GC-MS非靶標(biāo)代謝組學(xué)通過(guò)氣質(zhì)聯(lián)用(GC-MS)方法檢測(cè)生物體受外界刺激前后體內(nèi)大多數(shù)小分子代謝物的動(dòng)態(tài)變化，重點(diǎn)尋找在實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組中有顯著變化的代謝物，進(jìn)而研究這些代謝物與生理病理變化的相關(guān)關(guān)系，其研究對(duì)象大都是分子量1500Da以?xún)?nèi)的小分子物質(zhì)。
技術(shù)優(yōu)勢(shì)
● 技術(shù)成熟穩(wěn)定、分辨率高、選擇性好技術(shù)路線(xiàn)
技術(shù)參數(shù)
● 樣本要求
血清、血漿：200 uL/sample尿液：l mL/sample
組織：200 mg/sample
糞便、腸道內(nèi)容物：200 mg/sample
細(xì)胞、微生物：1x 107cells/sample
培養(yǎng)液：200 uL/sample
● 生物學(xué)重復(fù)
樣本數(shù)量：植物和微生物n≥6，動(dòng)物樣本n≥10，臨床樣本n≥30，所有重復(fù)樣本獨(dú)立分析其他種類(lèi)的樣品在收集之前請(qǐng)聯(lián)系公司銷(xiāo)售工程師
● 檢測(cè)平臺(tái)
GC-TOF-MS (Agilent 7890A/ 7890B-LECO Pegasus HT)
● 常規(guī)項(xiàng)目周期
30個(gè)自然日，含基礎(chǔ)數(shù)據(jù)分析應(yīng)用方向
● 表型和生理功能研究● 疾病病理研究● 臨床診斷及治療● 藥物研究● 中醫(yī)理論研究● 食品科學(xué)與營(yíng)養(yǎng)學(xué)研究● 畜牧與農(nóng)林業(yè)研究● 環(huán)境毒理研究
案例分析
文章標(biāo)題：缺氧通過(guò)改變腸道微生物群誘導(dǎo)骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞衰老
研究對(duì)象：骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞
期刊：Nat Commun
影響因子：12.353
時(shí)間：2018年
01.研究背景
全身性慢性缺氧是一種與全身供氧供應(yīng)不足相關(guān)的病理狀態(tài)。骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞主要位于骨髓(BM)的血管周?chē)鷧^(qū)。氧是骨髓生態(tài)位的關(guān)鍵組成部分，骨髓中的缺氧環(huán)境通常被認(rèn)為是維持干細(xì)胞正常生理功能和自我更新所必需的。然而，全身缺氧患者的BM缺氧狀態(tài)可能加重。同時(shí)，微生物群和緊鄰腸道腔的高血管化的腸道黏膜都對(duì)慢性缺氧敏感。慢性深度缺氧可改變腸道微生物群的多樣性，導(dǎo)致腸道微生物群衍生代謝物的積累，這可能會(huì)顯著影響宿主的穩(wěn)態(tài)。本研究以CCHD患者作為全身性慢性缺氧的人類(lèi)疾病模型，研究BM與腸道之間的關(guān)系。
02.研究結(jié)果
來(lái)自CCHD患者的骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞容易過(guò)早衰老，這可能是由于腸道生態(tài)失調(diào)和腸道微生物群來(lái)源的d-半乳糖的積累。補(bǔ)充乳酸菌可恢復(fù)具有防御性的骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞。我們的研究結(jié)果表明，口服補(bǔ)充乳酸菌可能會(huì)提高自體BMSC基再生治療的效率，并為改善CCHD患者的干細(xì)胞治療開(kāi)辟了可能性。
03.研究思路
04.結(jié)果展示
采用了基于氣相色譜飛行時(shí)間質(zhì)譜(GC-TOF/MS)的代謝組學(xué)方法來(lái)研究骨髓中代謝物的改變。在總離子電流分布中，鑒定出543個(gè)有效峰（圖A)。偏最小二乘判別分析(PLS-DA)和正交偏最小二乘判別分析(OPLS-DA)顯示了兩組之間的聚類(lèi)顯著分離(圖B,C,D)。
骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞的GC-MS非靶代謝組學(xué)分析
49種差異顯著代謝物的途徑分析