人CD8 T細胞中GPR25的表達,這些細胞通過抗CD3和抗CD28 抗體在體外多克隆激活(圖1C)。與非TRM細胞相比,GPR25轉錄起始位點上游的三個區域(C1、C2和C3),在腫瘤浸潤性TRM細胞中顯示出突出的轉座酶可及峰(ATAC-seq峰),表明GPR25的表達可能受到這些信號通路的共同調節(圖1D)。
與在人T細胞中觀察到的類似,在體外通過TCR和CD28交聯激活的小鼠CD8 T細胞中,TGF-β有效誘導Gpr25的表達,但其表達水平隨時間逐漸下降(圖1E)。此外,在未處理的野生型C57BL/6小鼠中,表達 TRM細胞標記物CD69的小腸上皮內淋巴細胞(siIELs)和肝臟 T細胞等非淋巴器官中的CD8 T細胞表達更高水平的Gpr25轉錄物,而脾CD8 T細胞顯示出最小的Gpr25表達(圖1F)。因此,在小鼠和人類中,GPR25是TGF-β誘導基因,在TRM細胞中選擇性表達。
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圖1.TGF-β誘導GPR25在CD8 T細胞中的表達
02 -GPR25促進肝臟TRM細胞的發育和維持
為評估GPR25在TRM細胞發育中的相對作用,在感染90天后比較脾臟、肝臟和siIEL室中轉移的T細胞的細胞頻率和記憶表型(圖2A),發現相同比例的GPR25-WT和GPR25-KO OT-I T細胞(圖2B)。正如預期的那樣,肝臟TRM細胞(CD69+)共表達CXCR6,但缺乏CD103的表達,GPR25-WT和GPR25-KO OT-I T細胞在siIEL室中TRM細胞的頻率沒有顯著差異(圖2C),這表明Gpr25對于siIEL室中TRM細胞的發育是不可缺少的。
使用異體共生實驗來評估GPR25-WT和GPR25-KO肝臟TRM細胞的駐留潛力(圖2D)。共生30天后,GPR25-WT和GPR25-KO OT-I T細胞在宿主肝臟中以相同比例積累,但在CD8-KO配對受體小鼠的脾臟中觀察到GPR25-KO OT-I T細胞與GPR25-WT OT-I T細胞的比例明顯更高(圖2E)。因此,組織中缺乏GPR25的T細胞表現出降低的駐留潛力,更有可能重新進入循環,這表明GPR25支持肝臟TRM細胞的發育。
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圖2.GPR25促進肝臟TRM細胞的發育
03 -Gpr25缺乏會損害TRM細胞發育的早期階
為評估GPR25是否影響TRM細胞發育的早期階段,通過比較比較LCMV-OVA感染后肝臟中過繼共轉移GPR25-WT和GPR25-KO OT-I T細胞在早期時間點的表型(圖3A),感染后的48小時內觀察到細胞的激活和增殖狀態沒有差異(圖3B),感染后的第5天、12天和30天,細胞的比例相等,Gpr25缺乏對肝臟中轉移的OT-I T細胞的KLRG1+效應表型沒有可測量的影響,少量轉移的OT-I T細胞共表達肝臟TRM細胞標志物CD69和CXCR6。
然而,在感染后第12天觀察到肝臟中存在明顯的CD69+CXCR6+OT-I T細胞群,表明潛在的TRM前體細胞的形成(圖3C-E)。Gpr25缺陷導致這些TRM前體細胞減少,肝臟中KLRG1+效應細胞相應增加(圖3D)。然而,脾臟中CD69+CXCR6+ OT-I T細胞的頻率非常低,GPR25-WT和GPR25-KO OT-I T細胞在任何時間點上均無顯著差異(圖3E)。這些發現表明,gpr25缺陷T細胞產生肝臟TRM細胞的受損不太可能是由于脾臟TRM前體細胞頻率的改變。
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圖3.Gpr25缺乏損害TRM細胞發育的早期階段
04 -GPR25支持干細胞樣TRM細胞的產生
