黑色素瘤組織中,與細胞焦亡相關的基因(PRGs)GZMA、GSDMB、NLRP1、IL18和CHMP4A的陽性細胞比例低于正常皮膚。細胞焦亡是一種影響腫瘤微環境和腫瘤免疫治療的新領域。然而,細胞焦亡的作用仍有爭議,部分原因是由于黑色素瘤的細胞組成異質性。

2023年8月,上海中醫藥研究院皮膚病研究所李斌教授團隊在Cell Death& Disease雜志上發表題為 Clinical-mediated discovery of pyroptosis in CD8+ T cell and NK cell reveals melanoma heterogeneity by single-cell and bulk sequence 的研究論文。
本文對黑色素瘤標本的單細胞轉錄組進行了全面分析。我們發現PRGs的表達在免疫細胞中,如CD8+細胞(代表CD8+ T細胞)和CD57+細胞(代表NK細胞)中失調。此外,免疫組化和多重免疫熒光染色實驗結果進一步證實了GZMA+細胞和GSDMB+細胞主要在免疫細胞中表達,特別是在CD8+ T細胞和NK細胞中。
黑色素瘤標本中,GZMA+合并CD8+ T細胞(0.11%)和GSDMB+合并CD57+細胞(0.08%)的存在量很少,而對照組分別為4.02%和0.62%。這些發現表明,腫瘤中免疫細胞的減少可能降低了細胞焦亡的能力,從而對抗黑色素瘤的特性構成了潛在的風險。
我們根據單細胞和整體RNA-seq分析,構建了一個預后風險模型和個體化的預測模型(C指數=0.58,P = 0.002),提示PRGs在惡性黑色素瘤的預防中可能發揮作用??傊ㄟ^實驗驗證鑒定了免疫細胞群和免疫基因模塊,有助于我們更好地理解黑色素瘤中的細胞焦亡。
實驗部分
本文中,研究者使用TissueGnostics公司TissueFAXS Spectra全景多光譜組織掃描定量分析系統獲取圖像。獲取到圖像利用StrataQuest軟件進行定量分析。
Panel 1 :DAPI,CD8,GZMA,GSDMB
Panel 2:DAPI,CD57,GZMA,GSDMB
雖然細胞焦亡對癌癥的影響尚為有定論,但是也正因為如此,針對細胞焦亡的研究仍然有廣泛的未知等待探索。考慮到細胞焦亡的研究和炎癥反應過程密切相關,借助于TissueFAXS Cytometry技術,結合多色免疫熒光染色,不但可以精準識別焦亡相關特異性蛋白表達的細胞,還可以實現對細胞焦亡水平在組織中的空間分布、形態特征、與其他細胞類型的相互作用等方面的高通量、高精度、高信息量的定量分析。
在單細胞定量水平上,先通過識別細胞核標記對細胞進行計數,繼而借助于Tissue Cytometry的核擴張算法精準對細胞質/膜染色的形態進行識別。在獲得單細胞真實染色的輪廓區域后,對每個細胞蛋白標記的所有像素強度進行統計分析,最終獲得單個細胞蛋白表達的真實強度水平。這種方法用于陽性閾值的精準篩選劃分,甚至更進一步鑒定了陽性細胞與相鄰的陰性細胞的作用關系。
在本文中作者還利用了多組學研究的思路,對黑色素瘤發病機制有關的細胞 - 細胞相互作用網絡提出了新的見解思路,以CD8陽性T細胞作為研究線索觀察到CD8細胞邊緣浸潤的失調,進一步為腫瘤免疫的相關機制研究拓展了研究領域的廣度。除此之外,針對NK細胞、GZMA 細胞和 GSDMB 細胞也均進行了原位精準空間定量分析,為后續的深入研究奠定了扎實的基礎。在這些研究中,在切片原位的多重免疫組化標記,針對不同表型細胞的蛋白表達及細胞分布分析,也都是利用TissueFAXS Cytometry技術來進行的個體化精準定量分析。

Figure 1 GZMA+細胞和GSDMB+細胞由CD8+T細胞分泌。
A:對照組和黑色素瘤組織的多色免疫熒光染色圖像。DAPI(藍色)、CD8(粉色)、GZMA(綠色)和GSDMB(紅色)。
B:CD8+GZMA+共定位和CD8+GSDMB+共定位散點圖。

Figure 2 NK T細胞分泌GZMA+細胞和GSDMB+細胞
A:對照組和黑色素瘤組織的多色免疫熒光染色圖像。DAPI(藍色)、CD57(粉色)、GZMA(綠色)和GSDMB(紅色)。
B:CD8+GZMA+共定位,CD8+GSDMB+共定位,CD57+GZMA+和CD57+GSDMB+散點圖。
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