如今,腫瘤的發病率和死亡率居全球首位,除化療、放療和靶向治療外,免疫治療也成為其不容忽視的治療策略。越來越多的研究提示腫瘤突變負荷(tumor mutation burden, TMB)未來可能成為免疫治療的獨立預測生物標記物。
為了推動TMB這一生物標志物的研究,促進行業標準化規范化,菁良于2019年10月9日推出了全球首創TMB標準品,菁良首次發布不同平臺和方法測試數據結果,幫助您更好地了解TMB更多信息。
背景介紹
TMB的檢測過程會引入各種變量
TMB工作流:
TMB標準品制作流程:

菁良基因配對TMB標準品
菁良基因可以提供11對配對TMB樣本(過濾胚系突變),每對樣本對應不同TMB值(如下圖所示),根據這些配對的細胞系,我們也可以按照不同配比混合,提供不同AF及濃度的樣本。
TMB標準品在不同平臺的測試數據
測試一
我們隨機挑選了如下一對TMB標準品,選用了兩個測序平臺,對得到的體細胞變異結果進行比較:
配對TMB標準品在不同平臺,檢出體細胞突變重疊度達到90%
配對TMB標準品在不同平臺檢出體細胞突變,在一號染色體上,AF重疊度高
測試二
我們隨意挑選了11對TMB標準品,比較基于兩個不同測序平臺,WES和三個Panel的結果:
1.同一樣本,基于不同測序平臺得到的WES結果,其對應的TMB值比較接近。
2.同一樣本,不同Panel檢測的TMB值,偏差較大。
3.同一樣本,同種測序原理,WES與大Panel檢測得到的TMB值,有顯著差異。
盡管為節省測序成本,已有不同實驗室嘗試使用≥1 Mb的大Panel檢測TMB,但目前WES仍是檢測TMB的金標準。由于大panel覆蓋位點不盡相同,建議使用標準品將Panel與WES的檢測結果進行比較,來確定大panel檢測TMB的準確性。







