在作物研究、微生物學、藥物開發等場景的科研探索中，科研人員常常要解析DNA–蛋白質的互作，以揭示基因調控網絡和表觀遺傳機制。然而，傳統DNA–蛋白質互作技術總有“難以避免”的痛點：
1、ChIP-seq：耗時長，需要大量細胞樣本，且背景噪聲大，信噪比低，數據解析復雜。
2、傳統CUT&RUN：雖然靈敏度有所提升，但操作仍繁瑣，流程復雜，重復性和效率受限。
為了解決這些問題，近岸蛋白潛心研發出NEXT CUT&RUN（NovoNGS® NEXT CUT&RUN High-Sensitivity Kit (for Illumina®)，Cat.No.: N359）——新一代精簡型CUT&RUN方案，讓DNA–蛋白互作分析更高效、更精準、更輕松。
五大產品優勢，專為高效科研設計
1、相比傳統CUT&RUN技術，背景更低，信噪比大幅提升；
2、低至5000個細胞，操作簡單，僅需10 h；
3、融合pAG-Nuclease，一步實現靶標識別和高效切割；
4、抗體單次實驗使用量低至0.1-0.5 μg，節省成本；
5、隨附建庫試劑，從靶標捕獲到文庫構建一套搞定。
DNA/蛋白互作研究技術比對
實驗流程圖
性能展示
1 NEXT CUT&RUN文庫構建質量高
轉錄因子研究：
圖1. NEXT CUT&RUN試劑盒在100K K562細胞條件下進行CTCF CUT&RUN建庫。毛細管電泳結果顯示，文庫呈現典型的核小體周期分布，主峰180 bp以上，符合預期片段大小，表明文庫構建成功且切割效率好，可用于后續高質量測序分析。
組蛋白研究：
圖2. NEXT CUT&RUN試劑盒在100K K562細胞條件下進行H3K27me3 CUT&RUN建庫。文庫呈現典型的核小體周期分布，主峰約320 bp，符合預期片段大小，表明文庫構建成功且切割效率好，可用于后續高質量測序分析。
2 下機數據背景低，信噪比高
IGV數據分析：
圖3. 以100K個K562細胞為樣本，使用不同品牌的CUT&RUN試劑盒對組蛋白修飾、DNA結合蛋白及轉錄因子進行檢測。IGV結果顯示，使用近岸蛋白NEXT CUT&RUN可在不同組蛋白、DNA結合蛋白和轉錄因子中獲得背景清晰，信噪比高的互作圖譜，且信噪比明顯優于其他同類產品。
TSS富集分析：
圖4. 以30K個K562細胞為樣本，使用不同品牌的CUT&RUN試劑盒對組蛋白修飾、DNA結合蛋白及轉錄因子進行檢測。通過TSS富集分析發現，近岸蛋白NEXT CUT&RUN試劑盒獲得的TSS富集得分顯著高于其他同類產品，表現出更優的信噪比。
3 NEXT CUT&RUN建庫所需樣本量少，僅需5000個細胞
圖5. 以K562細胞為樣本，使用NEXT CUT&RUN在不同細胞數量條件下對組蛋白修飾及轉錄因子進行檢測。IGV結果顯示，僅需5000個細胞量也可獲得清晰、高質量結果，且峰型與高細胞量條件保持一致。
4 NEXT CUT&RUN兼容不同類型細胞的互作研究
圖6. 使用NEXT CUT&RUN試劑盒對100K數量不同人源細胞進行H3K4me3抗體檢測，IGV結果顯示，四種不同來源的細胞均可以獲得高質量的互作圖譜。
產品信息
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