
英文標題:Probiotics and their metabolite spermidine enhance IFN-γ+CD4+T cell immunity to inhibit hepatitis B virus
發表期刊:Cell Reports Medicine
影響因子:11.7
合作單位:山東大學
百趣提供服務:新一代代謝組學NGM 2
研究背景
這篇文章探討了益生菌及其代謝產物亞精胺(Spermidine, SPD)如何增強IFN-γ+CD4+T細胞免疫反應以抑制乙型肝炎病毒(Hepatitis B Virus, HBV)。全球約有2.96億人慢性感染HBV,這增加了肝硬化和肝細胞癌的風險,使HBV成為最嚴重的傳染病之一。世界衛生組織的目標是到2030年將HBV發病率減少95%,死亡率減少65%。理想的HBV抗病毒治療目標是實現功能性治愈,即持續抑制HBV DNA并使血清乙型肝炎表面抗原(Hepatitis B surface Antigen, HBsAg)消失。然而,實現慢性HBV感染的功能性治愈是困難的,自然歷史成功率不到1%,即使長期治療,現有抗病毒藥物的成功率也不到5%。因此,恢復T細胞免疫和實現HBV感染的功能性治愈是研究的重點。
研究結果
1.益生菌促進HBV清除并改善腸道共生菌群的穩態和屏障功能
在5周齡的C57BL/6小鼠體內通過水動力注射(Hydrodynamical Injection, HDI)腺相關病毒/HBV1.2(AAV/HBV1.2)質粒制備了HBV攜帶者小鼠模型,從HDI前2周(BLE Pre組)或注射后3天(BLE組)開始,每天灌胃BLE(圖1A)。如圖1B-E所示,BLE和BLE Pre均能顯著抑制HBV復制,表現為血清HBsAg、HBV DNA以及肝臟前基因組RNA(pgRNA)和HBV RNA水平降低。與此一致的是,在注射后6周內,給藥BLE顯著降低HBsAg陽性小鼠的百分比(wpi)(圖1F)。

圖1.補充BLE可促進小鼠清除HBV
2.益生菌對腸道微生物組的影響
通過16S rRNA測序,研究者發現益生菌處理的小鼠腸道微生物組發生了顯著變化,包括Prevotellaceae、Clostridiaceae、Akkermansia和Ruminococcaceae等家族的富集(圖2C),這些家族被認為有助于通過抗PD-1或CTLA-4抗體恢復耗盡的CD8+T細胞。此外,益生菌處理的小鼠糞便中BLE(B. longum, L. acidophilus, 和E. faecalis)的豐度顯著增加(圖2D),表明益生菌在腸道中的積累。
收集PBS或BLE處理的HBV攜帶小鼠(供體小鼠)的糞便。使用受體小鼠進行FMT實驗,在5周齡時,用抗生素混合物(ABX)治療14天,然后用HBV HDI對其進行腸道消毒(圖2E)。如圖2F-2H所示,移植BLE小鼠糞便微生物群(FMT-BLE)可顯著促進受體小鼠對HBV的清除,與接受對照糞便微生物群(FMT-Control)的小鼠相比,血清HBsAg和HBV DNA水平明顯降低,肝臟pgRNA表達明顯降低。同樣,FMT-BLE小鼠中HBsAg陽性小鼠的百分比明顯低于FMT-Control小鼠(圖2I)。
為了進一步驗證BLE在HBV清除中的直接作用,引入無菌(GF)小鼠,通過HDI建立HBV模型,然后給予益生菌(圖2J)。與無特定病原體(SPF)小鼠的結果一致,添加BLE大大增加了GF小鼠糞便中BLE的數量(圖2K),降低了血清HBsAg、HBV DNA和肝臟pgRNA的水平(圖2L)。綜上所述,這些數據表明BLE的積累有助于小鼠的HBV清除。