差異基因表達分析顯示肝臟GPR25-WT和GPR25-KO TRM細胞的轉錄譜存在顯著差異(圖4A)。與GPR25-KO TRM細胞相比,GPR25-WT TRM細胞對干細胞樣T細胞特征表現出陽性富集,對效應物相關特征的富集程度降低(圖4B)。對肝臟組織駐留記憶T細胞(TRM)進行無監督亞群分析,發現存在異質性亞群:主要簇1和3富含干細胞樣特征及相關基因(Tcf1和Lef1),而簇0和2則富含效應基因(如Klrg1、Prf1、Gzma、Gzmb和GzmK)(圖4C-E)。RT-qPCR和細胞內染色證實,GPR25-WT中TCF1編碼的轉錄本和TCF1蛋白水平高于GPR25-KO肝TRM細胞(圖4F-G)。
使用繼發性轉移方法來確定Gpr25缺陷是否影響肝臟中繼發性TRM細胞的產生(圖4H)。感染30天后觀察到肝臟中轉移的GPR25-WT和GPR25-KO OT-I T細胞數量大致相等(圖4I),表明GPR25-KO TRM細胞在肝臟中遷移和產生記憶T細胞的能力沒有重大缺陷。
然而,與GPR25-WT TRM細胞相比,GPR25-KO TRM細胞在肝臟中分化為繼發性TRM細胞(CD69+CXCR6+)的頻率顯著降低(圖4J)。
相比之下,效應記憶T細胞(TEM)(KLRG1+CD62L−CD69−)的頻率增加(圖4K)。這些結果表明,GPR25-KO TRM細胞在抗原再激發后分化為次級TRM細胞的能力存在缺陷。
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圖4.GPR25促進干細胞樣TRM細胞的發育
05 -GPR25增強T細胞對TGF-β的應答
與受體小鼠肝臟中的GPR25-KO TRM細胞相比,GPR25-WT TRM細胞中TGF-β特征基因正富集(圖5A)。缺乏TGF-β受體29(Tgfbr2)的表達沒有改變,但在肝臟TRM細胞中TGF-β受體1(Tgfbr1)的表達增加(圖5B)。評估TGF-β信號在LCMV病毒感染模型中的作用(圖5C)。阻斷TGF-β信號通路在LCMV-OVA感染前后30天顯著減少了肝臟中過繼轉移的CD69+CXCR6+的OT-1T細胞的頻率,而不改變第30天時在肝臟中積累的OT-1T細胞的總數(圖5D)。研究發現,與GPR25-WT CD8 T細胞相比,GPR25-KO細胞中磷酸化的SMAD2和SMAD3蛋白(pSMAD2/SMAD3)的表達水平顯著降低(圖5E)。
此外,在CD8 T細胞中過表達Gpr25則表現出更高水平的pSMAD2/SMAD3(圖5F)。利用已發表的來自體外TRM細胞分化模型的RNA-seq數據集首次發現維甲酸(retinoic acid,RA)不會誘導T細胞中Gpr25的表達,而是抑制TGF-β誘導的Gpr25的表達(圖5G)。接下來,在這個體外模型中評估了RA是否可以在缺乏Gpr25的情況下驅動TRM細胞分化(圖5H)。正如預期的那樣,與GPR25-WT T細胞相比,在TGF-β處理的條件下,GPR25-KO CD8 T細胞向CD69+CD103+TRM樣細胞的分化受損(圖5I)。
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圖5.GPR25增強T細胞對TGF-β的應答
06 -GPR25促進肺TRM細胞的發育
采用LCMV-OVA感染幼稚CD45.1受體小鼠(圖6A),在肺中觀察到GPR25-WT和GPR25-KO OT-I T細胞的比例大致相等(圖6B)。感染30天后,在肺部檢測到不同的CD69+CD103+OT-ITRM細胞群,與Gpr25充足的OT-I T細胞相比,缺乏Gpr25的OT-I T細胞在肺部發育為CD69+CD103+TRM細胞的能力降低(圖6C)。
