如何得到一張漂亮的瓊脂糖凝膠電泳圖-技術前沿-資訊-生物在線

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如何得到一張漂亮的瓊脂糖凝膠電泳圖

作者:杭州聯科生物技術股份有限公司 2017-07-14T10:52 (訪問量:9381)

如何得到一張漂亮的瓊脂糖凝膠電泳圖


聯科生物推出一波分子新品,電泳是分子最基礎的實驗,今天小科先和大家聊聊如何得到一張漂亮的電泳圖。


一、做一塊優(yōu)質的瓊脂糖凝膠

“工欲善其事,必先利其器”,能否做一塊好的瓊脂糖凝膠,直接影響到后面電泳和結果的分析。制膠前,小科給大家的建議:

1. 在制膠時必須將制膠模具、梳子以及燒杯等物品洗凈,以免干膠及其他雜質帶入;

2. 在溶膠時應觀察溶液中是否有未溶解的瓊脂糖顆粒,確保溶膠完全;

3. 在溶液倒入制膠模具前必須充分混勻,以免制出來的膠出現不均勻的現象。

圖一:制膠時帶入了其它雜質,形成了障礙物,使得DNA條帶電泳時受到阻礙無法繼續(xù)電泳,從而形成扭曲帶

圖二:制膠時溶膠不完全以致瓊脂糖顆粒殘留,形成一些濃度較高的凝膠區(qū)域,在DNA電泳經過這些區(qū)域時,部分DNA被阻礙在這里而形成不規(guī)則亮帶。


二、選擇合適濃度的瓊脂糖凝膠

凝膠的濃度是常被忽略問題。小科建議:長片段的DNA選用低濃度的凝膠電泳,短片段的DNA則選用高濃度的凝膠電泳。

表一:分離不同大小的DN**段所用的最適凝膠濃度

凝膠濃度 0.5% 0.7% 1% 1.2% 1.5% 2%
DNA長度 1kb-30kb 800bp-12kb 500bp-10kb 400bp-7kb 200bp-3kb 50bp-2kb

三、選擇合適的核酸上樣量電泳

要想電泳跑出可見條帶的話,至少需要上樣50 ng,但是0.5 cm寬的梳子最好不超過0.5μg的DNA量,因為上樣量過多會造成加樣孔超載,從而導致拖尾或彌散,對于較長的DNA此現象更為明顯。另外,加樣量的多少還應依據加樣孔的大小及DN**段的長度而定,當加樣孔大時,樣品上樣量應相應加大。

四、選擇合適的電壓電泳

通常情況下電壓越低,走出的電泳條帶越平整。低電壓電泳時,電泳緩沖液也不容易發(fā)燙,也能確保在電泳的過程中凝膠不會變形。當然電壓太低,等待電泳結果的時間就會延長,綜合考慮,一般控制電泳電壓≤5V/cm,即可保證電泳條帶的清晰度。

圖三和圖四同一樣本跑出的圖,但是出來的效果差別非常大,主要是因為電泳時的電壓不同
圖三由于電泳的電壓過大,導致電泳條帶都扭曲變形了。


五、選擇合適的電泳距離(控制電泳時間)

一些片段的DNA,電泳20-30min家常便飯,有的甚至需要更長的時間,如果想稍微快一點,可以選用濃度比較稀的凝膠或稍微調高一點電壓進行電泳。


希望以上信息對大家有幫助。以上文章轉載于丁香園核酸技術論壇。

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