圖2.BLE的積累有助于腸道菌群穩態和HBV清除
3.益生菌通過CD4+T細胞依賴性方式促進HBV清除
進一步探究CD4+T細胞亞群在BLE介導的HBV清除中的作用(圖3D-L),RT-qPCR與FCM檢測顯示,BLE處理使小鼠肝臟Th1細胞相關轉錄因子和細胞因子表達上調,(T-bet)+Th1細胞增多。ELISA和FCM分析表明,肝臟勻漿IL-21、IFN-γ水平,以及Th1細胞中二者表達顯著增加。此外,BLE處理提升了脾臟CD8+T細胞IFN-γ產量,增加無菌小鼠肝臟和脾臟IFN-γ+CD4+T細胞數量。上述結果表明,給予BLE能夠使宿主通過增強CD4+Th1細胞中IL-21和IFN-γ的產生來清除HBV。

圖3.CD4+T細胞的消耗和IL-21或IFN-γ的失活消除了益生菌引起的抗HBV作用
4.益生菌衍生的亞精胺促進HBV清除
研究者發現,益生菌影響宿主的微生物代謝。通過飛行時間質譜聯用系統(GC-TOF-MS)檢測了BLE處理小鼠糞便中的代謝物變化。結果顯示,38種代謝物在對照組和BLE處理組小鼠之間存在顯著差異,其中包括亞精胺(SPD)(圖4A)。進一步的靶向代謝組學分析表明,SPD在BLE處理的小鼠肝臟中積累,并且其濃度高于腐胺(putrescine)。重要的是,亞精胺在BLE處理的GF小鼠的糞便、外周血清和肝臟中積累(圖4B),表明BLE產生的亞精胺可能通過血液循環從腸道轉移到肝臟。
采用傳統的細菌培養方法獲得培養上清并檢測SPD濃度。發現在含精氨酸的培養基中,培養的BLE在pH 5.0時產生的SPD水平明顯高于pH7.0(圖4C)。此外,給藥BLE在抗生素(ABX)處理小鼠的糞便、肝組織和血清中產生的SPD水平明顯較高,而單獨的糞腸桿菌在體外和體內都不能有效產生SPD(圖4C)。因此,BLE能有效地產生SPD并增強抗HBV免疫,糞腸桿菌能在長芽胞桿菌和嗜酸乳桿菌的協同下產生SPD。
進一步研究SPD在HBV清除中的作用。發現SPD單獨給藥可顯著降低HBV攜帶者小鼠血清HBsAg、HBV DNA和肝臟pgRNA水平(圖4D-4F)。綜上所述,這些結果表明,BLE來源的SPD通過外周循環從腸道積累到肝臟,這有助于小鼠的HBV清除。

圖4.BLE衍生亞精胺促進HBV清除
5.亞精胺通過自噬增強Th1細胞免疫
研究者進一步探索了SPD介導的HBV清除背后的機制,包括腸道穩態和T細胞免疫。結果顯示,亞精胺喂養的小鼠顯示出腸道緊密連接蛋白表達的顯著增加,伴隨著血清FITC-葡聚糖和iFABP水平的明顯降低。此外,SPD喂養導致腸道IL-17A、IL-21和IL-22表達的顯著增加,以及腸道IL-17A+CD4+T細胞、IL-21+CD4+T細胞和IL-22+CD4+T細胞的百分比和MFI的增加。亞精胺還增強了HBV攜帶小鼠肝臟和脾臟中IL-21+CD4+T細胞和IFN-γ+CD4+T細胞的頻率(圖4G和4H),ELISA證實SPD小鼠肝臟勻漿中IL-21和IFN-γ水平顯著升高(圖4I),提示SPD增強了HBV攜帶者小鼠的CD4+T細胞免疫。
用有或沒有SPD的ovabumin(OVA323-339)肽刺激OT-II小鼠的體外脾細胞。FCM證實SPD以劑量依賴性方式增強ova刺激的OT-II CD4+T細胞中IFN-g的產生(圖5A)。同時,SPD劑量依賴性地促進了OT-II CD4+T細胞中自噬體的積累(圖5B),而自噬抑制劑3-甲基腺嘌呤(3-MA, 1 mM)進一步增強了SPD誘導的自噬體積累(SPD+3-MA,圖5C),提示SPD處理的CD4+T細胞中自噬活化。值得注意的是,3-MA顯著降低SPD誘導的CD4+T細胞中IFN-g的增加(圖5D)。
SPD是真核翻譯起始因子5A(eIF5A)的唯一已知底物,elf5a通過選擇性翻譯調控tfeb蛋白表達。用GC7(SPD+GC7)(eIF5A的特異性抑制劑)處理,減少了SPD誘導的自噬體的積累(圖5C),并完全破壞了SPD誘導的IFN-γ在CD4+T細胞中的積累(圖5D)。與此一致的是,SPD誘導HBV攜帶者小鼠肝臟CD4+T細胞中的自噬體積累(圖5E)。更重要的是,SPD顯著促進了來自HBV患者外周血的CD4+T細胞中自噬體和IFN-γ的積累,而GC7的治療在很大程度上破壞了這種誘導(圖5F和5G)。綜上所述,這些數據表明SPD以自噬依賴的方式增強CD4+T細胞的功能。

