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短鏈脂肪酸靶標定量(代謝組學)檢測分析方案

作者:上海阿趣生物科技有限公司 2017-11-29T00:00 (訪問量:22053)

?短鏈脂肪酸靶標定量(代謝組學)檢測分析方案

一、項目簡介

1.1 短鏈脂肪酸概述

短鏈脂肪酸(short-chain fatty acids,SCFAs),也稱揮發(fā)性脂肪酸(Volatile fatty acids,VFA),根據(jù)碳鏈中碳原子的多少,把碳原子數(shù)為1-6的有機脂肪酸稱為短鏈脂肪酸,主要包括乙酸、丙酸、異丁酸、丁酸、異戊酸、戊酸。?

短鏈脂肪酸被后腸迅速吸收后,既儲存了能量又降低了滲透壓,并且短鏈脂肪酸對于維持大腸的正常功能和結(jié)腸上皮細胞的形態(tài)和功能具有重要作用。近端及遠端結(jié)腸內(nèi)SCFAs濃度分別約120mol/L和90mol/L,其中最重要且相對較多(占總量95%)的是乙、丙、丁酸,三者比例大致為3:1:1。受發(fā)酵底物、細菌種類等因素的影響,腸道內(nèi)所產(chǎn)生的短鏈脂肪酸的種類和數(shù)量不同,其發(fā)揮的作用也不盡相同。表1. 腸道內(nèi)主要細菌數(shù)量及代謝產(chǎn)物

1.2 技術(shù)路線

圖片1.jpg

圖1. 短鏈脂肪酸靶標定量(代謝組學)技術(shù)路線圖
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1.3分析內(nèi)容

基礎(chǔ)數(shù)據(jù)分析包括:數(shù)據(jù)預(yù)處理,差異化合物篩選,PCA模式識別。

1.4檢測平臺

分析檢測平臺:GC-FID或GC-MS

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二、檢測分析方案

2.1標準品配置

建立標準物質(zhì)校準曲線,標準物質(zhì)清單見表2:

2. 標準物質(zhì)列表

我們采用嚴格的質(zhì)量控制體系來保證數(shù)據(jù)的可靠性:

表3. 質(zhì)量控制體系

說明:

⒈精密度:指用某種方法重復(fù)測定同一均質(zhì)樣品所得測定值的彼此接近程度,表示分析結(jié)果的重復(fù)性。常用標準差(SD)或相對標準偏差(RSD)表示。在相同條件下,由一個分析人員測定所得結(jié)果的精密度稱為重復(fù)性;在同一個實驗室,不同時間由不同分析人員用不同設(shè)備測定結(jié)果之間的精密度,稱為中間精密度;在不同實驗室由不同分析人員測定結(jié)果之間的精密度,稱為重現(xiàn)性

⒉準確度:指測定值(平均值)與真實值的接近程度,該指標主要是通過回收率來反映。

3.回收率:在空白樣本中添加一定量待測標準樣品,制成已知含量的樣本,然后按擬定的方法對樣本進行提取、凈化和測定。所得到的實測值與已知值比較,實測值與已知值的百分率即為該方法的回收率。

圖片2.jpg圖片3.jpg

圖1. 標準品校準曲線(以乙酸,丁酸為例)

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2.2數(shù)據(jù)預(yù)處理

對原始數(shù)據(jù)進行峰解卷積,積分,峰對齊,標準化處理。通過原始總離子流(TIC)色譜圖,初步觀察儀器的保留時間重現(xiàn)性,所測得物質(zhì)的情況。

圖片4.jpg

圖2. 代表樣品GC-MS總離子流色譜圖

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2.3 定量結(jié)果

通過標準曲線計算樣品中短鏈脂肪酸的定量結(jié)果,并結(jié)合學氏T檢驗統(tǒng)計組間差異表達的化合物。圖片5.jpg

表4. 短鏈脂肪酸定量分析結(jié)果

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2.4 PCA分析

對樣本進行主成分分析能從總體上反應(yīng)各組樣本之間的總體代謝差異和組內(nèi)樣本之間的變異度大小。使用SIMCA軟件(V14.1, Umetrics, Umea, Sweden),對數(shù)據(jù)進行UV格式化(Unit Variance Scaling)和平均中心化(Mean-Centered)處理,然后進行自動建模分析,以獲得更加可靠且更加直觀的結(jié)果。例圖如下所示:

1505205905912217.jpg

圖3. PCA模式識別得分圖

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1505205936471774.jpg

?圖4. PCA模式識別載荷圖

四、時間概算

實驗檢測:45個工作日

數(shù)據(jù)分析:10個工作日

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