Gastroenterology| 浙江大學(xué)陳健/汪冽團(tuán)隊(duì)從單細(xì)胞水平分析胃印戒細(xì)胞癌微環(huán)境高度惡性潛在機(jī)理-技術(shù)前沿-資訊-生物在線

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Gastroenterology| 浙江大學(xué)陳健/汪冽團(tuán)隊(duì)從單細(xì)胞水平分析胃印戒細(xì)胞癌微環(huán)境高度惡性潛在機(jī)理

作者:TG亞太公司 2023-03-30T15:14 (訪問量:15153)

胃癌(GC)是一種特點(diǎn)為腫瘤細(xì)胞和腫瘤免疫微環(huán)境(TIME)高度異質(zhì)性的主要腫瘤類型。

胃印戒細(xì)胞癌(GSRCC)是胃癌的一種相對(duì)少見的病理亞型,占所有胃癌的10%以下,惡性程度極高、預(yù)后差。研究表明,早期GSRCC患者的5年生存率高于非GSRCC患者。由于缺乏特殊的臨床表現(xiàn),超過90%GSRCC患者診斷時(shí)就為晚期;因此,準(zhǔn)確和早期的疾病分期對(duì)GSRCC患者的治療計(jì)劃和預(yù)后至關(guān)重要。


2023313日,浙江大學(xué)陳健,汪洌及德克薩斯大學(xué)MD安德森癌癥中心Liang Han共同通訊在GastroenterologyIF=34)在線發(fā)表題為“Single-cell Profiling of Tumor Immune Microenvironment Reveals Immune Irresponsiveness in Gastric Signet-ring Cell Carcinoma”的研究論文。

研究提供了晚期GC患者免疫細(xì)胞組成和細(xì)胞狀態(tài)的全面分子畫像,強(qiáng)調(diào)了GSRCC的適應(yīng)性免疫無反應(yīng)性和CXCL13在腫瘤免疫微環(huán)境上的中介作用。該文章針對(duì)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組學(xué)分析提供了一種強(qiáng)大的腫瘤免疫微環(huán)境導(dǎo)向的轉(zhuǎn)化研究方法。


我們招募了32例不同亞型的晚期GC患者,并使用免疫靶向單細(xì)胞圖譜分析了他們的腫瘤免疫微環(huán)境,包括(I)免疫靶向單細(xì)胞RNA測(cè)序(scRNA-seqn=20名患者)(Ii) 通過靶向抗體組合進(jìn)行蛋白表達(dá)分析

研究發(fā)現(xiàn),與非GSRCC相比,GSRCC的腫瘤免疫微環(huán)境似乎處于靜止?fàn)顟B(tài),CD4+CD8+T細(xì)胞都難以動(dòng)員,這進(jìn)一步損害了B細(xì)胞的正常功能。CXCL13主要由TfhTh17和耗竭的CD8+T細(xì)胞產(chǎn)生,是這種轉(zhuǎn)化的中心協(xié)調(diào)者。該研究表明CXCL13的表達(dá)可以預(yù)測(cè)GC患者對(duì)免疫檢查點(diǎn)阻斷的反應(yīng),這可能與其對(duì)三級(jí)淋巴結(jié)構(gòu)(TLS)的影響有關(guān)。

本文研究強(qiáng)調(diào)了產(chǎn)生CXCL13的耗盡的CD8+T細(xì)胞在促進(jìn)抗腫瘤反應(yīng)中的重要性。對(duì)于非GSRCC患者,采取常規(guī)治療包括化療和免疫關(guān)卡阻斷可能是可行的;而對(duì)于GSRCC患者,提高耗盡的CD8+T細(xì)胞產(chǎn)生CXCL13的能力可能是扭轉(zhuǎn)難治性疾病的關(guān)鍵。

實(shí)驗(yàn)部分

為了獲取更為全面的免疫細(xì)胞亞群及其細(xì)胞狀態(tài)的信息,研究者通過TissueFAXS Cytometry技術(shù),從一張組織切片樣本的全景尺寸上,使用高倍物鏡同時(shí)獲取到了9種蛋白標(biāo)記的成像結(jié)果。這種單細(xì)胞尺度上的光學(xué)原始數(shù)據(jù),結(jié)合連續(xù)全光譜成像及光譜拆分技術(shù),保證每個(gè)標(biāo)記物信號(hào)的純凈和準(zhǔn)確,為后續(xù)分析提供了可靠的基礎(chǔ)。

