外顯子組測序，是利用序列捕獲技術(shù)，將全基因組外顯子區(qū)域的DNA捕捉并富集后，進(jìn)行高通量測序的基因組分析方法。在同樣的測序通量下，外顯子組測序針對(duì)目標(biāo)區(qū)段的測序深度以及覆蓋度都高于全基因組重測序，因此該技術(shù)對(duì)于發(fā)生在外顯子區(qū)的常見和罕見的染色體變異具有很高的檢測靈敏度。其簡便、經(jīng)濟(jì)、高效等特點(diǎn)，使其成為近年的熱門技術(shù)。
一、 捕獲平臺(tái)
Agilent SureSelect捕獲系統(tǒng)
? ? ??Agilent SureSelect Human All Exon V6人全外顯子捕獲系統(tǒng)，依托液相捕獲系統(tǒng)，采用120-mer的RNA作為“誘餌”探針，能夠高效地捕獲帶有SNV，InDel等突變的基因組序列。目前，該技術(shù)廣泛應(yīng)用于癌癥等復(fù)雜疾病相關(guān)的遺傳變異研究中，并獲得了國際癌癥協(xié)會(huì)（ICGC）的鑒定認(rèn)可。
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技術(shù)優(yōu)勢
1. 最全面的內(nèi)容，適用于任何應(yīng)用的外顯子組解決方案
- 包含相關(guān)數(shù)據(jù)庫的新核心內(nèi)容，可靶向包括難捕獲區(qū)域在內(nèi)的更多外顯子
- ?輕松添加用于轉(zhuǎn)化研究的 UTR、用于癌癥研究的 COSMIC，或用于特定應(yīng)用的定制內(nèi)容
2. 高覆蓋率、高深度測序，可準(zhǔn)確的檢測出疾病相關(guān)的常見及稀有變異
二、 技術(shù)參數(shù)
- 樣品要求
? ? ? ? ?樣本類型：DNA樣品
? ? ? ? ?樣品濃度：≥50ng/μl
? ? ? ? ?樣品總量：≥2ug?
- 建議測序深度
? ? ? ? ?1、 Germline變異相關(guān)建議測序深度80X以上（單基因/復(fù)雜疾病研究）
? ? ? ? ?2、 Somatic變異相關(guān)建議測序深度150X以上（腫瘤癌癥研究）
- 項(xiàng)目周期
? ? ? ? ?測序?qū)嶒?yàn)及基礎(chǔ)分析：35個(gè)工作日
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三、 技術(shù)路線
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四、 數(shù)據(jù)分析結(jié)果展示
a) 突變頻率分布圖
b) 突變功能分布圖
c) 樣本拷貝數(shù)變異區(qū)間圖
d) 體細(xì)胞突變率及突變頻譜圖
e) 樣本體細(xì)胞突變heatmap圖
f) 體細(xì)胞突變富集分析圖
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g) 家系連鎖分析LOD連鎖圖及單倍型圖
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