阿趣課堂丨蛋白質組學新技術介紹與應用-自主發布-資訊-生物在線

阿趣課堂丨蛋白質組學新技術介紹與應用

作者:上海阿趣生物科技有限公司 2023-03-01T13:24 (訪問量:12509)

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2講師介紹

張旭敏

復旦大學生命科學學院 研究員、博士生導師

較低的分析通量是蛋白質組學實際應用的一個難點,提升分析通量對蛋白質組分析在大隊列樣品中的應用至關重要。等質異位標簽是目前蛋白質組學研究中使用最廣泛的多重定量方法,目前分析通量最大TMTpro標簽能同時定量18個樣品。我們建立了的TAG-TMTpro方法,使得定量通量增加三倍,可以同時定量54個樣品。方法也可以應用在其它等質異位標簽的定量蛋白質組研究中。

課程主題:TAG-TMTpro,一種新型的超高通量的定量蛋白質組學方法

  1. 定量蛋白質組學簡介
  2. 等質異位標簽簡介
  3. TAG-TMTpro方法的開發

唐思偉

應脈醫療 博士/高級應用科學家

深耕蛋白質組學近20年,有豐富的研究和技術開發經驗,先后就職于復旦大學,同濟大學附屬楊浦醫院,應脈醫療等單位。

以血漿為代表的體液蛋白質組的典型特征是蛋白質分子的高動態分布范圍(跨越10-12個數量級)?,F有技術很難實現對血漿蛋白質組高深度和高寬度的覆蓋,導致血漿蛋白質組的研究進展緩慢。

2020年,美國Seer公司創新型地推出了基于納米磁珠(NPs)富集結合質譜的高深度體液蛋白質系統——Proteograph?。借助該系統的自動化流程,能在幾個小時內完成對血漿中3500至5000種蛋白質的鑒定,同時實現對血漿蛋白質組寬度和深度的雙重高覆蓋,強力推進血漿蛋白質分子標志物的篩選、發現、轉化和應用。

本課程將通過對大量Proteograph?系統產出的本土數據的分析,詳細介紹Proteograph?系統在體液蛋白質組等諸多領域的強大應用。

課程主題:Proteograph?(Seer)——體液蛋白質組高深度探索系統

  1. 血漿蛋白質組特征及研究現狀
  2. Proteograph?系統及組件
  3. Proteograph?系統穩定性和重復性分析
  4. Proteograph?系統對血漿蛋白質組高深度解析力分析
  5. Proteograph?系統——大隊列樣本分析

6. Proteograph?系統——代表性研究案例分析

康林

Biotree蛋白質組學總監

專攻蛋白質組學領域,擁有近10年項目工作經驗,服務過近百家醫院,高校、研究所等科研單位,在蛋白質組學方案設計、實驗流程、數據分析及蛋白質組學數據庫應用等方向有豐富的項目經驗。

隨著技術的進步,蛋白質組學研究的方法多樣, UniProt數據庫中經人工注釋的蛋白質有2萬多種,在蛋白質組學研究中有組織,細胞,血清血漿等不同樣本類型的樣本,它們能夠被檢測到的蛋白種類數也不盡相同,目前為止還沒有哪種技術可以一次性陽性檢出所有的蛋白質,質譜檢測法是一種高通量檢測蛋白的常用手段,通常來說組織,細胞能夠檢測到的蛋白種類數可達到成千上萬,而血清血漿樣本由于高豐度蛋白的影響,通常只有成百上千的蛋白,因此對于血清血漿樣本來說,為了更深入的研究科學問題,高深度覆蓋檢測蛋白種類顯得尤為重要;而蛋白冠蛋白質組學所擁有的**磁珠配套全自動化前處理設備,能夠大大提升蛋白質檢測深度;該技術被成功應用于NSCLC研究中,可以檢測到已有研究過的biomarker指標和潛在的含量低于10ng/ml的潛在biomarker。

總結現有的很多疾病的biomarker含量低于10ng/ml,高深度覆蓋蛋白質組學技術在biomarker研究中將有著廣泛的研究前景。

課程主題:蛋白質組學新技術介紹與應用

  1. 高深度覆蓋的蛋白組學技術與優勢介紹
  2. 蛋白冠蛋白質組學應用案例分享
  3. 高深度覆蓋的蛋白組學應用前景展望

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