結合代謝組學和網絡藥理學研究康復消炎栓治療慢性盆腔炎作用機制-自主發布-資訊-生物在線

結合代謝組學和網絡藥理學研究康復消炎栓治療慢性盆腔炎作用機制

作者:上海阿趣生物科技有限公司 2023-01-29T16:50 (訪問量:13638)

文章標題:Integrated Metabolomics and Network Pharmacology Study on the Mechanism of Kangfuxiaoyan Suppository for Treating Chronic Pelvic Inflflammatory Disease

發表期刊:Frontiers in Pharmacology

影響因子:5.988

發表年份:2022.01

組學技術:代謝組學

1.百趣代謝組學文獻分享—研究背景

慢性盆腔炎(CPID)是女性盆腔生殖器官、周圍結締組織和盆腔腹膜的慢性炎癥,可導致不孕、異位妊娠或慢性盆腔疼痛。代謝組學分享,左氧氟沙星或甲硝唑等抗生素主要用于治療CPID,但由于耐藥性和副作用,治療效果并不理想。因此,有必要開發新的替代藥物來治療CPID。

康復消炎栓(KFXYS)是一種常用治療CPID的中成藥(《中藥治療常見病臨床應用導則》標準化項目組,2020)。代謝組學分享,KFXYS方劑由苦參、穿心蓮、紫草根、敗醬草、蒲公英、紫草、蘆薈和豬蹄散組成。作者先前的研究表明,KFXYS可以緩解CPID患者子宮腫脹的程度,抑制炎癥因子的分泌,增加免疫因子指數,其療效已經得到驗證,但其作用機制尚不清楚。

作者在該研究驗證了抗炎消炎散對炎癥指標的逆轉作用。在明確KFXYS化學成分的基礎上,進一步利用YEZ技術對其在血液中的吸收成分進行了表征,并進行了ADME研究。代謝組學分享,利用代謝組學發現了與炎癥指標顯著相關的代謝物。然后基于ADME行為良好的血液吸收成分,利用網絡藥理學方法預測KFXYS治療CPID的潛在靶點和作用途徑。代謝組學和網絡藥理學共有途徑被認為是關鍵的代謝途徑,通過關鍵途徑上的蛋白質從網絡藥理學獲得的潛在靶點中篩選出關鍵靶點(圖1)。

圖1. KFXYS治療CPID的作用機制示意圖

2.百趣代謝組學文獻分享—研究設計

3.百趣代謝組學文獻分享—研究結果

(1)KFXYS對CPID大鼠炎癥指標的逆轉作用

作者測定了子宮組織中IL-1、IL-6、IL-10及TNF-α的水平。如圖2A所示,與假手術組相比,模型組的子宮指數顯著升高,結果表明CPID模型建立成功。代謝組學分享,與模型組相比,施用KFXYS后子宮指數顯著下降,表明KFXYS能有效改善CPID模型大鼠的子宮腫脹程度。此外,在子宮組織勻漿中,模型組IL-6顯著下降,IL-1顯著升高。在KFXYS處理組,這些指標得到了顯著改善。研究表明,KFXYS具有逆轉炎癥指數的作用(圖2B-E)。

圖2. KFXYS對炎癥指數的逆轉作用

(2)研究KFXYS吸收進血液中的成分研究

①鑒定吸收到KFXYS血液中的成分

作者利用高分辨率質譜法鑒定出KFXYS的80種高響應化學成分和43種弱響應化學成分。代謝組學分享,通過開發實時二元比較的方法,以鑒定吸收到血液中的KFXYS的成分(圖3),共鑒定出60種KFXYS衍生化合物,包括10種原型化合物(表1)和50種代謝物。根據代表性對照品建立的代謝規律,作者推測這60個成分主要來源于SFR、AH、TH和VH,主要包括生物堿類、黃酮類和有機酸類等。

圖3. 在正離子模式下提取離子色譜圖

表1. 血液中KFXYS的原型成分

②血液中KFXYS主要成分的藥代動力學研究

作者在結果中發現只有以下六種成分在體內表現出良好的ADME行為。因此,推測苦參堿,索果果平,蘆薈素,七葉皂苷和7-羥基-4′-甲氧基異黃酮及其代謝物可能是KFXYS的潛在藥用成分。

圖4. 血液中6種藥用成分的ADME分析

(3)KFXYS治療CPID的機制研究

①與KFXYS炎癥指標相關的差異代謝物的研究

作者將KFXYS組和模型組具有相反趨勢的代謝物被定義為最終的差異代謝物。如表2所示,共篩選和鑒定了16種最終差異代謝物。

圖5. 謝組學分析

表2. 差異代謝物

為了研究以上代謝物與KFXYS療效之間的相關性,將子宮組織勻漿中的炎癥指標和16種差異代謝物進行相關性分析以進一步篩選代謝物(圖5G)。結果表明,炎癥指標與白三烯A4、5-羥基吲哚乙酸、鳥氨酸、精氨酸等5種代謝物顯著相關,表明KFXYS可能通過調節這些直接相關的代謝物在CPID的治療中發揮作用。

代謝組學分享,利用通路分析,發現以上代謝物主要涉及精氨酸和脯氨酸代謝、谷胱甘肽代謝等代謝途徑。

圖6. 差異代謝物的通路分析

②基于網絡藥理學的KFXYS潛在作用機制研究

網絡藥理學分析結果發現疾病靶點和藥物靶點的185個共有靶點是KFXYS治療CPID的潛在靶標(圖7A)。代謝組學分享,GO富集分析用于發現185個潛在靶標的潛在生物過程(BP),細胞組分(CC)和分子功能(MF)(圖7B)。在KEGG潛在靶標富集分析中,共獲得176條通路。前10個通路如圖7C所示。

圖7. KFXYS在治療CPID的網絡藥理學分析

(4)基于代謝組學與網絡藥理學整合的KFXYS作用機制研究

代謝組學和網絡藥理學的共同途徑是精氨酸和脯氨酸代謝,谷胱甘肽代謝,這可能是KFXYS治療CPID的關鍵途徑。并且確定了九個關鍵靶點,具體如表3所示。代謝組學分享,根據具有良好AMDE行為、9個關鍵靶點和2個關鍵代謝途徑的成分,構建了KFXYS在治療CPID中的“中藥處方-單藥-化合物-關鍵靶點-關鍵途徑-疾病”網絡(圖8)。

表3. KFXYS在治療CPID方面的主要靶點

圖8. “中醫復方-單方-化合物-關鍵靶點-關鍵途徑-疾病”網絡圖

4.百趣代謝組學文獻分享—總結

本研究驗證了KFXYS對CPID大鼠炎癥指標的逆轉作用,鑒定出KFXYS被吸收到血液中的60種成分,其中有6種成分具有良好的ADME行為。代謝組學分享,通過相關性分析發現了5種與炎癥指標相關的差異代謝物,并將這些代謝物用于代謝途徑分析。結合網絡藥理學獲得的潛在途徑,二者的共有途徑被認為是關鍵途徑,即精氨酸和脯氨酸代謝,谷胱甘肽代謝。利用關鍵通路中所含的蛋白質篩選出網絡藥理學獲得的潛在靶標,篩選出9個關鍵靶點??傮w而言,我們推測KFXYS的成分可能作用于關鍵蛋白質,包括ARG1,NOS2,NOS3等,以在CPID的治療中發揮作用(圖9)。

圖9. KFXYS的可能調控機制

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