圖5.SPD通過體內和體外自噬增強CD4+T細胞功能
6.益生菌加速人類菌群相關小鼠和HBV患者血清HBsAg的下降
為了評估益生菌在自然微生物組中是否會引起類似的改變,并評估BLE和亞精胺在HBV清除中的臨床治療潛力,研究者通過用HBV患者的糞便樣本重建GF小鼠的微生物群,構建了人類菌群相關(HFA)小鼠模型。結果顯示,BLE和SPD在HFA小鼠中顯示出顯著的HBV清除能力。與對照組相比,BLE/亞精胺處理的HFA小鼠血清HBsAg、HBV DNA和肝內pgRNA水平顯著降低(圖6B-D)。BLE和亞精胺顯著促進了肝內CD4+T細胞中自噬體的積累(圖6E),并增強了肝臟和脾臟CD4+T細胞中IFN-γ的產生(圖6F)。更重要的是,BLE和SPD都顯著增強了肝臟和脾臟HBV特異性CD4+T細胞中IFN-γ的產生,表明BLE和SPD對HBV特異性免疫的潛在貢獻(圖6G)。
對血清HBsAg持續低水平(低于2000 IU/mL)的HBV患者進行BLE聯合抗病毒治療的臨床效果進行了初步觀察,這些患者通常被認為是功能治愈的有利人群趨勢(圖6h)。與對照組相比,接受BLE治療6個月的患者血清HBsAg和HBeAg明顯下降(圖6I)。正如預期的那樣,補充BLE顯著促進外周血單核細胞(PBMCs)CD4+T細胞中自噬體的積累和IFN-γ的表達(圖6J和6K)。

圖6.益生菌可加速HFA小鼠和HBV患者的HBsAg清除
7.亞精胺增強恩替卡韋的抗HBV效果
基于SPD在T細胞激活和HBV清除中的作用,研究者進一步確定亞精胺是否能夠增強恩替卡韋(ETV)的治療效果。結果顯示,與ETV單藥治療相比,ETV和亞精胺的聯合治療組在HBsAg和pgRNA水平上顯示出更顯著地降低,同時對HBV DNA的抑制效果與單藥治療相當(圖7A-D)。

圖7.SPD聯合用藥可促進HBV攜帶者小鼠的HBV抑制
研究結論
這項研究表明,益生菌和其代謝產物亞精胺通過自噬增強IFN-γ+CD4+T細胞免疫反應,有效促進HBV的清除。這些發現為使用益生菌和亞精胺與抗HBV藥物聯合治療慢性HBV感染提供了可能的治療線索。盡管這項研究在人類中的樣本量較小,但數據仍然顯示了益生菌在實現HBV功能性治愈方面的潛力。未來的研究需要通過前瞻性隨機對照試驗來驗證這些初步觀察結果,并進一步探索益生菌和亞精胺在HBV治療中的作用機制。
END
peng 撰文
Orianna 校稿
