助力NIPT Plus規范化發展,創就無創產前檢測美好未來-產品資訊-資訊-生物在線

助力NIPT Plus規范化發展,創就無創產前檢測美好未來

作者:菁良科技(深圳)有限公司 2021-10-28T16:41 (訪問量:8875)

隨著精準醫學的發展和國家政策的推進,無創產前基因檢測(NIPT-Non Invasive Prenatal Testing)在臨床中應用越來越廣泛。


NIPT檢測技術僅需采取孕婦靜脈血,通過高通量測序及生物信息學分析,就可以推算出胎兒患21、18及13三體綜合征的風險。但是這三大三體綜合征合計只占足月期胎兒出生缺陷總數的4%,并不能滿足對出生缺陷的檢測要求。

NIPT Plus作為常規NIPT的升級產品,在不改變原有NIPT臨床流程,不增加采血量,不延長報告周期的前提下,通過建庫和算法等一系列加強,將檢測疾病種類由3種擴展到100多種,能檢測更多其他染色體數目異常以及染色體微缺失/微重復,可將出生缺陷的檢測范圍從4%提高至34%。

NIPT PLUS發展意義

目前相關研究表明,基因組水平的染色體微缺失/微重復在人群中的攜帶率可達1/270,孕婦群體中其胎兒攜帶具有臨床意義的致病性拷貝數變異(pCNV)比例可達1.6-%1.7%,遠高于三體綜合征0.2%的發病率。

pCNV是導致胎兒先天畸形、智力障礙等出生缺陷的重要遺傳原因之一,NIPT Plus技術自臨床應用以來,在pCNV的產前篩查上已積累了大量的臨床數據和應用經驗。

研究表明對于片段>6Mb的pCNV,NIPT-plus的篩查效率可達83%-90.9%;隨著檢測技術的進一步優化,如DiGeorge綜合征等3Mb左右的pCNV的PPV可達92.9%。

因此NIPT PLUS檢測可大幅提高胎兒嚴重遺傳病的檢出率,對于出生缺陷的防控有重大意義,在篩查胎兒基因組病方面已具備臨床應用的可行性。

NIPT PLUS相關共識/聲明

從臨床角度來看,在臨床前期實驗數據充分,各項關鍵指標明確的前提下,可以針對臨床意義明確、表型嚴重的pCNV進行NIPT PLUS篩查。
● 2016年美國醫學遺傳和基因組學學會(ACMG)發表聲明指出,醫生應在檢測前充分告知孕婦NIPT檢測范圍會擴大到CNVs,如果發現CNVs,應進行產前診斷。
● 2020年美國婦產科醫師學會委員會(ACOG)關于篩查胎兒染色體異常的臨床聲明中,雖然因臨床驗證數據的不充分而暫不推薦開展pCNV的篩查,但同時指出NIPT若發現pCNV應進行后續驗證。
● 2020年11月《基于孕婦外周血漿游離DNA高通量測序無創產前篩查胎兒基因組病技術規范》團體標準中擬確定了5種染色體疾病及10種pCNV疾病作為基于無創篩查胎兒基因組病的目標疾病。

NIPT PLUS現狀挑戰

CNV的檢測精度
NIPT用簡單的z-test方法就可以判斷,但plus檢測小片段的CNV就對精度有很大的要求,如胎兒濃度過低的影響、背景噪音都會對檢測結果造成很大的影響。

胎兒濃度的準確定量
NIPT檢測過程中,并不能區分母源和胎兒來源的游離DNA,一般來說胎兒游離DNA含量約4-20%左右,母源占比一般約為90%,因此母源因素可能會導致NIPT檢測結果的假陽性。

胎兒濃度是十分重要的信息,美國ACMG在2016年更新的NIPT聲明中,對胎兒濃度與NIPT檢測效力進行了專門闡述,建議NIPT檢測報告應包含明確的胎兒濃度信息。但是,對于胎兒濃度的準確定量一直是行業技術難題。這其中,男胎的胎兒濃度可以利用Y染色體進行分析得到,但是女胎的胎兒濃度定量卻沒有行之有效的辦法。

缺乏規范與標準
標準制定、合規性和試劑盒報批

菁良NIPT相關參考品

目前將NIPT Plus推廣至臨床一線篩查,亟需加強技術標準、臨床規范等支撐體系的建設。

菁良基因NIPT/NIPT+參考品包含常見染色體非整倍體、罕見常染色體或性染色體非整倍體及多種微重復/缺失的變異類型,可根據需求定制單種或多種變異類型混合的參考品,以監控NIPT試劑盒的樣本提取、文庫制備和上機測序的過程質控。

NIPT參考品套裝

? 產品形式為cfDNA血漿,模擬真實臨床樣本,可從提取步驟開始質控NIPT全流程
? 產品原料來自同一家系樣本,適用于全基因組和SNP方法學
? 產品覆蓋臨床常見染色體異常,CNV大小覆蓋2~8Mb,適用于NIPT流程的性能驗證
? 去除血漿本底cfDNA,通過控制片段化DNA的摻入設置胎兒比例

如以上套裝產品如無法滿足需求,菁良還可支持個性化定制

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