TLS為細(xì)胞通信以及啟動(dòng)和維持TB細(xì)胞反應(yīng)提供了局部和關(guān)鍵的微環(huán)境,導(dǎo)致了放大的抗腫瘤免疫反應(yīng)和有利的結(jié)果。CXCL13被認(rèn)為是TLS的典型標(biāo)記物,并參與了整個(gè)TLS組織。TLS的存在被認(rèn)為是CXCL13+CD4+CXCL13+CD8+T細(xì)胞獲得臨床益處所不可或缺的。因此,CXCL13可能通過干擾GSRCCTLS的形成而誘導(dǎo)時(shí)間異質(zhì)性。為了驗(yàn)證這一假設(shè),我們分析了另一組GC患者的HE染色切片,確實(shí)觀察到GSRCCTLS的頻率低于非GSRCC組織中的TLS(Fig 2 G )

然后,對(duì)腫瘤組織切片進(jìn)行多重免疫組織化學(xué)(MIHC)染色,以揭示CXCL13的空間關(guān)系。

實(shí)驗(yàn)采用了mIHC方法,最多可有9個(gè)特異標(biāo)記,并對(duì)具有代表性的GSRCC和非GSRCC樣本進(jìn)行了核染色。事實(shí)上,我們?cè)?span lang="EN-US">GSRCC中幾乎看不到TLS,但在非GSRCC中普遍存在組織良好的TLS(Fig 1 GH)。在TLS內(nèi)發(fā)現(xiàn)大量的CXCL13+CD4+CXCL13+CD8+T細(xì)胞。由于PD-1的表達(dá)普遍較低,在CD8+T細(xì)胞上可檢測(cè)到PD-1CXCL13的共表達(dá),表明CD8-Tex細(xì)胞表達(dá)CXCL13的能力較弱。


Fig 1 多重免疫組織化學(xué)(MIHC)采用酪胺信號(hào)放大(TSA)為基礎(chǔ)的檢測(cè)方法和多光譜成像。(G)GSRCC(H)GSRCC具有代表性的GC切片分別用E-鈣粘蛋白(青色)CD4(綠色)CD19(黃色)CD8(橙色)Madcam(紅色)DC-LAMP(洋紅色)PD-1(白色)Epcam(橄欖)CXCL13(栗色)和細(xì)胞核(藍(lán)色)染色。


Fig 2 GSRCC和非GSRCC之間蛋白表達(dá)的差異

G:非GSRCCGSRCC HE樣本中TLS頻率。

H:多重免疫組織化學(xué)(mIHC)采用酪胺信號(hào)放大(TSA)為基礎(chǔ)的檢測(cè)方法和多光譜成像。GSRCC()和非GSRCC()具有代表性的GC切片分別用CD8(洋紅)CXCL13(橙色)CD19(綠色)和細(xì)胞核(藍(lán)色)染色。及T細(xì)胞-B細(xì)胞聚集的程度()


Tissue Cytometry技術(shù)在胃癌研究中的優(yōu)勢(shì):

1 對(duì)胃癌組織切片進(jìn)行自動(dòng)全景成像和無痕拼接,獲得高清晰度和高分辨率的數(shù)字化圖像,方便觀察和存儲(chǔ)。

2對(duì)胃癌組織中的單個(gè)細(xì)胞(包括細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞核、細(xì)胞膜等)進(jìn)行鑒定和定量分析,利用多種標(biāo)記物(如蛋白、核酸等)和多種參數(shù)(如染色強(qiáng)度、形態(tài)學(xué)、空間分布等)挖掘樣本差異性。

3 對(duì)胃癌組織中的腫瘤微環(huán)境進(jìn)行研究,包括腫瘤標(biāo)志物檢測(cè)、腫瘤轉(zhuǎn)移、腫瘤干細(xì)胞、腫瘤免疫等方面,揭示腫瘤的發(fā)生、發(fā)展、變化和轉(zhuǎn)歸機(jī)制。

4 利用類流式數(shù)據(jù)呈現(xiàn)和分析技術(shù),通過散點(diǎn)圖、直方圖和熱力圖等方式展示細(xì)胞量化結(jié)果,通過設(shè)門圈選和正反向回溯功能進(jìn)行細(xì)胞群分類或再分析,實(shí)現(xiàn)影像與分析結(jié)果的緊密結(jié)合。

5 根據(jù)樣本和分析需求進(jìn)行定制化APP制作,實(shí)現(xiàn)樣本全自動(dòng)分析和數(shù)據(jù)輸出,提高工作效率和準(zhǔn)確性,同時(shí)支持多種硬件升級(jí)方案,滿足不同的研究需求。

這些優(yōu)勢(shì)使得全景組織細(xì)胞定量分析系統(tǒng)成為胃癌研究中的一種強(qiáng)有力的工具,為胃癌的診斷、治療和預(yù)防提供了有價(jià)值的數(shù)據(jù)支持。

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