技術介紹 | 靶標代謝流分析-技術前沿-資訊-生物在線

技術介紹 | 靶標代謝流分析

作者:上海阿趣生物科技有限公司 2021-11-16T17:05 (訪問量:10627)

基于13C或者15N標記的靶標代謝流分析能夠系統地定量細胞或者組織內特定代謝通路代謝網絡的流量分布及各代謝途徑的相對貢獻,其優點是可以利用細胞內代謝物的質量同位體信息的分析方法,不但在很多情況下能夠直觀地表明代謝流量的整體走向,而且通過計算能夠準確定量地揭示細胞內各個代謝反應的活性,以及深入理解平行反應、可逆反應等多種復雜的細胞內代謝過程,直觀揭示細胞胞內的主要活性途徑及各個途徑的相對貢獻及其分布變化特點,從而鑒定出相關疾病發生發展過程的早期診斷的標志物及其關鍵的主要代謝通路,并揭示其相互調控規律,為疾病發生的臨床早期診斷、藥物靶點治療和預后判斷提供強有力的科學依據。


Ex vivo and in vivo stable isotope labelling of central carbon metabolism and related pathways with analysis by LC-MS/MS

一、靶標代謝流解決方案
BIOTREE能量代謝之靶標代謝流解決方案:主要集中在能量代謝明星通路精細化代謝速率研究, 包含糖酵解途徑、三羧酸循環、磷酸戊糖途徑。
糖酵解途徑(EMP)是指糖原或葡萄糖分子分解至生成丙酮酸的階段,是體內糖代謝最主要途徑。此途徑在動植物和許多微生物中普遍存在。在需氧生物中,糖酵解途徑是葡萄糖氧化生成二氧化碳和水的前奏。糖酵解生成的丙酮酸可進入線粒體,通過三羧酸循環(TCA)及電子傳遞鏈徹底氧化成二氧化碳和水,并生成腺嘌呤核苷三磷酸。

代謝流-糖酵解途徑(部分物質)
三羧酸循環是(TCA) 需氧生物體內普遍存在的代謝途徑,是生物機體獲取能量的主要方式,是糖,脂肪和蛋白質三種主要有機物在體內徹底氧化的共同代謝途徑,是體內三種主要有機物互變的中心樞紐。

代謝流-三羧酸循環(部分物質)
磷酸戊糖途徑(PPP) 是葡萄糖氧化分解的一種方式,在動物、植物和微生物中普遍存在。在生物體內磷酸戊糖途徑(PPP)除了提供能量外,主要是為合成代謝提供多種原料。如為脂肪酸、膽固醇的生物合成提供還原型煙酰胺腺嘌呤二核苷磷酸(NADPH);為核苷酸輔酶、核苷酸的合成提供5-磷酸核糖;為芳香族氨基酸合成提供4-磷酸赤蘚糖。

代謝流-磷酸戊糖途徑(部分物質)


二、技術優勢
  • 技術成熟、靈敏度高
  • 專業的數據分析團隊,通過Matlab flux-8等軟件進行原始數據處理,并進行PCA、柱狀圖、熱力圖、 Bi-plot等分析
三、技術路線

四、技術參數
  • 樣本要求
細胞數量:1×107cells/sample
生物學重復 :6-10個生物學重復
  • 檢測平臺

GC-Q-MSE/ Sciex 6600 Triple tof

  • 檢測平臺
基于13C標記的葡萄糖(Glucose)碳代謝流分析
基于13C標記的谷氨酰胺(Glutamine)碳代謝流分析
基于15N標記的谷氨酰胺(Glutamine)氮代謝流分析
  • 常規項目周期
實驗檢測:58個自然日
數據分析:5個自然日
五、應用方向
  • 通過比較不同環境條件及各種代謝性疾病的不同代謝途徑的代謝流量的分布變化,揭示出相關疾病發生發展過程中的主要代謝通路及其早期診斷的標志物
  • 通過13C代謝流量技術對胞內外的中間代謝物的變化示蹤,可以鑒定出基因工程菌的關鍵的代謝通路和活性,為提高目標代謝產物的合成提供直接的依據
  • 可以比較分析細胞,組織及其血樣和尿液在基因改造的前后的代謝功能變化


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