為進一步了解GPR25促進肺中CD69+CD103+TRM細胞發育的機制,通過對GPR25-WT和GPR25-KO OT-I記憶T細胞進行了單細胞轉錄組分析,OT-I T細胞分為兩個主要亞群,在第0簇中觀察到GPR25-WT與GPR25-KO OT-I記憶T細胞的比例更大(圖6D)。與在肝臟TRM細胞中的發現類似(圖4A-D),富含GPR25-WT T細胞的第0簇細胞相對于第1簇顯示出效應相關基因表達減少,而干細胞樣標記的表達增加(圖6E-F)。此外,簇0顯示出TRM細胞特征的強富集(圖6G),表明它主要由TRM細胞組成,與簇1相反(圖6D)。為驗證這些發現,通過GPR25-WT和GPR25-KO OT-I T細胞將CD8-KO受體小鼠分成不同的隊列,然后用LCMV-OVA感染它們(圖6H)。如預期那般,在轉移的GPR25-WT OT-I T細胞中,肺中TCF1+CD69+ CD8 T細胞的頻率明顯高于GPR25-KO OT-I T細胞(圖6I)。通過RT-qPCR分析證實,LCMV感染后第30天,GPR25-KO OT-I細胞中的Zeb2和S1pr5轉錄物水平顯著升高(圖6J)。
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圖6.GPR25促進肺TRM細胞的發育
07 - Gpr25缺陷T細胞不能控制肺轉移
為評估Gpr25缺陷記憶T細胞是否在腫瘤攻擊模型中表現出受損的繼發性肺T細胞反應,按圖6A所示,感染30天后使用B16F10-OVA腫瘤細胞刺激受體小鼠以誘導轉移(圖7A)。接種13天后,GPR25-WT OT-I細胞在肺中的出現頻率顯著高于GPR25-KO OT-I細胞(圖7B)。因此假設Gpr25-充足的OT-I記憶T細胞具有更大的控制肺轉移的能力。為驗證該假設,兩組獨立的CD45.1 WT受體小鼠(圖 7C)分別接受GPR25-WT OT-I T細胞或GPR25-KO OT-I T細胞輸注,隨后經氣管內感染LCMV-OVA。感染30天后使用B16F10-OVA細胞進行激發,并在FTY720處理后評估肺轉移程度。結果顯示,與接受GPR25-KO OT-I細胞的小鼠相比,接受GPR25充足的OT-I細胞的小鼠的轉移結節數量顯著減少(圖7D)。
為排除宿主CD8 T細胞的干擾,采用CD8-KO小鼠作為受體,驗證GPR25-WT OT-I T細胞與GPR25-KO OT-I T細胞在控制肺轉移中的作用(圖 7E)。對照組設置為未接受T細胞輸注的CD8-KO小鼠,以專門評估過繼轉移OT-I T細胞的作用。結果顯示,接受GPR25-KO OT-I T 細胞的CD8-KO小鼠存活結局較差,死亡率達50%;而接受GPR25-WT OT-I細胞的CD8-KO小鼠在分析時大多數存活(圖7F)。此外,與接受GPR25-KO OT-I細胞或不轉移OT-I細胞的CD8-KO小鼠相比,接受GPR25-WT OT-I細胞的CD8-KO小鼠的轉移結節數量顯著減少(圖7G)。
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圖7.Gpr25缺陷T細胞不能控制肺轉移
研究總結
在轉錄組學調查中,與非TRM細胞相比,GPR25成為肺和腫瘤浸潤性CD8 TRM細胞中差異表達最多的基因之一。
研究發現GPR25在人CD8 T細胞中通過TGF-β信號誘導表達。LCMV感染模型證明了GPR25在支持小鼠肝臟和肺中表達TCF1的干細胞樣TRM細胞的發育中發揮關鍵作用,而不是在siIEL室發育的干細胞。使用TRM生成的其他組織特異性模型的未來研究可用于檢查GPR25在組織室中的作用。鑒于TRM細胞在抗腫瘤免疫應答中的重要性,推斷通過靶向GPR25活性來調節TRM細胞應答的方法可能在相關的臨床環境中有希望。
單細胞轉錄組測序:是在單個細胞水平進行高通量測序的技術,能夠有效解決細胞異質性,有助于發現新的稀有細胞類型,深入了解細胞生長過程中的表達調控機制。利用微流控系統通過序列標簽(barcode和UMI)區別群體中的不同細胞和轉錄本,獲得單細胞水平的基因表達譜。
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END
LyL 撰文
SY 校稿
