技術突破 | FFPE樣本產出高質量單細胞數據的秘籍-技術前沿-資訊-生物在線

技術突破 | FFPE樣本產出高質量單細胞數據的秘籍

作者:上海伯豪生物技術有限公司 暫無發布時間 (訪問量:24363)

FFPE(福爾馬林固定石蠟包埋)樣本作為時空檔案庫與臨床轉化的引擎,憑借其獨特優勢(便于長期保存、關聯豐富的臨床數據、易獲取等),已成為生命科學研究與臨床轉化的核心資源。得益于技術的發展與革新,10x Flex技術作為FFPE樣本單細胞轉錄組研究的科研利器,正持續釋放FFPE樣本的研究潛能,將“沉睡的樣本庫”轉化為“數據金庫”。

Flex技術方案應用于FFPE樣本單細胞核RNA測序

針對FFPE樣本核分離效率低、RNA降解風險高等技術難點,伯豪自主研發伯優®FFPE樣本細胞核分離試劑盒,能夠有效制備核膜結構完整、碎片率低的高品質單細胞核懸液。該試劑盒已用于包括腦腫瘤、肝癌、胃癌、腸癌等多種腫瘤類型的FFPE樣本,累計1000余例樣本的細胞核懸液制備,為FFPE樣本單細胞核RNA測序提供了穩定可靠的細胞核分離解決方案。

伯優®FFPE樣本細胞核分離試劑盒

 

FFPE樣本單細胞核RNA測序實測數據

作為第一批最先引進10x Flex技術的服務商,我們已經積累了豐富的FFPE樣本單細胞核RNA測序的項目經驗,主要涵蓋人的20多種組織類型,1000多例樣本。其中多數FFPE樣本的單細胞數據實測細胞數可達10000+,中位基因值可達到800+,同時能夠全面檢測到組織中各種細胞類群。

 

 

FFPE樣本單細胞核測序實驗方案再升級

優化無止境,不斷完善實驗方案才能為客戶的每一份樣本的數據質量護航。我們基于豐富的FFPE樣本單細胞核RNA測序的項目經驗,近期再次全面優化了FFPE樣本抽核的實驗方案,進一步提升了單細胞核RNA測序的數據質量。實測數據證明,優化抽核實驗方案后的不同組織類型的FFPE樣本,單細胞核RNA測序數據的實測細胞數可達10000+,中位基因數可達到1000+,數據質量有了顯著提升。

優化實驗方案后的實測數據

食管癌FFPE樣本單細胞注釋

肺癌FFPE樣本單細胞注釋

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