MetPro-II：代謝-蛋白互作在精準醫療藥物篩選中的突破與應用
隨著科技的飛速發展，醫療行業也正經歷著一場深刻的變革。在這個背景下，精準醫療應運而生，成為了當今醫療領域的熱門話題，然而精準藥物篩選的研究當中一直存在這些問題：
1. 小分子藥物作用靶點未知
2. 藥物作用機制不明確
為了解決這些難題，百趣推出了MetPro-II技術，該技術使用化學蛋白質組學方法，可以快速篩選到與代謝物有互作作用的蛋白質。作為蛋白代謝互作前沿技術，自2019年上市以來，已經協助客戶發表多篇高分文獻。下面，我們來分享幾篇MetPro-II技術參與研究的文章。
案例一
文章標題：Inhibition of UBA6 by inosine augments tumour immunogenicity and responses
發表期刊：Nature Communications
影響因子：14.7
研究概述：抗癌免疫和對免疫治療的反應受腫瘤代謝狀態的影響。免疫檢查點阻斷療法(Immune checkpoint blockade therapy, ICB)已知涉及代謝適應，但其機制尚不完全清楚。該研究通過對接受ICB治療的癌癥患者和小鼠腫瘤模型的血漿進行非靶向代謝組學分析，發現較高水平的嘌呤代謝物（包括肌苷）標志著ICB敏感性。此外，通過MetPro-II代謝蛋白互作蛋白組學技術方法確定了肌苷在小鼠和癌癥患者腫瘤細胞中的直接靶點，并通過遺傳方法驗證了其在小鼠模型中的功能。作者確定UBA6作為限制抗腫瘤免疫的腫瘤內在檢查點，并揭示UBA6是免疫治療的有吸引力的靶點，其研究結果強調了肌苷與ICB結合在高UBA6表達的癌癥患者中的潛在應用。
技術流程：
案例二
文章標題：Targeting phenylpyruvate restrains excessive NLRP3 in?ammasome activation and pathological in?ammation in diabetic wound healing
發表期刊：Cell Report
影響因子：7.5
研究概述：探討免疫調節代謝物在糖尿病傷口愈合中過度炎癥的作用機制，并提出針對苯丙酮酸(PPA)的潛在治療策略。通過代謝組學分析發現，糖尿病足潰瘍中有顯著的PPA積累，該物質會損害傷口愈合并增強炎癥反應。通過MetPro-II代謝蛋白互作蛋白組學技術方法確定PPA是通過CD36受體進入巨噬細胞中的，它與PPT1蛋白結合并抑制去棕櫚?；富钚?，從而增加NLRP3蛋白的棕櫚酰化水平。這種增加的NLRP3棕櫚?；梢源龠MNLRP3炎性小體激活和IL-1β等炎癥因子的釋放，最終導致促炎癥性巨噬細胞表型的形成。因此，本研究發現針對PPA的治療方法可能有助于預防糖尿病傷口中的過度炎癥。
技術流程：
案例三
文章標題：Traumatic acid inhibits ACSL4 associated lipid accumulation in adipocytes to attenuate high-fat diet-induced obesity
發表期刊：The FASEB Journal
影響因子：4.8
研究概述：探索創傷酸(TA)對脂肪細胞脂質積累的影響及其在高脂飲食誘導肥胖中的作用機制。研究發現，TA能夠顯著減少人類脂肪細胞的脂質積累，并預防小鼠高脂飲食引起的肥胖。通過轉錄組測序和Western blotting等方法，研究人員發現了TA激活脂肪酸降解和代謝信號通路，并抑制長鏈酰輔酶A合成酶-4(ACSL4)的表達。此外，研究人員還利用MetPro-II代謝蛋白互作蛋白組學技術方法證實了TA直接作用于肝糖原激酶2(HK2)，并通過分子基礎證明TA可能通過HK2-ACSL4軸發揮作用。這項研究為開發有效的干預策略提供了新的思路。
技術流程：
以上文獻均利用了百趣提供的MetPro-II技術，并在研究中起到關鍵的作用，那么MetPro-II技術究竟是什么？接下來讓我們一起揭開它神秘的面紗。
MetPro-II技術是一種化學蛋白質組學方法，將蛋白質水解(LiP)和質譜(MS)結合起來，用于進行代謝物-蛋白質相互作用的研究，篩選與代謝物具有相互作用的蛋白質。
MetPro-II 技術流程
MetPro-II 實驗流程
MetPro-II 應用方向
1. 發現藥物的作用靶點；
2. 研究小分子代謝物的作用機制；
3. 小分子代謝物作用機制研究：研究小分子代謝物對生化過程、信號通路等的影響；
4. 網絡圖構建：與其他功能組學數據結合如PPI網絡、PTM蛋白質翻譯后修飾或代謝流，為不同細胞調控層之間的交互影響(crosstalk)帶來新方向。
MetPro-II 技術優勢
1. 簡單高效的發現小分子代謝物與蛋白相互作用，靈敏度高；
2. 不需要對配體進行任何化學修飾，也不偏向具有特定性質的化合物；
3. 直接在復雜的生物樣品中展開研究，而不需要進行蛋白質純化或濃縮。
MetPro-II 特色專屬服務
MetPro-II代謝物與蛋白互作產品，配套卓越的分子對接分析服務，可以靶向篩選藥物候選分子，加速藥物發現和設計進程，能夠精確定位代謝物與蛋白質之間的交互界面，預測它們的結合模式與親和力。
熱門技術MetPro-II，協助高分文章發表，百趣生物等著您來！
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LQP 撰文
Uki 校稿