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伯豪云流程新成員| mRNA分析云流程正式上線(xiàn)!

作者:上海伯豪生物技術(shù)有限公司 2024-12-06T00:00 (訪(fǎng)問(wèn)量:42719)

既伯豪單細(xì)胞分析云流程上線(xiàn)之后,伯豪mRNA分析云流程也上線(xiàn)啦!

 

 

擺脫時(shí)空限制,隨心所欲玩轉(zhuǎn)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)挖掘

伯豪m(xù)RNA分析云流程具備數(shù)據(jù)存儲(chǔ),數(shù)據(jù)分析,數(shù)據(jù)交互,數(shù)據(jù)管理,數(shù)據(jù)下載功能,讓用戶(hù)能夠隨時(shí)隨地自主分析mRNA測(cè)序數(shù)據(jù),一鍵打包下載分析結(jié)果及報(bào)告。不用找人托人分析,不用等待分析人員回復(fù),更不用非得坐在實(shí)驗(yàn)室,無(wú)論何時(shí)何地,只要登錄Hiplot平臺(tái)賬號(hào),即可快速調(diào)整樣本分組方案,批量選擇分析內(nèi)容,也可隨心修改分析參數(shù)。剔除不合適樣本,調(diào)整分組比較,更換差異篩選閾值等分析從此擺脫依賴(lài),擺脫時(shí)間,擺脫空間,隨時(shí)隨地想玩就玩!

 

系統(tǒng)功能齊全,分析內(nèi)容豐富

?支持項(xiàng)目概覽,批量修改,包括樣本名稱(chēng)修改,分組信息調(diào)整,樣本刪減(通過(guò)勾選來(lái)確定納入分析的樣本),差異分析方法(edgeR,T Test, DEseq2),差異基因閾值(logFC,檢驗(yàn)方法,Q value)調(diào)整等。此外,還可以實(shí)時(shí)關(guān)注調(diào)整后的分析進(jìn)度。

?參數(shù)可調(diào)(分析參數(shù),繪圖參數(shù))

支持分析參數(shù)的調(diào)整和繪圖參數(shù)的調(diào)整,可對(duì)PCA,相關(guān)性熱圖,火山圖,熱圖,KEGG/GO富集圖等進(jìn)行調(diào)整,調(diào)整后的結(jié)果會(huì)被記錄(以修改日期記錄),且可進(jìn)行結(jié)果預(yù)覽和結(jié)果下載。

?可上傳文件進(jìn)行特定圖片生成

在KEGG,GO,GSEA富集分析里,可支持上傳文件來(lái)進(jìn)行作圖。這樣可以方便展示特定關(guān)注的pathway,GO terms和GSEA富集分析中基因集的富集情況。

此外,搭配伯豪生信云工具中已上架的20+mRNA相關(guān)小工具,進(jìn)行WGCNA,趨勢(shì)分析,免疫浸潤(rùn)分析,共表達(dá)分析等深入數(shù)據(jù)挖掘!

伯豪生信云網(wǎng)址:

http://tools.shbio.com/home/index.html

敲掉科研協(xié)作門(mén)檻,項(xiàng)目數(shù)據(jù)輕松管理與共享

科研協(xié)作是推進(jìn)科研成果產(chǎn)出的重要過(guò)程,不知道大家平時(shí)怎么共享自己的科研數(shù)據(jù)呢?直接分享原始數(shù)據(jù)的話(huà),不安全,傳輸慢,難以管控,實(shí)非首選。分享報(bào)告圖表的話(huà),沒(méi)有中間數(shù)據(jù),一張張“死”圖表,無(wú)法改動(dòng),難以重現(xiàn),難以協(xié)作。基于Hiplot云平臺(tái),這些問(wèn)題迎刃而解。項(xiàng)目數(shù)據(jù)可以一鍵分享,團(tuán)隊(duì)多人共同協(xié)作,實(shí)時(shí)共享最新的數(shù)據(jù)分析結(jié)果及進(jìn)度,而且所有分析過(guò)程都有留存,做到結(jié)果的真實(shí)可復(fù)現(xiàn)。這種“可共享、可編輯、可溯源”的云流程,著實(shí)省心省力。再也不用擔(dān)心找不到已畢業(yè)師兄師姐的項(xiàng)目數(shù)據(jù)了!

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